Homology-modelling HEXA/swissmodel 3LUT

From Bioinformatikpedia

Alignment between HEXA_HUMAN and 3HN3 chain A, which is the basis for the tertiary structure prediction.


3hn3A     22    glqggmlypq espsreckel dglwsfradf sdnrrrgfee qwyrrplwes
                                                                      
                                                       
3hn3A                           sssss  ssssssss       hhhhh        hh  


TARGET    1                     NDDQC LLLSETVWGA LRGLETFSQL VWKSAEGTFF
3hn3A     72    gptvdmpvps sfn--disqd wrlrhfvgwv wyerevilpe rwtqdlrtrv
                                                                      
TARGET                                 hh                   hhhh    ss
3hn3A              sssss s ss          hh    sss ssssss     hhhh    ss


TARGET    36    INK------- --TEIEDFPR FPH------- ---------- ----------
3hn3A     120   vlrigsahsy aivwvngvdt leheggylpf eadisnlvqv gsrlritiai
                                                                      
TARGET          s                                                     
3hn3A           sssss   ss ssssss sss sssss   ss sssshhhh      sssssss


TARGET    50    ---------- ---RGLLLDT SRHYLPLSSI LDTLDVMAYN KLNVFHWHLV
3hn3A     173   nntltpttlp pgtiqyltdt skypkgyfvq ntyfdffnya glqrsvllyt
                                                                      
TARGET                        ssss          ssss                    ss
3hn3A           ss           sssss          ssss s        s ss  ssssss


TARGET    87    DDPSFPYESF TFPELM-RKG SYNPVTHIYT AQDVKEVIEY A------RLR
3hn3A     223   tpttyiddit vttsveqdsg lvnyqisvkg snlfklevrl ldaenkvvan
                                                                      
TARGET          s   ssssss ssssss  ss sssssssss    ssssssss         ss
3hn3A           s   ssssss ssssss sss sssssssss    ssssssss ss   sssss


TARGET    130   GIRVLAEFDT PGHTLSWG-- -PGIPGLLTP CYSGSEPSGT FGPVNPSLNN
3hn3A     273   gtgtqgqlkv pgvslwwpyl mherpaylys levqltaqts lgpvsdfytl
                                                                      
TARGET          ssssssssss                    ss sssssssss   sssssssss
3hn3A           ssssssssss ss                 ss sssssssss   sssssssss 


TARGET    177   TYEFMSTFFL EVSSVF--PD FYLHLGGDEV ---------- ------DFTC
3hn3A     323   pvgirtvavt ksqflingkp fyfhgvnkhe dadirgkgfd wpllvkdfnl
                                                                      
TARGET          ss                                                    
3hn3A           ss   sssss   sssss ss s sssss               hhhhhhhhhh


TARGET    209   WKSNPEIQDF MRKKGFGEDF KQLESFYIQT LLDIVSSYGK GYVVWQEVFD
3hn3A     373   lrwlganafr tshypyaeev mqmcdrygiv videcpgvgl alpqffnnvs
                                                                      
TARGET                ssss s       hh hhhhhhh  s sssss             hhh
3hn3A           hhhh  ssss s       hh hhhhhhh  s sssss             hhh


TARGET    259   NKVKIQPDTI IQVWREDIPV NYMKELELVT KAGF--RALL SAPWYLNRIS
3hn3A     423   lhhhmqvmee vvrrdknhpa vvmwsvanep ashlesagyy lkmviahtks
                                                                      
TARGET          hhhhhhhhhh hhhh         ssss             hh hhhhhhhhhh
3hn3A           hhhhhhhhhh hhhh         ssss         hhhhhh hhhhhhhhhh


TARGET    307   YGPDWKDFYI VEP------- ---------- -----LAFEG TPEQKALVIG
3hn3A     473   ldpsrpvtfv snsnyaadkg apyvdvicln syyswyhdyg hleliqlqla
                                                                      
TARGET          h    sss                                      hhhhhhhh
3hn3A           h    sss            h hh    sss               hhhhhhhh


TARGET    335   GEACMWGEYV DNTNLVPRLW PRAGAVAERL WSNKLTSDLT FAYERLSHFR
3hn3A     523   tqfenwykky qkpiiqseyg aetiagfhqd pplmfteeyq kslleqyhlg
                                                                      
TARGET          hhhhhhhhh                              hhhh hhhhhhhhhh
3hn3A           hhhhhhhhh    sssss                     hhhh hhhhhhhhhh


TARGET    385   CELLRRGVQA QPLNVGFCEQ EFEQT ---- ---------- ----------
3hn3A     573   ldqkrrkyvv geliwnfadf mteqsptrvl gnkkgiftrq rqpksaafll
                                                                      
TARGET          hh                                                    
3hn3A           hh       s ssss                       sss    sss hhhhh


TARGET          ----------                                            
3hn3A     623   rerywkiane                                            
                                                                      
TARGET                                                                
3hn3A           hhhhhhhh   


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