ASPA Sequence Based Predictions
From Bioinformatikpedia
Contents
Prediction of Secondary Structure Elements
PsiPred
# PSIPRED HFORMAT (PSIPRED V3.0) Conf: 987522213466199993246776008999999984450000587389976339987971 Pred: CCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHH AA: MTSCHIAEEHIQKVAIFGGTHGNELTGVFLVKHWLENGAEIQRTGLEVKPFITNPRAVKK 10 20 30 40 50 60 Conf: 998788998878786647999999984999999999988199999997428994187898 Pred: CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCC AA: CTRYIDCDLNRIFDLENLGKKMSEDLPYEVRRAQEINHLFGPKDSEDSYDIIFDLHNTTS 70 80 90 100 110 120 Conf: 999505864599448999999998762999737862048886301220027861499667 Pred: CCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHCCCCCCEEEEEC AA: NMGCTLILEDSRNNFLIQMFHYIKTSLAPLPCYVYLIEHPSLKYATTRSIAKYPVGIEVG 130 140 150 160 170 180 Conf: 877898808999999999999998976406998899973479998113515579877700 Pred: CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCE AA: PQPQGVLRADILDQMRKMIKHALDFIHHFNEGKEFPPCAIEVYKIIEKVDYPRDENGEIA 190 200 210 220 230 240 Conf: 552467669998546888832213699778518622057770372000011102000100 Pred: EEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEECCCCHHCCCCHHHEECCE AA: AIIHPNLQDQDWKPLHPGDPMFLTLDGKTIPLGGDCTVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTK 250 260 270 280 290 300 Conf: 3544256113309 Pred: EEEEECCCEEECC AA: LTLNAKSIRCCLH 310
JPred3
MTSCHIAEEHIQKVAIFGGTHGNELTGVFLVKHWLENGAEIQRTGLEVKPFITNPRAVKKCTRYID ------------EEEEEEEE------HHHHHHHHHH---------EEEEEEEE-HHHHHH-----H CDLNRIFDLENLGKKMSEDLPYEVRRAQEINHLFGPKDSEDSYDIIFDLHNTTSNMGCTLILEDSR ---------------------HHHHHHHHHHHHHH-------EEEEEE-----------EEEE--- NNFLIQMFHYIKTSLAPLPCYVYLIEHPSLKYATTRSIAKYPVGIEVGPQPQGVLRADILDQMRKM -HHHHHHHHHHHH------EEEEEE---------HHEE----EEEEE---------HHHHHHHHHH IKHALDFIHHFNEGKEFPPCAIEVYKIIEKVDYPRDENGEIAAIIHPNLQDQDWKPLHPGDPMFLT HHHHHHHHHHH----------EEEEEEEEEE----------EEEE----------------HHE-- LDGKTIPLGGDCTVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLNAKSIRCCLH ----EEEE----EEEEEEE-----HHH-HHHHHHHHEEE-----EEEE-
DSSP
10 20 30 40 50 60 | | | | | | 1 - 60 EHIQKVAIFGGTHGNELTGVFLVKHWLENGAEIQRTGLEVKPFITNPRAVKKCTRYIDCD 1 - 60 SSSSSS TTTT HHHHHHHHHHTT 333 TT SSSSSST HHHHHTTTT TTT 1 - 60 1 - 60 AA AA A AA AAA AA AAAA A A AA AAAA AAAA 70 80 90 100 110 120 | | | | | | 61 - 120 LNRIFDLENLGKKMSEDLPYEVRRAQEINHLFGPKDSEDSYDIIFDLHNTTSNMGCTLIL 61 - 120 333 THHHHTT TTT HHHHHHHHHHHHH TTTTTT TSSSSSSS TTT SSSSSS 61 - 120 ** * * ** ** * * 61 - 120 A AAA AAAAAAAAA A A AA AAA AA A 130 140 150 160 170 180 | | | | | | 121 - 180 EDSRNNFLIQMFHYIKTSLAPLPCYVYLIEHPSLKYATTRSIAKYPVGIEVGPQPQGVLR 121 - 180 T TT HHHHHHHHHHHHHHTTT SSSSS TT 3333TTSSSSSSSST TT 121 - 180 * ** ** 121 - 180 A A A AA AAA AAAA A AAAAAA AA A A A 190 200 210 220 230 240 | | | | | | 181 - 240 ADILDQMRKMIKHALDFIHHFNEGKEFPPCAIEVYKIIEKVDYPRDENGEIAAIIHPNLQ 181 - 240 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSSSSSSSSSSS TTT TSS TTTT 181 - 240 181 - 240 A AA AA AA AA AAAA AA A A A AAA A AAAAA A AA 250 260 270 280 290 300 | | | | | | 241 - 300 