PSSM of close homologous sequences
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Last position-specific scoring matrix computed, weighted observed per
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V 1 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 1 2 -1 5 0 -3 -2 -1 -1 -1 1 2 E -1 0 0 2 -4 2 5 -2 0 -3 -3 1 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 3 F -2 -3 -3 -4 -2 -3 -3 -3 -1 0 0 -3 0 6 -4 -2 -2 1 3 -1 4 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 5 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 6 P -1 -2 -2 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -3 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 7 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 8 R -1 6 0 -2 -3 1 0 -2 0 -3 -2 2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3 9 E -1 0 0 2 -4 2 5 -2 0 -3 -3 1 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 10 E -1 0 0 2 -4 2 5 -2 0 -3 -3 1 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 11 C 0 -3 -3 -4 9 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1 12 P -1 -2 -2 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -3 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 13 K -1 2 0 -1 -3 1 1 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 14 P -1 -2 -2 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -3 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 15 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 16 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 17 R -1 6 0 -2 -3 1 0 -2 0 -3 -2 2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3 18 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 1 -2 1 -1 -2 -2 0 -3 -1 4 19 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 20 I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 4 2 -3 1 0 -3 -2 -1 -3 -1 3 21 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 1 2 -1 5 0 -3 -2 -1 -1 -1 1 22 A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 23 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -3 -3 -3 24 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 25 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 26 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 5 -2 -2 0 27 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -3 -3 -3 28 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 29 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 30 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 31 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 32 Q -1 1 0 0 -3 5 2 -2 0 -3 -2 1 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2 33 A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 34 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 1 -2 1 -1 -2 -2 0 -3 -1 4 35 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 36 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -3 -2 -3 -2 -3 -1 1 -4 -3 -2 11 2 -3 37 A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 38 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 39 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -3 -3 -3 40 A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 41 R -1 6 0 -2 -3 1 0 -2 0 -3 -2 2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3 42 P -1 -2 -2 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -3 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 43 C 0 -3 -3 -4 9 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1 44 I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 4 2 -3 1 0 -3 -2 -1 -3 -1 3 45 P -1 -2 -2 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -3 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 46 K -1 2 0 -1 -3 1 1 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 47 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 48 F -2 -3 -3 -4 -2 -3 -3 -3 -1 0 0 -3 0 6 -4 -2 -2 1 3 -1 49 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -3 -3 -3 50 Y -2 -2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 2 -1 -1 -2 -1 3 -3 -2 -2 2 7 -1 51 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 52 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 53 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 1 -2 1 -1 -2 -2 0 -3 -1 4 54 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 1 -2 1 -1 -2 -2 0 -3 -1 4 55 C 0 -3 -3 -4 9 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1 56 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 1 -2 1 -1 -2 -2 0 -3 -1 4 57 C 0 -3 -3 -4 9 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1 58 N -2 0 6 1 -3 0 0 0 1 -3 -3 0 -2 -3 -2 1 0 -4 -2 -3 59 A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 60 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 5 -2 -2 0 61 Y -2 -2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 2 -1 -1 -2 -1 3 -3 -2 -2 2 7 -1 62 C 0 -3 -3 -4 9 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1 63 D -2 -2 1 6 -4 0 2 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -4 -2 0 -1 -4 -3 -3 64 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 65 F -2 -3 -3 -4 -2 -3 -3 -3 -1 0 0 -3 0 6 -4 -2 -2 1 3 -1 66 D -2 -2 1 6 -4 0 2 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -4 -2 0 -1 -4 -3 -3 67 P -1 -2 -2 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -3 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 68 P -1 -2 -2 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -3 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 69 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 5 -2 -2 0 70 F -2 -3 -3 -4 -2 -3 -3 -3 -1 0 0 -3 0 6 -4 -2 -2 1 3 -1 71 P -1 -2 -2 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -3 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 72 A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 73 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 74 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -3 -3 -3 75 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 5 -2 -2 0 76 F -2 -3 -3 -4 -2 -3 -3 -3 -1 0 0 -3 0 6 -4 -2 -2 1 3 -1 77 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 78 R -1 6 0 -2 -3 1 0 -2 0 -3 -2 2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3 79 Y -2 -2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 2 -1 -1 -2 -1 3 -3 -2 -2 2 7 -1 80 E -1 0 0 2 -4 2 5 -2 0 -3 -3 1 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 81 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 82 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 5 -2 -2 0 83 R -1 6 0 -2 -3 1 0 -2 0 -3 -2 2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3 84 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 85 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -3 -3 -3 86 R -1 6 0 -2 -3 1 0 -2 0 -3 -2 2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3 87 R -1 6 0 -2 -3 1 0 -2 0 -3 -2 2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3 88 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 1 2 -1 5 0 -3 -2 -1 -1 -1 1 89 E -1 0 0 2 -4 2 5 -2 0 -3 -3 1 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 90 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 91 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -2 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 92 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 1 2 -1 5 0 -3 -2 -1 -1 -1 1 93 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -3 -3 -3 94 P -1 -2 -2 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -3 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 95 I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 4 2 -3 1 0 -3 -2 -1 -3 -1 3 96 Q -1 1 0 0 -3 5 2 -2 0 -3 -2 1 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2 97 A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 98 N -2 0 6 1 -3 0 0 0 1 -3 -3 0 -2 -3 -2 1 0 -4 -2 -3 99 H -2 0 1 -1 -3 0 0 -2 8 -3 -3 -1 -2 -1 -2 -1 -2 -2 2 -3 100 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 5 -2 -2 0 101 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -3 -3 -3 102 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 5 -2 -2 0 103 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -3 -3 -3 104 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 105 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 106 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 107 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 5 -2 -2 0 108 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 109 Q -1 1 0 0 -3 5 2 -2 0 -3 -2 1 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2 110 P -1 -2 -2 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -3 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 111 E -1 0 0 2 -4 2 5 -2 0 -3 -3 1 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 112 Q -1 1 0 0 -3 5 2 -2 0 -3 -2 1 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2 113 K -1 2 0 -1 -3 1 1 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 114 F -2 -3 -3 -4 -2 -3 -3 -3 -1 0 0 -3 0 6 -4 -2 -2 1 3 -1 115 Q -1 1 0 0 -3 5 2 -2 0 -3 -2 1 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2 116 K -1 2 0 -1 -3 1 1 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 117 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 1 -2 1 -1 -2 -2 0 -3 -1 4 118 K -1 2 0 -1 -3 1 1 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 119 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -3 -3 -3 120 F -2 -3 -3 -4 -2 -3 -3 -3 -1 0 0 -3 0 6 -4 -2 -2 1 3 -1 121 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -3 -3 -3 122 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -3 -3 -3 123 A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 124 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 1 2 -1 5 0 -3 -2 -1 -1 -1 1 125 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 5 -2 -2 0 126 D -2 -2 1 6 -4 0 2 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -4 -2 0 -1 -4 -3 -3 127 A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 128 A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 129 A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 130 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 131 N -2 0 6 1 -3 0 0 0 1 -3 -3 0 -2 -3 -2 1 0 -4 -2 -3 132 I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 4 2 -3 1 0 -3 -2 -1 -3 -1 3 133 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 134 A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 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K Lambda
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