Difference between revisions of "ASPA Sequence Based Predictions"

From Bioinformatikpedia
Line 346: Line 346:
   
 
===Meta-Disorder===
  
===Meta-Disorder===
  +
<pre>Number Residue NORSnet NORS2st PROFbval bval2st Ucon Ucon2st MD_raw MD_rel MD2st
−
...
  
  +
1 M 0.33 - 0.99 D 0.17 - 0.551 1 D
  +
2 T 0.26 - 0.78 D 0.25 - 0.531 0 D
  +
3 S 0.16 - 0.72 D 0.35 - 0.535 0 D
  +
4 C 0.23 - 0.65 D 0.33 - 0.505 0 -
  +
5 H 0.20 - 0.48 D 0.25 - 0.475 1 -
  +
6 I 0.16 - 0.55 D 0.30 - 0.465 1 -
  +
7 A 0.34 - 0.56 D 0.40 - 0.444 2 -
  +
8 E 0.28 - 0.67 D 0.30 - 0.424 3 -
  +
9 E 0.21 - 0.73 D 0.38 - 0.404 3 -
  +
10 H 0.15 - 0.70 D 0.30 - 0.374 4 -
  +
11 I 0.15 - 0.59 D 0.29 - 0.354 5 -
  +
12 Q 0.15 - 0.60 D 0.28 - 0.313 6 -
  +
13 K 0.14 - 0.51 D 0.23 - 0.263 8 -
  +
14 V 0.14 - 0.30 - 0.19 - 0.253 8 -
  +
15 A 0.16 - 0.24 - 0.19 - 0.250 9 -
  +
16 I 0.13 - 0.20 - 0.24 - 0.242 9 -
  +
17 F 0.10 - 0.13 - 0.23 - 0.250 9 -
  +
18 G 0.13 - 0.18 - 0.21 - 0.242 9 -
  +
19 G 0.10 - 0.24 - 0.20 - 0.253 8 -
  +
20 T 0.07 - 0.34 - 0.20 - 0.253 8 -
  +
21 H 0.06 - 0.26 - 0.26 - 0.260 8 -
  +
22 G 0.06 - 0.39 - 0.29 - 0.253 8 -
  +
23 N 0.06 - 0.48 D 0.22 - 0.250 9 -
  +
24 E 0.06 - 0.47 D 0.18 - 0.242 9 -
  +
25 L 0.11 - 0.43 - 0.16 - 0.242 9 -
  +
26 T 0.12 - 0.39 - 0.20 - 0.253 8 -
  +
27 G 0.10 - 0.32 - 0.20 - 0.242 9 -
  +
28 V 0.08 - 0.28 - 0.15 - 0.242 9 -
  +
29 F 0.12 - 0.35 - 0.13 - 0.242 9 -
  +
30 L 0.14 - 0.28 - 0.15 - 0.242 9 -
  +
31 V 0.09 - 0.30 - 0.16 - 0.253 8 -
  +
32 K 0.07 - 0.40 - 0.16 - 0.263 8 -
  +
33 H 0.06 - 0.40 - 0.18 - 0.293 7 -
  +
34 W 0.08 - 0.38 - 0.29 - 0.273 8 -
  +
35 L 0.09 - 0.45 - 0.30 - 0.283 7 -
  +
36 E 0.09 - 0.56 D 0.41 - 0.313 6 -
  +
37 N 0.12 - 0.62 D 0.32 - 0.313 6 -
  +
38 G 0.16 - 0.62 D 0.35 - 0.330 6 -
  +
39 A 0.11 - 0.64 D 0.46 - 0.313 6 -
  +
40 E 0.10 - 0.66 D 0.47 - 0.323 6 -
  +
41 I 0.09 - 0.65 D 0.47 - 0.323 6 -
  +
42 Q 0.10 - 0.64 D 0.36 - 0.293 7 -
  +
43 R 0.09 - 0.61 D 0.50 - 0.273 8 -
  +
44 T 0.08 - 0.61 D 0.56 - 0.273 8 -
  +
45 G 0.08 - 0.53 D 0.34 - 0.263 8 -
  +
46 L 0.09 - 0.43 - 0.35 - 0.260 8 -
  +
47 E 0.10 - 0.33 - 0.32 - 0.253 8 -
  +
48 V 0.07 - 0.23 - 0.32 - 0.250 9 -
  +
49 K 0.06 - 0.17 - 0.34 - 0.253 8 -
  +
50 P 0.08 - 0.18 - 0.37 - 0.263 8 -
  +
51 F 0.08 - 0.17 - 0.49 - 0.273 8 -
  +
52 I 0.07 - 0.21 - 0.33 - 0.273 8 -
  +
53 T 0.06 - 0.28 - 0.53 - 0.303 7 -
  +
54 N 0.07 - 0.28 - 0.53 - 0.303 7 -
  +
55 P 0.09 - 0.36 - 0.37 - 0.313 6 -
  +
56 R 0.08 - 0.41 - 0.51 - 0.313 6 -
  +
57 A 0.10 - 0.40 - 0.66 D 0.280 7 -
  +
58 V 0.13 - 0.40 - 0.51 - 0.263 8 -
  +
59 K 0.16 - 0.48 D 0.37 - 0.263 8 -
  +
60 K 0.19 - 0.47 D 0.40 - 0.263 8 -
  +
61 C 0.18 - 0.47 D 0.29 - 0.253 8 -
  +
62 T 0.16 - 0.55 D 0.35 - 0.263 8 -
  +
63 R 0.18 - 0.51 D 0.31 - 0.253 8 -
  +
64 Y 0.22 - 0.47 D 0.25 - 0.273 8 -
  +
65 I 0.23 - 0.47 D 0.20 - 0.260 8 -
  +
66 D 0.23 - 0.56 D 0.21 - 0.263 8 -
  +
67 C 0.25 - 0.57 D 0.16 - 0.263 8 -
  +
68 D 0.30 - 0.43 - 0.18 - 0.263 8 -
  +
69 L 0.29 - 0.40 - 0.18 - 0.260 8 -
  +
70 N 0.28 - 0.40 - 0.25 - 0.263 8 -
  +
71 R 0.40 - 0.39 - 0.23 - 0.273 8 -
  +
72 I 0.46 - 0.43 - 0.22 - 0.280 7 -
  +
73 F 0.46 - 0.37 - 0.19 - 0.273 8 -
  +
74 D 0.37 - 0.46 - 0.32 - 0.310 6 -
  +
75 L 0.33 - 0.57 D 0.40 - 0.390 4 -
  +
76 E 0.36 - 0.61 D 0.30 - 0.444 2 -
  +
77 N 0.44 - 0.62 D 0.41 - 0.465 1 -
  +
78 L 0.38 - 0.66 D 0.65 D 0.531 0 D
  +
79 G 0.30 - 0.70 D 0.64 D 0.485 1 -
  +