DQDWKPLHPGDPMFLTLDGKTIPLGGDCTVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLNAKSI 241 - 300 T TTT TTTSSSS TT SSS TTT SSSTTT 333TTTT TSSSSSSSSSSS 241 - 300 241 - 300 AA AA AAAAA A AAAAAA AAAAA A AAA A AAA A A 301 - 302 RC 301 - 302 301 - 302 301 - 302 AA 310 320 330 340 350 360 | | | | | | 303 - 362 EHIQKVAIFGGTHGNELTGVFLVKHWLENGAEIQRTGLEVKPFITNPRAVKKCTRYIDCD 303 - 362 SSSSSS TTTT HHHHHHHHHHHH 3333 TT SSSSSST HHHHHTT T TTT 303 - 362 303 - 362 AA AA AA AAA AA AAAA A A A AA AAAA AAAA 370 380 390 400 410 420 | | | | | | 363 - 422 LNRIFDLENLGKKMSEDLPYEVRRAQEINHLFGPKDSEDSYDIIFDLHNTTSNMGCTLIL 363 - 422 333 THHHHTT TTT HHHHHHHHHHHHH TTTTTT TSSSSSSS TTT SSSSSS 363 - 422 ** *** * ** **** 363 - 422 A AAA AAAAAAAAA A A AA AAA AA A 430 440 450 460 470 480 | | | | | | 423 - 482 EDSRNNFLIQMFHYIKTSLAPLPCYVYLIEHPSLKYATTRSIAKYPVGIEVGPQPQGVLR 423 - 482 T TT HHHHHHHHHHHHHHTTT SSSSS TTTT 3333TTSSSSSSSS TT 423 - 482 423 - 482 A A A AA AA AAAA A AAAAAA AA A A 490 500 510 520 530 540 | | | | | | 483 - 542 ADILDQMRKMIKHALDFIHHFNEGKEFPPCAIEVYKIIEKVDYPRDENGEIAAIIHPNLQ 483 - 542 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT SSSSSSSSSSSS TTT TSS TTTT 483 - 542 *** * 483 - 542 A AA AA A AA A AA AA A A A AAA A AAAAA A A AA 550 560 570 580 590 600 | | | | | | 543 - 602 DQDWKPLHPGDPMFLTLDGKTIPLGGDCTVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLNAKSI 543 - 602 T TTT TTTSSSS TT SSS TTT SSSTTT THHHHTT TSSSSSSSSSSS 543 - 602 * 543 - 602 AA AA AAAAA A AAAAAA AAAAA A AAA A AAAA A AA 603 - 604 RC 603 - 604 603 - 604 603 - 604 AA
Clearly solvent accessible: A; involved in symmetry contacts: *
pdb id: 2o53
Prediction of disordered regions
DISOPRED
DISOPRED predictions for a false positive rate threshold of: 2% conf: 999999999877640000000000000000000000000000000000000000000000 pred: **********.................................................. AA: MTSCHIAEEHIQKVAIFGGTHGNELTGVFLVKHWLENGAEIQRTGLEVKPFITNPRAVKK 10 20 30 40 50 60 conf: 000000000000000356777788777654200000000000000000000000000000 pred: ......................**.................................... AA: CTRYIDCDLNRIFDLENLGKKMSEDLPYEVRRAQEINHLFGPKDSEDSYDIIFDLHNTTS 70 80 90 100 110 120 conf: 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 pred: ............................................................ AA: NMGCTLILEDSRNNFLIQMFHYIKTSLAPLPCYVYLIEHPSLKYATTRSIAKYPVGIEVG 130 140 150 160 170 180 conf: 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 pred: ............................................................ AA: PQPQGVLRADILDQMRKMIKHALDFIHHFNEGKEFPPCAIEVYKIIEKVDYPRDENGEIA 190 200 210 220 230 240 conf: 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 pred: ............................................................ AA: AIIHPNLQDQDWKPLHPGDPMFLTLDGKTIPLGGDCTVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTK 250 260 270 280 290 300 conf: 0000000000002 pred: ............. AA: LTLNAKSIRCCLH 310 Asterisks (*) represent disorder predictions and dots (.) prediction of order. The confidence estimates give a rough indication of the probability that each residue is disordered.
