Difference between revisions of "Homology Based Structure Predictions Hemochromatosis Alignments"

From Bioinformatikpedia
(1zs8A)
(2iadB)
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=== 2iadB ===
 
=== 2iadB ===
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TARGET 1 HSKESHT LQVILGCEMQ EDN-STEGYW KYGYDGQDHL
  +
2iadB 2 ghatqgvtaa s--sherhfv vqfkgecyyt ngtqrirlvt ryiynreeyv
  +
  +
TARGET sssssssss ssssss ssss ssss
  +
2iadB s ssssssssss ssssss sssss ssss
  +
  +
  +
TARGET 37 EFCPDTLDWR AAEPRAWPTK LEWERHKIRA RQNRAYLERD CPAQLQQLLE
  +
2iadB 39 rydsdvgeyr avtelgrpda eywnsqpeil ertraevdta crhnyegp--
  +
  +
TARGET ssss s ss hhhh hhhh hhh hhhhhhhhhh hhh
  +
2iadB ssss s ss hhh hhhh hhh hhhhhhhhhh hhhhhh
  +
  +
  +
TARGET 87 LGRGVLDQQV PPLVKVTHHV TSS---VTTL RCRALNYYPQ NITMKWLKDK
  +
2iadB 87 etstslrrle qpnvaislsr tealnhhntl vcsvtdfypa kikvrwfrng
  +
  +
TARGET sssssss sss ssssss sssssss
  +
2iadB sssssss sss ssssss sssssss
  +
  +
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TARGET 134 QPMDAKEFEP KDVLPNGDGT YQGWITLAVP PGEEQRYTCQ VEHPGLDQPL
  +
2iadB 136 qee-tvgvss tqlirngdwt fqvlvmlemt phqgevytch vehpslkspi
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TARGET sss ssss s sss s sssssssss sssss ss s
  +
2iadB sss ssss s sss s sssssssss sssss ss s
  +
  +
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TARGET 184 IVIWEP
  +
2iadB 185 tvewss-
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TARGET ssss
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2iadB ssss
   
 
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Revision as of 11:16, 4 June 2012

Modeller


SwissModel


1k5nA

TARGET    1       RSHSLHYL FMGASEQDLG LSLFEALGYV DDQLFVFYDH ES--RRVEPR
1k5nA     1       gshsmryf htsvsrpgrg eprfitvgyv ddtlfvrfds daaspreepr
                                                                      
TARGET              ssssss sssss        ssssssss s ssssssss        sss
1k5nA               ssssss sssss        ssssssss s ssssssss        sss


TARGET    47    TPWVSSRISS QMWLQLSQSL KGWDHMFTVD FWTIMENHNH S-KESHTLQV
1k5nA     49    apwie-qegp eywdretqic kakaqtdred lrtllryynq seagshtlqn
                                                                      
TARGET            hhh      hhhhhhhhhh hhhhhhhhhh hhhhhhhh        sssss
1k5nA             hhh      hhhhhhhhhh hhhhhhhhhh hhhhhhhh        sssss


TARGET    96    ILGCEMQEDN S-TEGYWKYG YDGQDHLEFC PDTLDWRAAE PRAWPTKLEW
1k5nA     98    mygcdvgpdg rllrgyhqha ydgkdyialn edlsswtaad taaqitqrkw
                                                                      
TARGET          sssssss  s s ssssssss ss sssssss     sssss  hhhhhhhhhh
1k5nA           ssssss        sssssss ss sssssss     sssss  hhhhhhhhhh


TARGET    145   ERHKIRARQN RAYLERDCPA QLQQLLELGR GVLDQQVPPL VKVTHHV-TS
1k5nA     148   eaar-vaeql raylegecve wlrrylengk etlqradppk thvthhpisd
                                                                      
TARGET          hh     hhh hhhhhhhhhh hhhhhhhh            s ssssss    
1k5nA           h    hhhhh hhhhhhhhhh hhhhhhhh            s ssssssss  


TARGET    194   SVTTLRCRAL NYYPQNITMK WLKDKQPMDA KEFEPKDVLP NGDGTYQGWI
1k5nA     197   heatlrcwal gfypaeitlt wqrdgedqt- qdtelvetrp agdrtfqkwa
                                                                      
TARGET            ssssssss s      sss ssss sss      sss  ss s   ssssss
1k5nA           ssssssssss s      sss ssss sss      sss  ss s   ssssss


TARGET    244   TLAVPPGEEQ RYTCQVEHPG LDQPLIVIWE P                    
1k5nA     246   avvvpsgeeq rytchvqheg lpkpltlrwe p-                   
                                                                      