80 K 0.35 - 0.69 D 0.64 D 0.515 0 -
  +
81 K 0.23 - 0.69 D 0.59 D 0.475 1 -
  +
82 M 0.23 - 0.66 D 0.42 - 0.444 2 -
  +
83 S 0.28 - 0.69 D 0.64 D 0.449 2 -
  +
84 E 0.34 - 0.72 D 0.56 - 0.485 1 -
  +
85 D 0.29 - 0.74 D 0.45 - 0.424 3 -
  +
86 L 0.20 - 0.64 D 0.35 - 0.424 3 -
  +
87 P 0.20 - 0.64 D 0.45 - 0.404 3 -
  +
88 Y 0.17 - 0.55 D 0.46 - 0.384 4 -
  +
89 E 0.14 - 0.50 D 0.46 - 0.364 5 -
  +
90 V 0.13 - 0.45 - 0.30 - 0.333 6 -
  +
91 R 0.12 - 0.43 - 0.43 - 0.320 6 -
  +
92 R 0.11 - 0.40 - 0.36 - 0.293 7 -
  +
93 A 0.11 - 0.34 - 0.36 - 0.283 7 -
  +
94 Q 0.10 - 0.45 - 0.22 - 0.290 7 -
  +
95 E 0.12 - 0.41 - 0.25 - 0.303 7 -
  +
96 I 0.09 - 0.34 - 0.26 - 0.283 7 -
  +
97 N 0.11 - 0.40 - 0.33 - 0.313 6 -
  +
98 H 0.10 - 0.49 D 0.39 - 0.313 6 -
  +
99 L 0.10 - 0.47 D 0.38 - 0.313 6 -
  +
100 F 0.13 - 0.47 D 0.38 - 0.293 7 -
  +
101 G 0.14 - 0.54 D 0.58 D 0.323 6 -
  +
102 P 0.13 - 0.61 D 0.58 D 0.333 6 -
  +
103 K 0.13 - 0.60 D 0.47 - 0.323 6 -
  +
104 D 0.11 - 0.61 D 0.71 D 0.323 6 -
  +
105 S 0.10 - 0.65 D 0.73 D 0.283 7 -
  +
106 E 0.10 - 0.70 D 0.62 D 0.283 7 -
  +
107 D 0.12 - 0.70 D 0.42 - 0.273 8 -
  +
108 S 0.11 - 0.64 D 0.37 - 0.270 8 -
  +
109 Y 0.12 - 0.50 D 0.23 - 0.253 8 -
  +
110 D 0.13 - 0.39 - 0.20 - 0.242 9 -
  +
111 I 0.16 - 0.29 - 0.18 - 0.240 9 -
  +
112 I 0.15 - 0.20 - 0.16 - 0.240 9 -
  +
113 F 0.14 - 0.20 - 0.16 - 0.240 9 -
  +
114 D 0.17 - 0.21 - 0.20 - 0.242 9 -
  +
115 L 0.21 - 0.20 - 0.19 - 0.253 8 -
  +
116 H 0.17 - 0.28 - 0.19 - 0.273 8 -
  +
117 N 0.11 - 0.48 D 0.23 - 0.283 7 -
  +
118 T 0.13 - 0.39 - 0.24 - 0.283 7 -
  +
119 T 0.13 - 0.41 - 0.21 - 0.273 8 -
  +
120 S 0.15 - 0.46 - 0.21 - 0.273 8 -
  +
121 N 0.22 - 0.54 D 0.18 - 0.263 8 -
  +
122 M 0.25 - 0.51 D 0.14 - 0.260 8 -
  +
123 G 0.30 - 0.51 D 0.16 - 0.253 8 -
  +
124 C 0.26 - 0.42 - 0.18 - 0.250 9 -
  +
125 T 0.29 - 0.40 - 0.18 - 0.242 9 -
  +
126 L 0.24 - 0.34 - 0.18 - 0.253 8 -
  +
127 I 0.17 - 0.28 - 0.23 - 0.260 8 -
  +
128 L 0.13 - 0.28 - 0.25 - 0.263 8 -
  +
129 E 0.14 - 0.41 - 0.24 - 0.253 8 -
  +
130 D 0.14 - 0.54 D 0.18 - 0.253 8 -
  +
131 S 0.10 - 0.59 D 0.19 - 0.273 8 -
  +
132 R 0.07 - 0.68 D 0.27 - 0.280 7 -
  +
133 N 0.05 - 0.64 D 0.28 - 0.273 8 -
  +
134 N 0.06 - 0.61 D 0.18 - 0.273 8 -
  +
135 F 0.07 - 0.53 D 0.15 - 0.260 8 -
  +
136 L 0.08 - 0.47 D 0.13 - 0.242 9 -
  +
137 I 0.10 - 0.47 D 0.13 - 0.242 9 -
  +
138 Q 0.16 - 0.42 - 0.13 - 0.242 9 -
  +
139 M 0.15 - 0.34 - 0.13 - 0.242 9 -
  +
140 F 0.11 - 0.32 - 0.14 - 0.250 9 -
  +
141 H 0.13 - 0.41 - 0.14 - 0.263 8 -
  +
142 Y 0.16 - 0.36 - 0.16 - 0.263 8 -
  +
143 I 0.12 - 0.34 - 0.16 - 0.263 8 -
  +
144 K 0.11 - 0.46 - 0.15 - 0.283 7 -
  +
145 T 0.07 - 0.54 D 0.20 - 0.273 8 -
  +
146 S 0.07 - 0.55 D 0.17 - 0.253 8 -
  +
147 L 0.09 - 0.56 D 0.17 - 0.242 9 -
  +
148 A 0.10 - 0.57 D 0.17 - 0.250 9 -
  +
149 P 0.09 - 0.60 D 0.13 - 0.253 8 -
  +
150 L 0.11 - 0.51 D 0.13 - 0.242 9 -
  +
151 P 0.13 - 0.44 - 0.14 - 0.242 9 -
  +
152 C 0.12 - 0.38 - 0.13 - 0.240 9 -
  +
153 Y 0.13 - 0.31 - 0.13 - 0.240 9 -
  +
154 V 0.18 - 0.28 - 0.13 - 0.242 9 -
  +
155 Y 0.17 - 0.33 - 0.14 - 0.250 9 -
  +
156 L 0.21 - 0.47 D 0.13 - 0.253 8 -
  +
157 I 0.22 - 0.54 D 0.15 - 0.263 8 -
  +
158 E 0.17 - 0.58 D 0.15 - 0.283 7 -
  +
159 H 0.16 - 0.62 D 0.17 - 0.303 7 -
  +
160 P 0.13 - 0.65 D 0.21 - 0.323 6 -
  +
161 S 0.14 - 0.59 D 0.29 - 0.303 7 -
  +
162 L 0.17 - 0.58 D 0.41 - 0.303 7 -
  +
163 K 0.21 - 0.56 D 0.36 - 0.293 7 -
  +
164 Y 0.32 - 0.51 D 0.29 - 0.273 8 -
