Difference between revisions of "Homology Based Structure Predictions Hemochromatosis Alignments"

From Bioinformatikpedia
(1k5nA)
(1zs8A)
Line 54: Line 54:
   
 
=== 1zs8A ===
 
=== 1zs8A ===
  +
  +
  +
TARGET 1 SHSLHYLF MGASEQDLGL SLFEALGYVD DQLFVFYDHE SRRVEPRTPW
  +
1zs8A 1 shwlktfr ivimepgile prfiqvsyvd siqyqgfdsr sg-mqpraaw
  +
  +
TARGET sssssss ssss sssssssss ssssssss sss h
  +
1zs8A sssssss ssss sssssssss ssssssss sss h
  +
  +
  +
TARGET 49 VSSRISSQMW LQLSQSLKGW DHMFTVDFWT I-MENHNHSK ESHTLQVILG
  +
1zs8A 51 mkqe-ppeyw knetehamga sllarrtliy mvtennnkkn dyhtlqevfg
  +
  +
TARGET h hhh hhhhhhhhhh hhhhhhhhhh ssssssss
  +
1zs8A h hhh hhhhhhhhhh hhhhhhhhhh hhhhh ssssssss
  +
  +
  +
TARGET 98 CEMQEDNST- EGYWKYGYDG QDHLEFCPDT LDWRAAEPRA WPTKLEWERH
  +
1zs8A 100 cnvahdgsfl gghygltyyg ydyiilnedl nswttegkvg gkfnsvt---
  +
  +
TARGET ssss sss sssssssss ssssss sssss
  +
1zs8A ssss sss sssssssss ssssss sssss hh
  +
  +
  +
TARGET 147 KIRARQNRAY LERDCPAQLQ QLLELGRGVL DQQVPPLVKV THHVTSSVTT
  +
1zs8A 153 ----egwrty lkgecterfl rcldlgketl lrsdaprthv thk---vtvt
  +
  +
TARGET hhhhh hhhhhhhhhh hhhh hhh ssss sss ss
  +
1zs8A hhhhhh h hhhhhh hhh hhhh ssss sss ss
  +
  +
  +
TARGET 197 LRCRALNYYP QNITMKWLKD KQPMDAKEFE PKDVLPNGDG TYQGWITLAV
  +
1zs8A 200 lrcwalgfyp aditltwkrd gknht-qdme lpdtrpagdg tfqkwaavvv
  +
  +
TARGET sssssss sssssss sss ssssssssss
  +
1zs8A sssssss sssssss sss ssssssssss
  +
  +
  +
TARGET 247 PPGEEQRYTC QVEHPGLDQP LIVIWE
  +
1zs8A 249 pfgeelrytc hvhheglpgp ltlkwg-
  +
  +
TARGET ssss sss sss
  +
1zs8A ssss sss sss
   
 
<br style="clear:both;">
 
<br style="clear:both;">

Revision as of 11:15, 4 June 2012

Modeller


SwissModel


1k5nA

TARGET    1       RSHSLHYL FMGASEQDLG LSLFEALGYV DDQLFVFYDH ES--RRVEPR
1k5nA     1       gshsmryf htsvsrpgrg eprfitvgyv ddtlfvrfds daaspreepr
                                                                      
TARGET              ssssss sssss        ssssssss s ssssssss        sss
1k5nA               ssssss sssss        ssssssss s ssssssss        sss


TARGET    47    TPWVSSRISS QMWLQLSQSL KGWDHMFTVD FWTIMENHNH S-KESHTLQV
1k5nA     49    apwie-qegp eywdretqic kakaqtdred lrtllryynq seagshtlqn
                                                                      
TARGET            hhh      hhhhhhhhhh hhhhhhhhhh hhhhhhhh        sssss
1k5nA             hhh      hhhhhhhhhh hhhhhhhhhh hhhhhhhh        sssss


TARGET    96    ILGCEMQEDN S-TEGYWKYG YDGQDHLEFC PDTLDWRAAE PRAWPTKLEW
1k5nA     98    mygcdvgpdg rllrgyhqha ydgkdyialn edlsswtaad taaqitqrkw
                                                                      