TARGET          ssss    hh sssssss        sss                         
1k5nA           ssssss  hh sssssss        sss                         


1zs8A

TARGET    1       SHSLHYLF MGASEQDLGL SLFEALGYVD DQLFVFYDHE SRRVEPRTPW
1zs8A     1       shwlktfr ivimepgile prfiqvsyvd siqyqgfdsr sg-mqpraaw
                                                                      
TARGET             sssssss ssss        sssssssss  ssssssss      sss  h
1zs8A              sssssss ssss        sssssssss  ssssssss      sss  h


TARGET    49    VSSRISSQMW LQLSQSLKGW DHMFTVDFWT I-MENHNHSK ESHTLQVILG
1zs8A     51    mkqe-ppeyw knetehamga sllarrtliy mvtennnkkn dyhtlqevfg
                                                                      
TARGET          h      hhh hhhhhhhhhh hhhhhhhhhh              ssssssss
1zs8A           h      hhh hhhhhhhhhh hhhhhhhhhh hhhhh        ssssssss


TARGET    98    CEMQEDNST- EGYWKYGYDG QDHLEFCPDT LDWRAAEPRA WPTKLEWERH
1zs8A     100   cnvahdgsfl gghygltyyg ydyiilnedl nswttegkvg gkfnsvt---
                                                                      
TARGET          ssss  sss  sssssssss   ssssss     sssss               
1zs8A           ssss   sss sssssssss   ssssss     sssss          hh   


TARGET    147   KIRARQNRAY LERDCPAQLQ QLLELGRGVL DQQVPPLVKV THHVTSSVTT
1zs8A     153   ----egwrty lkgecterfl rcldlgketl lrsdaprthv thk---vtvt
                                                                      
TARGET               hhhhh hhhhhhhhhh hhhh   hhh       ssss sss     ss
1zs8A               hhhhhh h   hhhhhh hhh   hhhh       ssss sss     ss


TARGET    197   LRCRALNYYP QNITMKWLKD KQPMDAKEFE PKDVLPNGDG TYQGWITLAV
1zs8A     200   lrcwalgfyp aditltwkrd gknht-qdme lpdtrpagdg tfqkwaavvv
                                                                      
TARGET          sssssss       sssssss                sss    ssssssssss
1zs8A           sssssss       sssssss                sss    ssssssssss


TARGET    247   PPGEEQRYTC QVEHPGLDQP LIVIWE                          
1zs8A     249   pfgeelrytc hvhheglpgp ltlkwg-                         
                                                                      
TARGET                ssss sss        sss                             
1zs8A                 ssss sss        sss                             


2iadB

TARGET    1                   HSKESHT LQVILGCEMQ EDN-STEGYW KYGYDGQDHL
2iadB     2     ghatqgvtaa s--sherhfv vqfkgecyyt ngtqrirlvt ryiynreeyv
                                                                      
TARGET                                 sssssssss     ssssss ssss  ssss
2iadB                               s ssssssssss     ssssss sssss ssss


TARGET    37    EFCPDTLDWR AAEPRAWPTK LEWERHKIRA RQNRAYLERD CPAQLQQLLE
2iadB     39    rydsdvgeyr avtelgrpda eywnsqpeil ertraevdta crhnyegp--
                                                                      
TARGET          ssss     s ss    hhhh hhhh   hhh hhhhhhhhhh    hhh    
2iadB           ssss     s ss     hhh hhhh   hhh hhhhhhhhhh hhhhhh    


TARGET    87    LGRGVLDQQV PPLVKVTHHV TSS---VTTL RCRALNYYPQ NITMKWLKDK
2iadB     87    etstslrrle qpnvaislsr tealnhhntl vcsvtdfypa kikvrwfrng
                                                                      
TARGET                       sssssss         sss ssssss       sssssss 
2iadB                        sssssss         sss ssssss       sssssss 


TARGET    134   QPMDAKEFEP KDVLPNGDGT YQGWITLAVP PGEEQRYTCQ VEHPGLDQPL
2iadB     136   qee-tvgvss tqlirngdwt fqvlvmlemt phqgevytch vehpslkspi
                                                                      
TARGET          sss   ssss s  sss   s sssssssss       sssss ss       s
2iadB           sss   ssss s  sss   s sssssssss       sssss ss       s


TARGET    184   IVIWEP                                                
2iadB     185   tvewss-                                               
                                                                      
TARGET          ssss                                                  
2iadB           ssss                                                  


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