  +
165 A 0.31 - 0.47 D 0.26 - 0.273 8 -
  +
166 T 0.28 - 0.45 - 0.32 - 0.273 8 -
  +
167 T 0.22 - 0.41 - 0.33 - 0.273 8 -
  +
168 R 0.15 - 0.47 D 0.26 - 0.273 8 -
  +
169 S 0.14 - 0.47 D 0.28 - 0.280 7 -
  +
170 I 0.12 - 0.46 - 0.29 - 0.273 8 -
  +
171 A 0.12 - 0.47 D 0.22 - 0.283 7 -
  +
172 K 0.11 - 0.58 D 0.27 - 0.290 7 -
  +
173 Y 0.13 - 0.47 D 0.20 - 0.263 8 -
  +
174 P 0.11 - 0.38 - 0.19 - 0.253 8 -
  +
175 V 0.10 - 0.26 - 0.26 - 0.250 9 -
  +
176 G 0.09 - 0.24 - 0.31 - 0.250 9 -
  +
177 I 0.13 - 0.33 - 0.25 - 0.250 9 -
  +
178 E 0.20 - 0.28 - 0.37 - 0.253 8 -
  +
179 V 0.26 - 0.41 - 0.33 - 0.253 8 -
  +
180 G 0.20 - 0.45 - 0.33 - 0.270 8 -
  +
181 P 0.17 - 0.59 D 0.25 - 0.283 7 -
  +
182 Q 0.12 - 0.49 D 0.35 - 0.283 7 -
  +
183 P 0.12 - 0.51 D 0.28 - 0.273 8 -
  +
184 Q 0.13 - 0.54 D 0.42 - 0.273 8 -
  +
185 G 0.10 - 0.51 D 0.33 - 0.263 8 -
  +
186 V 0.12 - 0.55 D 0.22 - 0.253 8 -
  +
187 L 0.17 - 0.54 D 0.24 - 0.253 8 -
  +
188 R 0.14 - 0.48 D 0.24 - 0.263 8 -
  +
189 A 0.11 - 0.53 D 0.18 - 0.273 8 -
  +
190 D 0.11 - 0.51 D 0.19 - 0.273 8 -
  +
191 I 0.08 - 0.41 - 0.31 - 0.283 7 -
  +
192 L 0.07 - 0.42 - 0.33 - 0.263 8 -
  +
193 D 0.06 - 0.47 D 0.24 - 0.273 8 -
  +
194 Q 0.08 - 0.45 - 0.33 - 0.270 8 -
  +
195 M 0.04 - 0.34 - 0.26 - 0.263 8 -
  +
196 R 0.04 - 0.43 - 0.34 - 0.273 8 -
  +
197 K 0.05 - 0.44 - 0.34 - 0.263 8 -
  +
198 M 0.06 - 0.29 - 0.34 - 0.263 8 -
  +
199 I 0.06 - 0.28 - 0.22 - 0.253 8 -
  +
200 K 0.07 - 0.34 - 0.22 - 0.263 8 -
  +
201 H 0.07 - 0.32 - 0.20 - 0.253 8 -
  +
202 A 0.08 - 0.28 - 0.15 - 0.250 9 -
  +
203 L 0.08 - 0.35 - 0.15 - 0.253 8 -
  +
204 D 0.09 - 0.43 - 0.19 - 0.263 8 -
  +
205 F 0.11 - 0.41 - 0.18 - 0.263 8 -
  +
206 I 0.12 - 0.45 - 0.18 - 0.253 8 -
  +
207 H 0.15 - 0.59 D 0.23 - 0.270 8 -
  +
208 H 0.18 - 0.59 D 0.40 - 0.290 7 -
  +
209 F 0.22 - 0.58 D 0.24 - 0.283 7 -
  +
210 N 0.27 - 0.63 D 0.37 - 0.293 7 -
  +
211 E 0.27 - 0.66 D 0.53 - 0.313 6 -
  +
212 G 0.28 - 0.68 D 0.44 - 0.313 6 -
  +
213 K 0.26 - 0.70 D 0.46 - 0.323 6 -
  +
214 E 0.26 - 0.71 D 0.50 - 0.323 6 -
  +
215 F 0.20 - 0.70 D 0.56 - 0.303 7 -
  +
216 P 0.21 - 0.69 D 0.37 - 0.293 7 -
  +
217 P 0.24 - 0.69 D 0.28 - 0.280 7 -
  +
218 C 0.14 - 0.66 D 0.28 - 0.263 8 -
  +
219 A 0.14 - 0.58 D 0.19 - 0.263 8 -
  +
220 I 0.15 - 0.52 D 0.19 - 0.263 8 -
  +
221 E 0.11 - 0.47 D 0.22 - 0.270 8 -
  +
222 V 0.11 - 0.34 - 0.26 - 0.273 8 -
  +
223 Y 0.12 - 0.30 - 0.28 - 0.280 7 -
  +
224 K 0.08 - 0.37 - 0.34 - 0.280 7 -
  +
225 I 0.09 - 0.32 - 0.33 - 0.273 8 -
  +
226 I 0.07 - 0.35 - 0.29 - 0.283 7 -
  +
227 E 0.09 - 0.43 - 0.38 - 0.313 6 -
  +
228 K 0.09 - 0.49 D 0.61 D 0.333 6 -
  +
229 V 0.12 - 0.49 D 0.58 D 0.337 6 -
  +
230 D 0.16 - 0.53 D 0.75 D 0.354 5 -
  +
231 Y 0.14 - 0.52 D 0.84 D 0.343 5 -
  +
232 P 0.12 - 0.57 D 0.84 D 0.313 6 -
  +
233 R 0.13 - 0.66 D 0.59 D 0.303 7 -
  +
234 D 0.15 - 0.69 D 0.70 D 0.310 6 -
  +
235 E 0.10 - 0.71 D 0.59 D 0.293 7 -
  +
236 N 0.12 - 0.71 D 0.62 D 0.303 7 -
  +
237 G 0.17 - 0.67 D 0.44 - 0.293 7 -
  +
238 E 0.22 - 0.60 D 0.40 - 0.283 7 -
  +
239 I 0.17 - 0.53 D 0.36 - 0.270 8 -
  +
240 A 0.16 - 0.38 - 0.30 - 0.260 8 -
  +
241 A 0.19 - 0.29 - 0.22 - 0.253 8 -
  +
242 I 0.16 - 0.28 - 0.24 - 0.263 8 -
  +
243 I 0.22 - 0.33 - 0.24 - 0.263 8 -
  +
244 H 0.25 - 0.34 - 0.34 - 0.293 7 -
  +
245 P 0.14 - 0.48 D 0.41 - 0.323 6 -
  +
246 N 0.16 - 0.53 D 0.30 - 0.343 5 -
  +
247 L 0.16 - 0.58 D 0.53 - 0.343 5 -
  +
