Sequence-based analyses Gaucher Disease

Secondary structure

Predictions

P04062:

          40
          ARPCIPKSFGYSSVVCVCNATYCDSFDPPTFPALGTFSRYESTRSGRRMELSMGPIQANHTGTGLLLTLQPEQKFQKVKG
Reprof    CCCCCCCCCCCEEEEEEECCEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEECCCEECCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEC
PSIPRED   CCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCEEEEE
DSSP      CECCCEEECCCCCEEEEEECCCCCECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEEECECCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCE

          120
          FGGAMTDAAALNILALSPPAQNLLLKSYFSEEGIGYNIIRVPMASCDFSIRTYTYADTPDDFQLHNFSLPEEDTKLKIPL
Reprof    CCCCCCHHHHHEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEE
PSIPRED   EEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
DSSP      EEEECCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHH

          200
          IHRALQLAQRPVSLLASPWTSPTWLKTNGAVNGKGSLKGQPGDIYHQTWARYFVKFLDAYAEHKLQFWAVTAENEPSAGL
Reprof    EEHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCEEEECCCECCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCCE
PSIPRED   HHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCC
DSSP      HHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHECCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCHHH

          280
          LSGYPFQCLGFTPEHQRDFIARDLGPTLANSTHHNVRLLMLDDQRLLLPHWAKVVLTDPEAAKYVHGIAVHWYLDFLAPA
Reprof    ECCCCEEEECCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEECCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEEEEECCCC
PSIPRED   CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCH
DSSP      CCCCCCCCCECCHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEHHHCCHHHHHHHCCHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCH

          360
          KATLGETHRLFPNTMLFASEACVGSKFWEQSVRLGSWDRGMQYSHSIITNLLYHVVGWTDWNLALNPEGGPNWVRNFVDS
Reprof    CCECCCCCECCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCEEECEHHHHEEEEEEECCCCEEEECCCCCCEEEEECCCC
PSIPRED   HHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCC
DSSP      HHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCECCCCCCCCCCCCCCC

          440
          PIIVDITKDTFYKQPMFYHLGHFSKFIPEGSQRVGLVASQKNDLDAVALMHPDGSAVVVVLNRSSKDVPLTIKDPAVGFL
Reprof    CEEEEECCCCCCCCCEEEECCCEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCEEEECCCCEEEE
PSIPRED   CEEEECCCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCEEE
DSSP      CEEEEHHHCEEEECHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCEEE

          520
          ETISPGYSIHTYLWRRQ
Reprof    EEECCCCEEEEEEEECC
PSIPRED   EEECCCCEEEEEEEECC
DSSP      EEEECCCEEEEEEECCC

P10775:

          1
          MNLDIHCEQLSDARWTELLPLLQQYEVVRLDDCGLTEEHCKDIGSALRANPSLTELCLRTNELGDAGVHLVLQGLQSPTC
Reprof    CCCCECHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHEEEHCCCCCCCC
PSIPRED   CEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCC
DSSP      CECCCECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEECECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC

          81
          KIQKLSLQNCSLTEAGCGVLPSTLRSLPTLRELHLSDNPLGDAGLRLLCEGLLDPQCHLEKLQLEYCRLTAASCEPLASV
Reprof    EEEEECCCCCCCCHCCCCCCHHHHCHCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
PSIPRED   CCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHH
DSSP      CCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHH

          161
          LRATRALKELTVSNNDIGEAGARVLGQGLADSACQLETLRLENCGLTPANCKDLCGIVASQASLRELDLGSNGLGDAGIA
Reprof    HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCHCCHHHCCCCCCCCCHHHHH
PSIPRED   HHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCHHHHH
DSSP      HHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHH

          241
          ELCPGLLSPASRLKTLWLWECDITASGCRDLCRVLQAKETLKELSLAGNKLGDEGARLLCESLLQPGCQLESLWVKSCSL
Reprof    HHCCCCCCCHHHHCHHEEEHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCHH
PSIPRED   HHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCC
DSSP      HHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCC

          321
          TAACCQHVSLMLTQNKHLLELQLSSNKLGDSGIQELCQALSQPGTTLRVLCLGDCEVTNSGCSSLASLLLANRSLRELDL
Reprof    HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHCC
PSIPRED   CHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEC
DSSP      EHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCECHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCEHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEC

          401
          SNNCVGDPGVLQLLGSLEQPGCALEQLVLYDTYWTEEVEDRLQALEGSKPGLRVIS
Reprof    CCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCECC
PSIPRED   CCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEECC
DSSP      CCCECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEC

Q9X0E6:

          2
          ILVYSTFPNEEKALEIGRKLLEKRLIACFNAFEIRSGYWWKGEIVQDKEWAAIFKTTEEKEKELYEELRKLHPYETPAIF
Reprof    EEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHCHHHCCCEEECEEECCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHE
PSIPRED   EEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
DSSP      EEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEECCEEEEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE

          82
          TLKVENVLTEYMNWLRESVL
Reprof    HHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PSIPRED   EEECCCCCHHHHHHHHHHCC
DSSP      EECCCCEEHHHHHHHHHHCC

Q08209:

          14
          TDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESVALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHG
Reprof    CCCEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEHHHECCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCC
PSIPRED   CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEECCCCC
DSSP      CCCCCCCCCCCCCCCECHHHHECCCCCECHHHHHHHHHCCCCECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEECCCCC

          94
          QFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSER
Reprof    HHHHHHEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEEEHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEEECH
PSIPRED   HHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHH
DSSP      CHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHCCHH

          174
          VYDACMDAFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTV
Reprof    HHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCECCCCCE
PSIPRED   HHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
DSSP      HHHHHHHHHCCCCCEEEECCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCEECCCCCCCCCCCCEEECCC

          254
          RGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQ
Reprof    CCEEEEECCCCEEEEHCCCCHHHHEHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCEEEEECCCEEEEEECCCEEEEEE
PSIPRED   CCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEE
DSSP      CCCCEEECHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCEEECCECCCCCCECEEEECCCCCHHHCCCCCEEEEEEECCEEEEEE

          334
          FNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSSFEEAKGLDRINERMPPR
Reprof    ECCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHEECCEHHHHCCCCHHCCCCCCC
PSIPRED   ECCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC
DSSP      ECCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC

Prediction accuracy/precision

<figtable id = "ss_acc">

Method	Q3	Precision H	Precision E	Precision C
Q08209
PSIPRED	0.8	0.3	0.1	0.2

</figtable>