POODLE
POS 1 M T S C H I A E E H I -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.461 0.444 0.413 0.401 0.418 0.461 0.537 0.644 0.693 0.62 0.468 POS 12 Q K V A I F G G T H G -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.321 0.238 0.177 0.146 0.128 0.116 0.106 0.104 0.111 0.126 0.132 POS 23 N E L T G V F L V K H -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.131 0.118 0.098 0.073 0.053 0.041 0.036 0.035 0.035 0.036 0.036 POS 34 W L E N G A E I Q R T -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.038 0.045 0.06 0.081 0.099 0.119 0.133 0.146 0.147 0.143 0.129 POS 45 G L E V K P F I T N P -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.111 0.09 0.073 0.062 0.054 0.047 0.039 0.033 0.033 0.037 0.041 POS 56 R A V K K C T R Y I D -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.043 0.047 0.054 0.062 0.068 0.071 0.073 0.07 0.067 0.069 0.075 POS 67 C D L N R I F D L E N -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.08 0.081 0.078 0.075 0.073 0.072 0.076 0.094 0.127 0.176 0.249 POS 78 L G K K M S E D L P Y -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.403 0.554 0.737 0.766 0.804 0.755 0.682 0.65 0.632 0.636 0.583 POS 89 E V R R A Q E I N H L -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.505 0.448 0.348 0.262 0.201 0.16 0.131 0.11 0.103 0.104 0.111 POS 100 F G P K D S E D S Y -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.116 0.117 0.108 0.089 0.067 0.049 0.039 0.034 0.033 0.035 POS 110 D I I F D L H N T T -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.038 0.041 0.043 0.043 0.042 0.041 0.042 0.045 0.052 0.06 POS 120 S N M G C T L I L E -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.07 0.081 0.092 0.101 0.109 0.111 0.107 0.096 0.085 0.072 POS 130 D S R N N F L I Q M -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.06 0.051 0.046 0.04 0.036 0.033 0.032 0.031 0.031 0.031 POS 140 F H Y I K T S L A P -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.033 0.036 0.04 0.043 0.046 0.049 0.05 0.053 0.055 0.059 POS 150 L P C Y V Y L I E H -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.065 0.073 0.088 0.103 0.115 0.119 0.118 0.111 0.104 0.104 POS 160 P S L K Y A T T R S -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.121 0.147 0.19 0.229 0.264 0.263 0.245 0.196 0.149 0.098 POS 170 I A K Y P V G I E V -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.069 0.053 0.051 0.057 0.066 0.08 0.093 0.102 0.103 0.099 POS 180 G P Q P Q G V L R A -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.096 0.094 0.095 0.095 0.099 0.098 0.099 0.095 0.094 0.086 POS 190 D I L D Q M R K M I -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.074 0.059 0.048 0.04 0.038 0.038 0.038 0.039 0.04 0.043 POS 200 K H A L D F I H H F -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.046 0.049 0.051 0.052 0.056 0.064 0.077 0.092 0.112 0.142 POS 210 N E G K E F P P C A -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.17 0.198 0.21 0.311 0.281 0.248 0.105 0.084 0.072 0.071 POS 220 I E V Y K I I E K V -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.069 0.065 0.06 0.056 0.052 0.054 0.062 0.076 0.105 0.141 POS 230 D Y P R D E N G E I -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.176 0.203 0.224 0.227 0.217 0.209 0.228 0.248 0.271 0.282 POS 240 A A I I H P N L Q D -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.289 0.269 0.24 0.208 0.188 0.169 0.155 0.152 0.167 0.193 POS 250 Q D W K P L H P G D -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.222 0.236 0.235 0.21 0.175 0.136 0.11 0.097 0.099 0.104 POS 260 P M F L T L D G K T -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.107 0.108 0.104 0.095 0.084 0.077 0.073 0.082 0.102 0.125 POS 270 I P L G G D C T V Y -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.144 0.162 0.169 0.166 0.156 0.149 0.133 0.117 0.099 0.089 POS 280 P V F V N E A A Y Y -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.077 0.072 0.067 0.064 0.066 0.082 0.122 0.184 0.241 0.279 POS 290 E K K E A F A K T T -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.282 0.264 0.236 0.229 0.238 0.257 0.263 0.252 0.231 0.222 POS 300 K L T L N A K S I R -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0.246 0.278 0.305 0.31 0.303 0.277 0.263 0.371 0.382 0.38
IUPRED
...