248 Q 0.16 - 0.61 D 0.71 D 0.374 4 -
  +
249 D 0.22 - 0.64 D 0.59 D 0.354 5 -
  +
250 Q 0.30 - 0.64 D 0.51 - 0.364 5 -
  +
251 D 0.34 - 0.62 D 0.52 - 0.333 6 -
  +
252 W 0.33 - 0.52 D 0.65 D 0.313 6 -
  +
253 K 0.22 - 0.58 D 0.68 D 0.283 7 -
  +
254 P 0.21 - 0.58 D 0.63 D 0.283 7 -
  +
255 L 0.18 - 0.54 D 0.45 - 0.263 8 -
  +
256 H 0.16 - 0.68 D 0.27 - 0.263 8 -
  +
257 P 0.18 - 0.69 D 0.28 - 0.273 8 -
  +
258 G 0.19 - 0.57 D 0.21 - 0.270 8 -
  +
259 D 0.28 - 0.54 D 0.16 - 0.290 7 -
  +
260 P 0.25 - 0.54 D 0.23 - 0.270 8 -
  +
261 M 0.19 - 0.40 - 0.24 - 0.273 8 -
  +
262 F 0.16 - 0.34 - 0.29 - 0.253 8 -
  +
263 L 0.13 - 0.37 - 0.30 - 0.253 8 -
  +
264 T 0.10 - 0.46 - 0.20 - 0.242 9 -
  +
265 L 0.14 - 0.56 D 0.20 - 0.253 8 -
  +
266 D 0.13 - 0.61 D 0.20 - 0.263 8 -
  +
267 G 0.11 - 0.62 D 0.26 - 0.280 7 -
  +
268 K 0.10 - 0.60 D 0.34 - 0.283 7 -
  +
269 T 0.10 - 0.60 D 0.40 - 0.273 8 -
  +
270 I 0.08 - 0.46 - 0.41 - 0.250 9 -
  +
271 P 0.07 - 0.43 - 0.35 - 0.250 9 -
  +
272 L 0.12 - 0.46 - 0.29 - 0.242 9 -
  +
273 G 0.10 - 0.53 D 0.18 - 0.242 9 -
  +
274 G 0.08 - 0.52 D 0.19 - 0.250 9 -
  +
275 D 0.05 - 0.62 D 0.19 - 0.253 8 -
  +
276 C 0.06 - 0.68 D 0.15 - 0.263 8 -
  +
277 T 0.10 - 0.59 D 0.16 - 0.263 8 -
  +
278 V 0.08 - 0.52 D 0.17 - 0.263 8 -
  +
279 Y 0.09 - 0.33 - 0.20 - 0.242 9 -
  +
280 P 0.10 - 0.27 - 0.17 - 0.242 9 -
  +
281 V 0.12 - 0.23 - 0.21 - 0.242 9 -
  +
282 F 0.12 - 0.18 - 0.17 - 0.253 8 -
  +
283 V 0.09 - 0.24 - 0.16 - 0.263 8 -
  +
284 N 0.05 - 0.28 - 0.23 - 0.303 7 -
  +
285 E 0.06 - 0.39 - 0.28 - 0.384 4 -
  +
286 A 0.09 - 0.35 - 0.46 - 0.404 3 -
  +
287 A 0.08 - 0.43 - 0.72 D 0.418 3 -
  +
288 Y 0.08 - 0.37 - 0.79 D 0.374 4 -
  +
289 Y 0.09 - 0.55 D 0.61 D 0.354 5 -
  +
290 E 0.10 - 0.41 - 0.49 - 0.333 6 -
  +
291 K 0.10 - 0.50 D 0.65 D 0.323 6 -
  +
292 K 0.07 - 0.47 D 0.66 D 0.323 6 -
  +
293 E 0.07 - 0.36 - 0.79 D 0.333 6 -
  +
294 A 0.06 - 0.29 - 0.95 D 0.354 5 -
  +
295 F 0.08 - 0.27 - 0.82 D 0.333 6 -
  +
296 A 0.09 - 0.32 - 0.70 D 0.323 6 -
  +
297 K 0.09 - 0.42 - 0.41 - 0.343 5 -
  +
298 T 0.08 - 0.42 - 0.36 - 0.343 5 -
  +
299 T 0.10 - 0.51 D 0.36 - 0.414 3 -
  +
300 K 0.09 - 0.54 D 0.64 D 0.455 2 -
  +
301 L 0.09 - 0.48 D 0.70 D 0.394 4 -
  +
302 T 0.15 - 0.55 D 0.43 - 0.404 3 -
  +
303 L 0.15 - 0.48 D 0.46 - 0.374 4 -
  +
304 N 0.12 - 0.48 D 0.34 - 0.374 4 -
  +
305 A 0.13 - 0.47 D 0.19 - 0.374 4 -
  +
306 K 0.22 - 0.55 D 0.19 - 0.384 4 -
  +
307 S 0.07 - 0.53 D 0.18 - 0.434 2 -
  +
308 I 0.07 - 0.41 - 0.23 - 0.424 3 -
  +
309 R 0.07 - 0.37 - 0.21 - 0.414 3 -
  +
310 C 0.11 - 0.60 D 0.19 - 0.414 3 -
  +
311 C 0.14 - 0.67 D 0.14 - 0.394 4 -
  +
312 L 0.15 - 0.72 D 0.13 - 0.424 3 -
  +
313 H 0.44 - 0.80 D 0.13 - 0.485 1 -
  +
  +
  +
Key for output
  +
----------------
  +
Number - residue number
  +
Residue - amino-acid type
  +
NORSnet - raw score by NORSnet (prediction of unstructured loops)
  +
NORS2st - two-state prediction by NORSnet; D=disordered
  +
PROFbval - raw score by PROFbval (prediction of residue flexibility from sequence)
  +
Bval2st - two-state prediction by PROFbval
  +
Ucon - raw score by Ucon (prediction of protein disorder using predicted internal contacts)
  +
Ucon2st - two-state prediction by Ucon
  +
MD - raw score by MD (prediction of protein disorder using orthogonal sources)
  +
MD_rel - reliability of the prediction by MD; values range from 0-9. 9=strong prediction
  +
MD2st - two-state prediction by MD
  +
</pre>
   
