Hemochromatosis SS Alignments

From Bioinformatikpedia
Revision as of 22:14, 27 May 2013 by Betza (talk | contribs)
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)

Order: DSSPseq,Uniprot seq, dssp assignment,reprof,psipred

Q08209

MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESVALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMDAFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLNIC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESVALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMDAFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSATVEAIEADEAIKGFSPQHKITSFEEAKGLDRINERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCEECCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCEEECHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCEEEEEEECCEEEEEEECCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
CCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCECCCCCCCCCCCCCCHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHECCCCCCCCCCHHHEHCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC


Q030201

[25, 297] 

-------------------------RSHSLHYLFMGASEQDLGLSLFEALGYVDDQLFVFYDHESRRVEPRTPWVSSRISSQMWLQLSQSLKGWDHMFTVDFWTIMENHNHSKESHTLQVILGaEMQEDNSTEGYWKYGYDGQDHLEFCPDTLDWRAAEPRAWPTKLEWERHKIRARQNRAYLERDaPAQLQQLLELGRGVLDQQVPPLVKVTHHVTSSVTTLRbRALNYYPQNITMKWLKDKQPMDAKEFEPKDVLPNGDGTYQGWITLAVPPGEEQRYTbQVEHPGLDQPLIVIW---------------------------------------------------
MGPRARPALLLLMLLQTAVLQGRLLRSHSLHYLFMGASEQDLGLSLFEALGYVDDQLFVFYDHESRRVEPRTPWVSSRISSQMWLQLSQSLKGWDHMFTVDFWTIMENHNHSKESHTLQVILGCEMQEDNSTEGYWKYGYDGQDHLEFCPDTLDWRAAEPRAWPTKLEWERHKIRARQNRAYLERDCPAQLQQLLELGRGVLDQQVPPLVKVTHHVTSSVTTLRCRALNYYPQNITMKWLKDKQPMDAKEFEPKDVLPNGDGTYQGWITLAVPPGEEQRYTCQVEHPGLDQPLIVIWEPSPSGTLVIGVISGIAVFVVILFIGILFIILRKRQGSRGAMGHYVLAERE
-------------------------CCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCEEEEEEECCCCCEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEECCEEEEEEEHHHCEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEEEEEECCCCCEEEEEECCEECCHHHCCCCEEEECCCCCEEEEEEEEECCCHHHHEEEEEECCCCCCCEEEEC---------------------------------------------------
CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHCHCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEEECCEECCCCCCCCCCEEECCCEEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC


P10775

MNLDIHCEQLSDARWTELLPLLQQYEVVRLDDCGLTEEHCKDIGSALRANPSLTELCLRTNELGDAGVHLVLQGLQSPTCKIQKLSLQNCSLTEAGCGVLPSTLRSLPTLRELHLSDNPLGDAGLRLLCEGLLDPQCHLEKLQLEYCRLTAASCEPLASVLRATRALKELTVSNNDIGEAGARVLGQGLADSACQLETLRLENCGLTPANCKDLCGIVASQASLRELDLGSNGLGDAGIAELCPGLLSPASRLKTLWLWECDITASGCRDLCRVLQAKETLKELSLAGNKLGDEGARLLCESLLQPGCQLESLWVKSCSLTAACCQHVSLMLTQNKHLLELQLSSNKLGDSGIQELCQALSQPGTTLRVLCLGDCEVTNSGCSSLASLLLANRSLRELDLSNNCVGDPGVLQLLGSLEQPGCALEQLVLYDTYWTEEVEDRLQALEGSKPGLRVIS
MNLDIHCEQLSDARWTELLPLLQQYEVVRLDDCGLTEEHCKDIGSALRANPSLTELCLRTNELGDAGVHLVLQGLQSPTCKIQKLSLQNCSLTEAGCGVLPSTLRSLPTLRELHLSDNPLGDAGLRLLCEGLLDPQCHLEKLQLEYCRLTAASCEPLASVLRATRALKELTVSNNDIGEAGARVLGQGLADSACQLETLRLENCGLTPANCKDLCGIVASQASLRELDLGSNGLGDAGIAELCPGLLSPASRLKTLWLWECDITASGCRDLCRVLQAKETLKELSLAGNKLGDEGARLLCESLLQPGCQLESLWVKSCSLTAACCQHVSLMLTQNKHLLELQLSSNKLGDSGIQELCQALSQPGTTLRVLCLGDCEVTNSGCSSLASLLLANRSLRELDLSNNCVGDPGVLQLLGSLEQPGCALEQLVLYDTYWTEEVEDRLQALEGSKPGLRVIS
CCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHCHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEC
CEEEEEHHHCCHCCHHHHHHHHHHHHEHECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECC
CEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHCHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCHHCHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEECC

Q9X0E6

SLILVYSTFPNEEKALEIGRKLLEKRLIACFNAFEIRSGYWWKGEIVQDKEWAAIFKTTEEKEKELYEELRKLHPYETPAIFTLKVENVLTEYXNWLRESV
MILVYSTFPNEEKALEIGRKLLEKRLIACFNAFEIRSGYWWKGEIVQDKEWAAIFKTTEEKEKELYEELRKLHPYETPAIFTLKVENVLTEYMNWLRESVL
CEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEECCEEEEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHC
CEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCC
CEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEEECCHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCC
Retrieved from "https://i12r-studfilesrv.informatik.tu-muenchen.de/wiki/index.php?title=Hemochromatosis_SS_Alignments&oldid=31414"