Meta-Disorder
Number Residue NORSnet NORS2st PROFbval bval2st Ucon Ucon2st MD_raw MD_rel MD2st 1 M 0.33 - 0.99 D 0.17 - 0.551 1 D 2 T 0.26 - 0.78 D 0.25 - 0.531 0 D 3 S 0.16 - 0.72 D 0.35 - 0.535 0 D 4 C 0.23 - 0.65 D 0.33 - 0.505 0 - 5 H 0.20 - 0.48 D 0.25 - 0.475 1 - 6 I 0.16 - 0.55 D 0.30 - 0.465 1 - 7 A 0.34 - 0.56 D 0.40 - 0.444 2 - 8 E 0.28 - 0.67 D 0.30 - 0.424 3 - 9 E 0.21 - 0.73 D 0.38 - 0.404 3 - 10 H 0.15 - 0.70 D 0.30 - 0.374 4 - 11 I 0.15 - 0.59 D 0.29 - 0.354 5 - 12 Q 0.15 - 0.60 D 0.28 - 0.313 6 - 13 K 0.14 - 0.51 D 0.23 - 0.263 8 - 14 V 0.14 - 0.30 - 0.19 - 0.253 8 - 15 A 0.16 - 0.24 - 0.19 - 0.250 9 - 16 I 0.13 - 0.20 - 0.24 - 0.242 9 - 17 F 0.10 - 0.13 - 0.23 - 0.250 9 - 18 G 0.13 - 0.18 - 0.21 - 0.242 9 - 19 G 0.10 - 0.24 - 0.20 - 0.253 8 - 20 T 0.07 - 0.34 - 0.20 - 0.253 8 - 21 H 0.06 - 0.26 - 0.26 - 0.260 8 - 22 G 0.06 - 0.39 - 0.29 - 0.253 8 - 23 N 0.06 - 0.48 D 0.22 - 0.250 9 - 24 E 0.06 - 0.47 D 0.18 - 0.242 9 - 25 L 0.11 - 0.43 - 0.16 - 0.242 9 - 26 T 0.12 - 0.39 - 0.20 - 0.253 8 - 27 G 0.10 - 0.32 - 0.20 - 0.242 9 - 28 V 0.08 - 0.28 - 0.15 - 0.242 9 - 29 F 0.12 - 0.35 - 0.13 - 0.242 9 - 30 L 0.14 - 0.28 - 0.15 - 0.242 9 - 31 V 0.09 - 0.30 - 0.16 - 0.253 8 - 32 K 0.07 - 0.40 - 0.16 - 0.263 8 - 33 H 0.06 - 0.40 - 0.18 - 0.293 7 - 34 W 0.08 - 0.38 - 0.29 - 0.273 8 - 35 L 0.09 - 0.45 - 0.30 - 0.283 7 - 36 E 0.09 - 0.56 D 0.41 - 0.313 6 - 37 N 0.12 - 0.62 D 0.32 - 0.313 6 - 38 G 0.16 - 0.62 D 0.35 - 0.330 6 - 39 A 0.11 - 0.64 D 0.46 - 0.313 6 - 40 E 0.10 - 0.66 D 0.47 - 0.323 6 - 41 I 0.09 - 0.65 D 0.47 - 0.323 6 - 42 Q 0.10 - 0.64 D 0.36 - 0.293 7 - 43 R 0.09 - 0.61 D 0.50 - 0.273 8 - 44 T 0.08 - 0.61 D 0.56 - 0.273 8 - 45 G 0.08 - 0.53 D 0.34 - 0.263 8 - 46 L 0.09 - 0.43 - 0.35 - 0.260 8 - 47 E 0.10 - 0.33 - 0.32 - 0.253 8 - 48 V 0.07 - 0.23 - 0.32 - 0.250 9 - 49 K 0.06 - 0.17 - 0.34 - 0.253 8 - 50 P 0.08 - 0.18 - 0.37 - 0.263 8 - 51 F 0.08 - 0.17 - 0.49 - 0.273 8 - 52 I 0.07 - 0.21 - 0.33 - 0.273 8 - 53 T 0.06 - 0.28 - 0.53 - 0.303 7 - 54 N 0.07 - 0.28 - 0.53 - 0.303 7 - 55 P 0.09 - 0.36 - 0.37 - 0.313 6 - 56 R 0.08 - 0.41 - 0.51 - 0.313 6 - 57 A 0.10 - 0.40 - 0.66 D 0.280 7 - 58 V 0.13 - 0.40 - 0.51 - 0.263 8 - 59 K 0.16 - 0.48 D 0.37 - 0.263 8 - 60 K 0.19 - 0.47 D 0.40 - 0.263 8 - 61 C 0.18 - 0.47 D 0.29 - 0.253 8 - 62 T 0.16 - 0.55 D 0.35 - 0.263 8 - 63 R 0.18 - 0.51 D 0.31 - 0.253 8 - 64 Y 0.22 - 0.47 D 0.25 - 0.273 8 - 65 I 0.23 - 0.47 D 0.20 - 0.260 8 - 66 D 0.23 - 0.56 D 0.21 - 0.263 8 - 67 C 0.25 - 0.57 D 0.16 - 0.263 8 - 68 D 0.30 - 0.43 - 0.18 - 0.263 8 - 69 L 0.29 - 0.40 - 0.18 - 0.260 8 - 70 N 0.28 - 0.40 - 0.25 - 0.263 8 - 71 R 0.40 - 0.39 - 0.23 - 0.273 8 - 72 I 0.46 - 0.43 - 0.22 - 0.280 7 - 73 F 0.46 - 0.37 - 0.19 - 0.273 8 - 74 D 0.37 - 0.46 - 0.32 - 0.310 6 - 75 L 0.33 - 0.57 D 0.40 - 0.390 4 - 76 E 0.36 - 0.61 D 0.30 - 0.444 2 - 77 N 0.44 - 0.62 D 0.41 - 0.465 1 - 78 L 0.38 - 0.66 D 0.65 D 0.531 0 D 79 G 0.30 - 0.70 D 0.64 D 0.485 1 - 80 K 0.35 - 0.69 D 0.64 D 0.515 0 - 81 K 0.23 - 0.69 D 0.59 D 0.475 1 - 82 M 0.23 - 0.66 D 0.42 - 0.444 2 - 83 S 0.28 - 0.69 D 0.64 D 0.449 2 - 84 E 0.34 - 0.72 D 0.56 - 0.485 1 - 85 D 0.29 - 0.74 D 0.45 - 0.424 3 - 86 L 0.20 - 0.64 D 0.35 - 0.424 3 - 87 P 0.20 - 0.64 D 0.45 - 0.404 3 - 88 Y 0.17 - 0.55 D 0.46 - 0.384 4 - 89 E 0.14 - 0.50 D 0.46 - 0.364 5 - 90 V 0.13 - 0.45 - 0.30 - 0.333 6 - 91 R 0.12 - 0.43 - 0.43 - 0.320 6 - 92 R 0.11 - 0.40 - 0.36 - 0.293 7 - 93 A 0.11 - 0.34 - 0.36 - 0.283 7 - 94 Q 0.10 - 0.45 - 0.22 - 0.290 7 - 95 E 0.12 - 0.41 - 0.25 - 0.303 7 - 96 I 0.09 - 0.34 - 0.26 - 0.283 7 - 97 N 0.11 - 0.40 - 0.33 - 0.313 6 - 98 H 0.10 - 0.49 D 0.39 - 0.313 6 - 99 L 0.10 - 0.47 D 0.38 - 0.313 6 - 100 F 0.13 - 0.47 D 0.38 - 0.293 7 - 101 G 0.14 - 0.54 D 0.58 D 0.323 6 - 102 P 0.13 - 0.61 D 0.58 D 0.333 6 - 103 K 0.13 - 0.60 D 0.47 - 0.323 6 - 104 D 0.11 - 0.61 D 0.71 D 0.323 6 - 105 S 0.10 - 0.65 D 0.73 D 0.283 7 - 106 E 0.10 - 0.70 D 0.62 D 0.283 7 - 107 D 0.12 - 0.70 D 0.42 - 0.273 8 - 108 S 0.11 - 0.64 D 0.37 - 0.270 8 - 109 Y 0.12 - 0.50 D 0.23 - 0.253 8 - 110 D 0.13 - 0.39 - 0.20 - 0.242 9 - 111 I 0.16 - 0.29 - 0.18 - 0.240 9 - 112 I 0.15 - 0.20 - 0.16 - 0.240 9 - 113 F 0.14 - 0.20 - 0.16 - 0.240 9 - 114 D 0.17 - 0.21 - 0.20 - 0.242 9 - 115 L 0.21 - 0.20 - 0.19 - 0.253 8 - 116 H 0.17 - 0.28 - 0.19 - 0.273 8 - 117 N 0.11 - 0.48 D 0.23 - 0.283 7 - 118 T 0.13 - 0.39 - 0.24 - 0.283 7 - 119 T 0.13 - 0.41 - 0.21 - 0.273 8 - 120 S 0.15 - 0.46 - 0.21 - 0.273 8 - 121 N 0.22 - 0.54 D 0.18 - 0.263 8 - 122 M 0.25 - 0.51 D 0.14 - 0.260 8 - 123 G 0.30 - 0.51 D 0.16 - 0.253 8 - 124 C 0.26 - 0.42 - 0.18 - 0.250 9 - 125 T 0.29 - 0.40 - 0.18 - 0.242 9 - 126 L 0.24 - 0.34 - 0.18 - 0.253 8 - 127 I 0.17 - 0.28 - 0.23 - 0.260 8 - 128 L 0.13 - 0.28 - 0.25 - 0.263 8 - 129 E 0.14 - 0.41 - 0.24 - 0.253 8 - 130 D 0.14 - 0.54 D 0.18 - 0.253 8 - 131 S 0.10 - 0.59 D 0.19 - 0.273 8 - 132 R 0.07 - 0.68 D 0.27 - 0.280 7 - 133 N 0.05 - 0.64 D 0.28 - 0.273 8 - 134 N 0.06 - 0.61 D 0.18 - 0.273 8 - 135 F 0.07 - 0.53 D 0.15 - 