 
==Prediction of transmembrane alpha-helices and signal peptides==
  
==Prediction of transmembrane alpha-helices and signal peptides==

Revision as of 21:10, 5 June 2011

Prediction of Secondary Structure Elements

PsiPred

PsiPred results for Aspartoacyclase
# PSIPRED HFORMAT (PSIPRED V3.0)

Conf: 987522213466199993246776008999999984450000587389976339987971
Pred: CCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCHHHHHH
  AA: MTSCHIAEEHIQKVAIFGGTHGNELTGVFLVKHWLENGAEIQRTGLEVKPFITNPRAVKK
              10        20        30        40        50        60


Conf: 998788998878786647999999984999999999988199999997428994187898
Pred: CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCC
  AA: CTRYIDCDLNRIFDLENLGKKMSEDLPYEVRRAQEINHLFGPKDSEDSYDIIFDLHNTTS
              70        80        90       100       110       120


Conf: 999505864599448999999998762999737862048886301220027861499667
Pred: CCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCCCCCHHHHCCCCCCEEEEEC
  AA: NMGCTLILEDSRNNFLIQMFHYIKTSLAPLPCYVYLIEHPSLKYATTRSIAKYPVGIEVG
             130       140       150       160       170       180


Conf: 877898808999999999999998976406998899973479998113515579877700
Pred: CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCCE
  AA: PQPQGVLRADILDQMRKMIKHALDFIHHFNEGKEFPPCAIEVYKIIEKVDYPRDENGEIA
             190       200       210       220       230       240