TARGET          sssssss  s s ssssssss ss sssssss     sssss  hhhhhhhhhh
1k5nA           ssssss        sssssss ss sssssss     sssss  hhhhhhhhhh


TARGET    145   ERHKIRARQN RAYLERDCPA QLQQLLELGR GVLDQQVPPL VKVTHHV-TS
1k5nA     148   eaar-vaeql raylegecve wlrrylengk etlqradppk thvthhpisd
                                                                      
TARGET          hh     hhh hhhhhhhhhh hhhhhhhh            s ssssss    
1k5nA           h    hhhhh hhhhhhhhhh hhhhhhhh            s ssssssss  


TARGET    194   SVTTLRCRAL NYYPQNITMK WLKDKQPMDA KEFEPKDVLP NGDGTYQGWI
1k5nA     197   heatlrcwal gfypaeitlt wqrdgedqt- qdtelvetrp agdrtfqkwa
                                                                      
TARGET            ssssssss s      sss ssss sss      sss  ss s   ssssss
1k5nA           ssssssssss s      sss ssss sss      sss  ss s   ssssss


TARGET    244   TLAVPPGEEQ RYTCQVEHPG LDQPLIVIWE P                    
1k5nA     246   avvvpsgeeq rytchvqheg lpkpltlrwe p-                   
                                                                      
TARGET          ssss    hh sssssss        sss                         
1k5nA           ssssss  hh sssssss        sss                         


1zs8A

TARGET    1       SHSLHYLF MGASEQDLGL SLFEALGYVD DQLFVFYDHE SRRVEPRTPW
1zs8A     1       shwlktfr ivimepgile prfiqvsyvd siqyqgfdsr sg-mqpraaw
                                                                      
TARGET             sssssss ssss        sssssssss  ssssssss      sss  h
1zs8A              sssssss ssss        sssssssss  ssssssss      sss  h


TARGET    49    VSSRISSQMW LQLSQSLKGW DHMFTVDFWT I-MENHNHSK ESHTLQVILG
1zs8A     51    mkqe-ppeyw knetehamga sllarrtliy mvtennnkkn dyhtlqevfg
                                                                      
TARGET          h      hhh hhhhhhhhhh hhhhhhhhhh              ssssssss
1zs8A           h      hhh hhhhhhhhhh hhhhhhhhhh hhhhh        ssssssss


TARGET    98    CEMQEDNST- EGYWKYGYDG QDHLEFCPDT LDWRAAEPRA WPTKLEWERH
1zs8A     100   cnvahdgsfl gghygltyyg ydyiilnedl nswttegkvg gkfnsvt---
                                                                      
TARGET          ssss  sss  sssssssss   ssssss     sssss               
1zs8A           ssss   sss sssssssss   ssssss     sssss          hh   


TARGET    147   KIRARQNRAY LERDCPAQLQ QLLELGRGVL DQQVPPLVKV THHVTSSVTT
1zs8A     153   ----egwrty lkgecterfl rcldlgketl lrsdaprthv thk---vtvt
                                                                      
TARGET               hhhhh hhhhhhhhhh hhhh   hhh       ssss sss     ss
1zs8A               hhhhhh h   hhhhhh hhh   hhhh       ssss sss     ss


TARGET    197   LRCRALNYYP QNITMKWLKD KQPMDAKEFE PKDVLPNGDG TYQGWITLAV
1zs8A     200   lrcwalgfyp aditltwkrd gknht-qdme lpdtrpagdg tfqkwaavvv
                                                                      
TARGET          sssssss       sssssss                sss    ssssssssss
1zs8A           sssssss       sssssss                sss    ssssssssss


TARGET    247   PPGEEQRYTC QVEHPGLDQP LIVIWE                          
1zs8A     249   pfgeelrytc hvhheglpgp ltlkwg-                         
                                                                      
TARGET                ssss sss        sss                             
1zs8A                 ssss sss        sss                             


2iadB


3dbxA