0.260 8 - 136 L 0.08 - 0.47 D 0.13 - 0.242 9 - 137 I 0.10 - 0.47 D 0.13 - 0.242 9 - 138 Q 0.16 - 0.42 - 0.13 - 0.242 9 - 139 M 0.15 - 0.34 - 0.13 - 0.242 9 - 140 F 0.11 - 0.32 - 0.14 - 0.250 9 - 141 H 0.13 - 0.41 - 0.14 - 0.263 8 - 142 Y 0.16 - 0.36 - 0.16 - 0.263 8 - 143 I 0.12 - 0.34 - 0.16 - 0.263 8 - 144 K 0.11 - 0.46 - 0.15 - 0.283 7 - 145 T 0.07 - 0.54 D 0.20 - 0.273 8 - 146 S 0.07 - 0.55 D 0.17 - 0.253 8 - 147 L 0.09 - 0.56 D 0.17 - 0.242 9 - 148 A 0.10 - 0.57 D 0.17 - 0.250 9 - 149 P 0.09 - 0.60 D 0.13 - 0.253 8 - 150 L 0.11 - 0.51 D 0.13 - 0.242 9 - 151 P 0.13 - 0.44 - 0.14 - 0.242 9 - 152 C 0.12 - 0.38 - 0.13 - 0.240 9 - 153 Y 0.13 - 0.31 - 0.13 - 0.240 9 - 154 V 0.18 - 0.28 - 0.13 - 0.242 9 - 155 Y 0.17 - 0.33 - 0.14 - 0.250 9 - 156 L 0.21 - 0.47 D 0.13 - 0.253 8 - 157 I 0.22 - 0.54 D 0.15 - 0.263 8 - 158 E 0.17 - 0.58 D 0.15 - 0.283 7 - 159 H 0.16 - 0.62 D 0.17 - 0.303 7 - 160 P 0.13 - 0.65 D 0.21 - 0.323 6 - 161 S 0.14 - 0.59 D 0.29 - 0.303 7 - 162 L 0.17 - 0.58 D 0.41 - 0.303 7 - 163 K 0.21 - 0.56 D 0.36 - 0.293 7 - 164 Y 0.32 - 0.51 D 0.29 - 0.273 8 - 165 A 0.31 - 0.47 D 0.26 - 0.273 8 - 166 T 0.28 - 0.45 - 0.32 - 0.273 8 - 167 T 0.22 - 0.41 - 0.33 - 0.273 8 - 168 R 0.15 - 0.47 D 0.26 - 0.273 8 - 169 S 0.14 - 0.47 D 0.28 - 0.280 7 - 170 I 0.12 - 0.46 - 0.29 - 0.273 8 - 171 A 0.12 - 0.47 D 0.22 - 0.283 7 - 172 K 0.11 - 0.58 D 0.27 - 0.290 7 - 173 Y 0.13 - 0.47 D 0.20 - 0.263 8 - 174 P 0.11 - 0.38 - 0.19 - 0.253 8 - 175 V 0.10 - 0.26 - 0.26 - 0.250 9 - 176 G 0.09 - 0.24 - 0.31 - 0.250 9 - 177 I 0.13 - 0.33 - 0.25 - 0.250 9 - 178 E 0.20 - 0.28 - 0.37 - 0.253 8 - 179 V 0.26 - 0.41 - 0.33 - 0.253 8 - 180 G 0.20 - 0.45 - 0.33 - 0.270 8 - 181 P 0.17 - 0.59 D 0.25 - 0.283 7 - 182 Q 0.12 - 0.49 D 0.35 - 0.283 7 - 183 P 0.12 - 0.51 D 0.28 - 0.273 8 - 184 Q 0.13 - 0.54 D 0.42 - 0.273 8 - 185 G 0.10 - 0.51 D 0.33 - 0.263 8 - 186 V 0.12 - 0.55 D 0.22 - 0.253 8 - 187 L 0.17 - 0.54 D 0.24 - 0.253 8 - 188 R 0.14 - 0.48 D 0.24 - 0.263 8 - 189 A 0.11 - 0.53 D 0.18 - 0.273 8 - 190 D 0.11 - 0.51 D 0.19 - 0.273 8 - 191 I 0.08 - 0.41 - 0.31 - 0.283 7 - 192 L 0.07 - 0.42 - 0.33 - 0.263 8 - 193 D 0.06 - 0.47 D 0.24 - 0.273 8 - 194 Q 0.08 - 0.45 - 0.33 - 0.270 8 - 195 M 0.04 - 0.34 - 0.26 - 0.263 8 - 196 R 0.04 - 0.43 - 0.34 - 0.273 8 - 197 K 0.05 - 0.44 - 0.34 - 0.263 8 - 198 M 0.06 - 0.29 - 0.34 - 0.263 8 - 199 I 0.06 - 0.28 - 0.22 - 0.253 8 - 200 K 0.07 - 0.34 - 0.22 - 0.263 8 - 201 H 0.07 - 0.32 - 0.20 - 0.253 8 - 202 A 0.08 - 0.28 - 0.15 - 0.250 9 - 