Conf: 552467669998546888832213699778518622057770372000011102000100
Pred: EEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCEEEEECCCCHHCCCCHHHEECCE
  AA: AIIHPNLQDQDWKPLHPGDPMFLTLDGKTIPLGGDCTVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTK
             250       260       270       280       290       300


Conf: 3544256113309
Pred: EEEEECCCEEECC
  AA: LTLNAKSIRCCLH
             310

JPred3

MTSCHIAEEHIQKVAIFGGTHGNELTGVFLVKHWLENGAEIQRTGLEVKPFITNPRAVKKCTRYID
------------EEEEEEEE------HHHHHHHHHH---------EEEEEEEE-HHHHHH-----H



CDLNRIFDLENLGKKMSEDLPYEVRRAQEINHLFGPKDSEDSYDIIFDLHNTTSNMGCTLILEDSR
---------------------HHHHHHHHHHHHHH-------EEEEEE-----------EEEE---



NNFLIQMFHYIKTSLAPLPCYVYLIEHPSLKYATTRSIAKYPVGIEVGPQPQGVLRADILDQMRKM
-HHHHHHHHHHHH------EEEEEE---------HHEE----EEEEE---------HHHHHHHHHH



IKHALDFIHHFNEGKEFPPCAIEVYKIIEKVDYPRDENGEIAAIIHPNLQDQDWKPLHPGDPMFLT
HHHHHHHHHHH----------EEEEEEEEEE----------EEEE----------------HHE--



LDGKTIPLGGDCTVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLNAKSIRCCLH
----EEEE----EEEEEEE-----HHH-HHHHHHHHEEE-----EEEE-

DSSP

                     10        20        30        40        50        60
                      |         |         |         |         |         |
    1 -   60 EHIQKVAIFGGTHGNELTGVFLVKHWLENGAEIQRTGLEVKPFITNPRAVKKCTRYIDCD
    1 -   60     SSSSSS TTTT HHHHHHHHHHTT  333  TT SSSSSST HHHHHTTTT TTT
    1 -   60
    1 -   60 AA AA               A  AA AAA AA AAAA A A     AA  AAAA AAAA
                     70        80        90       100       110       120
                      |         |         |         |         |         |
   61 -  120 LNRIFDLENLGKKMSEDLPYEVRRAQEINHLFGPKDSEDSYDIIFDLHNTTSNMGCTLIL
   61 -  120 333  THHHHTT   TTT HHHHHHHHHHHHH  TTTTTT TSSSSSSS TTT SSSSSS
   61 -  120       **  * * **            **   * *
   61 -  120   A  AAA  AAAAAAAAA   A   A  AA  AAA AA             A
                    130       140       150       160       170       180
                      |         |         |         |         |         |
  121 -  180 EDSRNNFLIQMFHYIKTSLAPLPCYVYLIEHPSLKYATTRSIAKYPVGIEVGPQPQGVLR
  121 -  180 T TT HHHHHHHHHHHHHHTTT SSSSS   TT     3333TTSSSSSSSST  TT
  121 -  180              *  ** **
  121 -  180  A A A      AA AAA AAAA A    AAAAAA        AA       A  A   A
                    190       200       210       220       230       240
                      |         |         |         |         |         |
  181 -  240 ADILDQMRKMIKHALDFIHHFNEGKEFPPCAIEVYKIIEKVDYPRDENGEIAAIIHPNLQ
  181 -  240 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT     SSSSSSSSSSSS     TTT   TSS TTTT
  181 -  240
  181 -  240  A  AA AA  AA     AA  AAAA AA A A  A AAA A AAAAA A      AA
                    250       260       270       280       290       300
                      |         |         |         |         |         |
  241 -  300 DQDWKPLHPGDPMFLTLDGKTIPLGGDCTVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLNAKSI
  241 -  300 T TTT   TTTSSSS TT  SSS  TTT  SSSTTT 333TTTT TSSSSSSSSSSS
  241 -  300
  241 -  300 AA  AA AAAAA  A  AAAAAA AAAAA A          AAA    A  AAA A A


  301 -  302 RC
  301 -  302
  301 -  302
  301 -  302 AA
 
                  310       320       330       340       350       360
                    |         |         |         |         |         |
  303 -  362 EHIQKVAIFGGTHGNELTGVFLVKHWLENGAEIQRTGLEVKPFITNPRAVKKCTRYIDCD
  303 -  362     SSSSSS TTTT HHHHHHHHHHHH 3333  TT SSSSSST HHHHHTT T TTT
  303 -  362
  303 -  362 AA AA                  AA AAA AA AAAA A A A   AA  AAAA AAAA
                  370       380       390       400       410       420
                    |         |         |         |         |         |
  363 -  422 LNRIFDLENLGKKMSEDLPYEVRRAQEINHLFGPKDSEDSYDIIFDLHNTTSNMGCTLIL
  363 -  422 333  THHHHTT   TTT HHHHHHHHHHHHH  TTTTTT TSSSSSSS TTT SSSSSS
  363 -  422       **  ***  *            **    ****
  363 -  422   A  AAA  AAAAAAAAA   A   A  AA  AAA AA             A
                  430       440       450       460       470       480
                    |         |         |         |         |         |
  423 -  482 EDSRNNFLIQMFHYIKTSLAPLPCYVYLIEHPSLKYATTRSIAKYPVGIEVGPQPQGVLR
  423 -  482 T TT HHHHHHHHHHHHHHTTT SSSSS  TTTT    3333TTSSSSSSSS   TT
  423 -  482
  423 -  482  A A A      AA AA  AAAA A    AAAAAA        AA       A      A
                  490       500       510       520       530       540
                    |         |         |         |         |         |
  483 -  542 ADILDQMRKMIKHALDFIHHFNEGKEFPPCAIEVYKIIEKVDYPRDENGEIAAIIHPNLQ
  483 -  542 HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHTT     SSSSSSSSSSSS     TTT   TSS TTTT
  483 -  542                             *** *
  483 -  542  A  AA AA  A      AA  A AA AA A A  A AAA A AAAAA A A    AA
                  550       560       570       580       590       600
                    |         |         |         |         |         |
  543 -  602 DQDWKPLHPGDPMFLTLDGKTIPLGGDCTVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTKLTLNAKSI
  543 -  602 T TTT   TTTSSSS TT  SSS  TTT  SSSTTT THHHHTT TSSSSSSSSSSS
  543 -  602                                                        *
  543 -  602 AA  AA AAAAA  A  AAAAAA AAAAA A          AAA    A AAAA A AA


  603 -  604 RC
  603 -  604
  603 -  604
  603 -  604 AA

Clearly solvent accessible: A; involved in symmetry contacts: *

pdb id: 2o53

Prediction of disordered regions

DISOPRED

DISOPRED result graph for Aspartoacyclase
DISOPRED predictions for a false positive rate threshold of: 2%

conf: 999999999877640000000000000000000000000000000000000000000000
pred: **********..................................................
  AA: MTSCHIAEEHIQKVAIFGGTHGNELTGVFLVKHWLENGAEIQRTGLEVKPFITNPRAVKK
              10        20        30        40        50        60

conf: 000000000000000356777788777654200000000000000000000000000000
pred: ......................**....................................
  AA: CTRYIDCDLNRIFDLENLGKKMSEDLPYEVRRAQEINHLFGPKDSEDSYDIIFDLHNTTS
              70        80        90       100       110       120

conf: 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000
pred: ............................................................
  AA: NMGCTLILEDSRNNFLIQMFHYIKTSLAPLPCYVYLIEHPSLKYATTRSIAKYPVGIEVG
             130       140       150       160       170       180

conf: 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000
pred: ............................................................
  AA: PQPQGVLRADILDQMRKMIKHALDFIHHFNEGKEFPPCAIEVYKIIEKVDYPRDENGEIA
             190       200       210       220       230       240

conf: 000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000
pred: ............................................................
  AA: AIIHPNLQDQDWKPLHPGDPMFLTLDGKTIPLGGDCTVYPVFVNEAAYYEKKEAFAKTTK
             250       260       270       280       290       300

conf: 0000000000002
pred: .............
  AA: LTLNAKSIRCCLH
             310

Asterisks (*) represent disorder predictions and dots (.) 
prediction of order. The confidence estimates give a rough
indication of the probability that each residue is disordered.

POODLE

Aspa disopred.png 


POS 1    M      T      S      C      H      I      A      E      E      H      I      
         -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
         0.461  0.444  0.413  0.401  0.418  0.461  0.537  0.644  0.693  0.62   0.468  


POS 12    Q      K      V      A      I      F      G      G      T      H      G      
          -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
          0.321  0.238  0.177  0.146  0.128  0.116  0.106  0.104  0.111  0.126  0.132  


POS 23    N      E      L      T      G      V      F      L      V      K      H      
          -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
          0.131  0.118  0.098  0.073  0.053  0.041  0.036  0.035  0.035  0.036  0.036  


POS 34    W      L      E      N      G      A      E      I      Q      R      T      
          -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
          0.038  0.045  0.06   0.081  0.099  0.119  0.133  0.146  0.147  0.143  0.129  


POS 45    G      L      E      V      K      P      F      I      T      N      P      
          -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
          0.111  0.09   0.073  0.062  0.054  0.047  0.039  0.033  0.033  0.037  0.041  


POS 56    R      A      V      K      K      C      T      R      Y      I      D      
          -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
          0.043  0.047  0.054  0.062  0.068  0.071  0.073  0.07   0.067  0.069  0.075  


POS 67    C      D      L      N      R      I      F      D      L      E      N      
          -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
          0.08   0.081  0.078  0.075  0.073  0.072  0.076  0.094  0.127  0.176  0.249  


POS 78    L      G      K      K      M      S      E      D      L      P      Y      
          -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
          0.403  0.554  0.737  0.766  0.804  0.755  0.682  0.65   0.632  0.636  0.583  


POS 89    E      V      R      R      A      Q      E      I      N      H      L      
          -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
          0.505  0.448  0.348  0.262  0.201  0.16   0.131  0.11   0.103  0.104  0.111  


POS 100    F      G      P      K      D      S      E      D      S      Y      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.116  0.117  0.108  0.089  0.067  0.049  0.039  0.034  0.033  0.035  


POS 110    D      I      I      F      D      L      H      N      T      T      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.038  0.041  0.043  0.043  0.042  0.041  0.042  0.045  0.052  0.06   


POS 120    S      N      M      G      C      T      L      I      L      E      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.07   0.081  0.092  0.101  0.109  0.111  0.107  0.096  0.085  0.072  


POS 130    D      S      R      N      N      F      L      I      Q      M      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.06   0.051  0.046  0.04   0.036  0.033  0.032  0.031  0.031  0.031  


POS 140    F      H      Y      I      K      T      S      L      A      P      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.033  0.036  0.04   0.043  0.046  0.049  0.05   0.053  0.055  0.059  


POS 150    L      P      C      Y      V      Y      L      I      E      H      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.065  0.073  0.088  0.103  0.115  0.119  0.118  0.111  0.104  0.104  


POS 160    P      S      L      K      Y      A      T      T      R      S      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.121  0.147  0.19   0.229  0.264  0.263  0.245  0.196  0.149  0.098  