203 L 0.08 - 0.35 - 0.15 - 0.253 8 - 204 D 0.09 - 0.43 - 0.19 - 0.263 8 - 205 F 0.11 - 0.41 - 0.18 - 0.263 8 - 206 I 0.12 - 0.45 - 0.18 - 0.253 8 - 207 H 0.15 - 0.59 D 0.23 - 0.270 8 - 208 H 0.18 - 0.59 D 0.40 - 0.290 7 - 209 F 0.22 - 0.58 D 0.24 - 0.283 7 - 210 N 0.27 - 0.63 D 0.37 - 0.293 7 - 211 E 0.27 - 0.66 D 0.53 - 0.313 6 - 212 G 0.28 - 0.68 D 0.44 - 0.313 6 - 213 K 0.26 - 0.70 D 0.46 - 0.323 6 - 214 E 0.26 - 0.71 D 0.50 - 0.323 6 - 215 F 0.20 - 0.70 D 0.56 - 0.303 7 - 216 P 0.21 - 0.69 D 0.37 - 0.293 7 - 217 P 0.24 - 0.69 D 0.28 - 0.280 7 - 218 C 0.14 - 0.66 D 0.28 - 0.263 8 - 219 A 0.14 - 0.58 D 0.19 - 0.263 8 - 220 I 0.15 - 0.52 D 0.19 - 0.263 8 - 221 E 0.11 - 0.47 D 0.22 - 0.270 8 - 222 V 0.11 - 0.34 - 0.26 - 0.273 8 - 223 Y 0.12 - 0.30 - 0.28 - 0.280 7 - 224 K 0.08 - 0.37 - 0.34 - 0.280 7 - 225 I 0.09 - 0.32 - 0.33 - 0.273 8 - 226 I 0.07 - 0.35 - 0.29 - 0.283 7 - 227 E 0.09 - 0.43 - 0.38 - 0.313 6 - 228 K 0.09 - 0.49 D 0.61 D 0.333 6 - 229 V 0.12 - 0.49 D 0.58 D 0.337 6 - 230 D 0.16 - 0.53 D 0.75 D 0.354 5 - 231 Y 0.14 - 0.52 D 0.84 D 0.343 5 - 232 P 0.12 - 0.57 D 0.84 D 0.313 6 - 233 R 0.13 - 0.66 D 0.59 D 0.303 7 - 234 D 0.15 - 0.69 D 0.70 D 0.310 6 - 235 E 0.10 - 0.71 D 0.59 D 0.293 7 - 236 N 0.12 - 0.71 D 0.62 D 0.303 7 - 237 G 0.17 - 0.67 D 0.44 - 0.293 7 - 238 E 0.22 - 0.60 D 0.40 - 0.283 7 - 239 I 0.17 - 0.53 D 0.36 - 0.270 8 - 240 A 0.16 - 0.38 - 0.30 - 0.260 8 - 241 A 0.19 - 0.29 - 0.22 - 0.253 8 - 242 I 0.16 - 0.28 - 0.24 - 0.263 8 - 243 I 0.22 - 0.33 - 0.24 - 0.263 8 - 244 H 0.25 - 0.34 - 0.34 - 0.293 7 - 245 P 0.14 - 0.48 D 0.41 - 0.323 6 - 246 N 0.16 - 0.53 D 0.30 - 0.343 5 - 247 L 0.16 - 0.58 D 0.53 - 0.343 5 - 248 Q 0.16 - 0.61 D 0.71 D 0.374 4 - 249 D 0.22 - 0.64 D 0.59 D 0.354 5 - 250 Q 0.30 - 0.64 D 0.51 - 0.364 5 - 251 D 0.34 - 0.62 D 0.52 - 0.333 6 - 252 W 0.33 - 0.52 D 0.65 D 0.313 6 - 253 K 0.22 - 0.58 D 0.68 D 0.283 7 - 254 P 0.21 - 0.58 D 0.63 D 0.283 7 - 255 L 0.18 - 0.54 D 0.45 - 0.263 8 - 256 H 0.16 - 0.68 D 0.27 - 0.263 8 - 257 P 0.18 - 0.69 D 0.28 - 0.273 8 - 258 G 0.19 - 0.57 D 0.21 - 0.270 8 - 259 D 0.28 - 0.54 D 0.16 - 0.290 7 - 260 P 0.25 - 0.54 D 0.23 - 0.270 8 - 261 M 0.19 - 0.40 - 0.24 - 0.273 8 - 262 F 0.16 - 0.34 - 0.29 - 0.253 8 - 263 L 0.13 - 0.37 - 0.30 - 0.253 8 - 264 T 0.10 - 0.46 - 0.20 - 0.242 9 - 265 L 0.14 - 0.56 D 0.20 - 0.253 8 - 266 D 0.13 - 0.61 D 0.20 - 0.263 8 - 267 G 0.11 - 0.62 D 0.26 - 0.280 7 - 268 K 0.10 - 0.60 D 0.34 - 0.283 7 - 269 T 0.10 - 0.60 D 0.40 - 0.273 8 - 270 I 0.08 - 0.46 - 0.41 - 0.250 9 - 271 P 0.07 - 0.43 - 0.35 - 0.250 9 - 272 L 0.12 - 0.46 - 0.29 - 0.242 9 - 273 G 0.10 - 0.53 D 0.18 - 0.242 9 - 274 G 0.08 - 0.52 D 0.19 - 0.250 9 - 275 D 0.05 - 0.62 D 0.19 - 0.253 8 - 276 C 0.06 - 0.68 D 0.15 - 0.263 8 - 277 T 0.10 - 0.59 D 0.16 - 0.263 8 - 278 V 0.08 - 0.52 D 0.17 - 0.263 8 - 279 Y 0.09 - 0.33 - 0.20 - 0.242 9 - 280 P 0.10 - 0.27 - 0.17 - 0.242 9 - 281 V 0.12 - 0.23 - 0.21 - 0.242 9 - 282 F 0.12 - 0.18 - 0.17 - 0.253 8 - 283 V 0.09 - 0.24 - 0.16 - 0.263 8 - 284 N 0.05 - 0.28 - 0.23 - 0.303 7 - 285 E 0.06 - 0.39 - 0.28 - 0.384 4 - 286 A 0.09 - 0.35 - 0.46 - 0.404 3 - 287 A 0.08 - 0.43 - 0.72 D 0.418 3 - 288 Y 0.08 - 0.37 - 0.79 D 0.374 4 - 289 Y 0.09 - 0.55 D 0.61 D 0.354 5 - 290 E 0.10 - 0.41 - 0.49 - 0.333 6 - 291 K 0.10 - 0.50 D 0.65 D 0.323 6 - 292 K 0.07 - 0.47 D 0.66 D 0.323 6 - 293 E 0.07 - 0.36 - 0.79 D 0.333 6 - 294 A 0.06 - 0.29 - 0.95 D 0.354 5 - 295 F 0.08 - 0.27 - 0.82 D 0.333 6 - 296 A 0.09 - 0.32 - 0.70 D 0.323 6 - 297 K 0.09 - 0.42 - 0.41 - 0.343 5 - 298 T 0.08 - 0.42 - 0.36 - 0.343 5 - 299 T 0.10 - 0.51 D 0.36 - 0.414 3 - 300 K 0.09 - 0.54 D 0.64 D 0.455 2 - 301 L 0.09 - 0.48 D 0.70 D 0.394 4 - 302 T 0.15 - 0.55 D 0.43 - 0.404 3 - 303 L 0.15 - 0.48 D 0.46 - 0.374 4 - 304 N 0.12 - 0.48 D 0.34 - 0.374 4 - 305 A 0.13 - 0.47 D 0.19 - 0.374 4 - 306 K 0.22 - 0.55 D 0.19 - 0.384 4 - 307 S 0.07 - 0.53 D 0.18 - 0.434 2 - 308 I 0.07 - 0.41 - 0.23 - 0.424 3 - 309 R 0.07 - 0.37 - 0.21 - 0.414 3 - 310 C 0.11 - 0.60 D 0.19 - 0.414 3 - 311 C 0.14 - 0.67 D 0.14 - 0.394 4 - 312 L 0.15 - 0.72 D 0.13 - 0.424 3 - 313 H 0.44 - 0.80 D 0.13 - 0.485 1 - Key for output ---------------- Number - residue number Residue - amino-acid type NORSnet - raw score by NORSnet (prediction of unstructured loops) NORS2st - two-state prediction by NORSnet; D=disordered PROFbval - raw score by PROFbval (prediction of residue flexibility from sequence) Bval2st - two-state prediction by PROFbval Ucon - raw score by Ucon (prediction of protein disorder using predicted internal contacts) Ucon2st - two-state prediction by Ucon MD - raw score by MD (prediction of protein disorder using orthogonal sources) MD_rel - reliability of the prediction by MD; values range from 0-9. 9=strong prediction MD2st - two-state prediction by MD
Prediction of transmembrane alpha-helices and signal peptides
TMHMM
...
Phobius & PolyPhobius
...
OCTOPUS & SPOCTOPUS
...
SignalP
...
TargetP
...
Prediction of GO terms
GOPET
...
Pfam
...
ProtFun 2.2
...