POS 170    I      A      K      Y      P      V      G      I      E      V      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.069  0.053  0.051  0.057  0.066  0.08   0.093  0.102  0.103  0.099  


POS 180    G      P      Q      P      Q      G      V      L      R      A      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.096  0.094  0.095  0.095  0.099  0.098  0.099  0.095  0.094  0.086  


POS 190    D      I      L      D      Q      M      R      K      M      I      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.074  0.059  0.048  0.04   0.038  0.038  0.038  0.039  0.04   0.043  


POS 200    K      H      A      L      D      F      I      H      H      F      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.046  0.049  0.051  0.052  0.056  0.064  0.077  0.092  0.112  0.142  


POS 210    N      E      G      K      E      F      P      P      C      A      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.17   0.198  0.21   0.311  0.281  0.248  0.105  0.084  0.072  0.071  


POS 220    I      E      V      Y      K      I      I      E      K      V      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.069  0.065  0.06   0.056  0.052  0.054  0.062  0.076  0.105  0.141  


POS 230    D      Y      P      R      D      E      N      G      E      I      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.176  0.203  0.224  0.227  0.217  0.209  0.228  0.248  0.271  0.282  


POS 240    A      A      I      I      H      P      N      L      Q      D      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.289  0.269  0.24   0.208  0.188  0.169  0.155  0.152  0.167  0.193  


POS 250    Q      D      W      K      P      L      H      P      G      D      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.222  0.236  0.235  0.21   0.175  0.136  0.11   0.097  0.099  0.104  


POS 260    P      M      F      L      T      L      D      G      K      T      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.107  0.108  0.104  0.095  0.084  0.077  0.073  0.082  0.102  0.125  


POS 270    I      P      L      G      G      D      C      T      V      Y      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.144  0.162  0.169  0.166  0.156  0.149  0.133  0.117  0.099  0.089  


POS 280    P      V      F      V      N      E      A      A      Y      Y      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.077  0.072  0.067  0.064  0.066  0.082  0.122  0.184  0.241  0.279  


POS 290    E      K      K      E      A      F      A      K      T      T      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.282  0.264  0.236  0.229  0.238  0.257  0.263  0.252  0.231  0.222  


POS 300    K      L      T      L      N      A      K      S      I      R      
           -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     -1     
           0.246  0.278  0.305  0.31   0.303  0.277  0.263  0.371  0.382  0.38

IUPRED

...

Meta-Disorder

Number Residue NORSnet NORS2st PROFbval bval2st Ucon Ucon2st MD_raw   MD_rel  MD2st 
    1	M	0.33	-	0.99	D	0.17	-	0.551	1	D
    2	T	0.26	-	0.78	D	0.25	-	0.531	0	D
    3	S	0.16	-	0.72	D	0.35	-	0.535	0	D
    4	C	0.23	-	0.65	D	0.33	-	0.505	0	-
    5	H	0.20	-	0.48	D	0.25	-	0.475	1	-
    6	I	0.16	-	0.55	D	0.30	-	0.465	1	-
    7	A	0.34	-	0.56	D	0.40	-	0.444	2	-
    8	E	0.28	-	0.67	D	0.30	-	0.424	3	-
    9	E	0.21	-	0.73	D	0.38	-	0.404	3	-
   10	H	0.15	-	0.70	D	0.30	-	0.374	4	-
   11	I	0.15	-	0.59	D	0.29	-	0.354	5	-
   12	Q	0.15	-	0.60	D	0.28	-	0.313	6	-
   13	K	0.14	-	0.51	D	0.23	-	0.263	8	-
   14	V	0.14	-	0.30	-	0.19	-	0.253	8	-
   15	A	0.16	-	0.24	-	0.19	-	0.250	9	-
   16	I	0.13	-	0.20	-	0.24	-	0.242	9	-
   17	F	0.10	-	0.13	-	0.23	-	0.250	9	-
   18	G	0.13	-	0.18	-	0.21	-	0.242	9	-
   19	G	0.10	-	0.24	-	0.20	-	0.253	8	-
   20	T	0.07	-	0.34	-	0.20	-	0.253	8	-
   21	H	0.06	-	0.26	-	0.26	-	0.260	8	-
   22	G	0.06	-	0.39	-	0.29	-	0.253	8	-
   23	N	0.06	-	0.48	D	0.22	-	0.250	9	-
   24	E	0.06	-	0.47	D	0.18	-	0.242	9	-
   25	L	0.11	-	0.43	-	0.16	-	0.242	9	-
   26	T	0.12	-	0.39	-	0.20	-	0.253	8	-
   27	G	0.10	-	0.32	-	0.20	-	0.242	9	-
   28	V	0.08	-	0.28	-	0.15	-	0.242	9	-
   29	F	0.12	-	0.35	-	0.13	-	0.242	9	-
   30	L	0.14	-	0.28	-	0.15	-	0.242	9	-
   31	V	0.09	-	0.30	-	0.16	-	0.253	8	-
   32	K	0.07	-	0.40	-	0.16	-	0.263	8	-
   33	H	0.06	-	0.40	-	0.18	-	0.293	7	-
   34	W	0.08	-	0.38	-	0.29	-	0.273	8	-
   35	L	0.09	-	0.45	-	0.30	-	0.283	7	-
   36	E	0.09	-	0.56	D	0.41	-	0.313	6	-
   37	N	0.12	-	0.62	D	0.32	-	0.313	6	-
   38	G	0.16	-	0.62	D	0.35	-	0.330	6	-
   39	A	0.11	-	0.64	D	0.46	-	0.313	6	-
   40	E	0.10	-	0.66	D	0.47	-	0.323	6	-
   41	I	0.09	-	0.65	D	0.47	-	0.323	6	-
   42	Q	0.10	-	0.64	D	0.36	-	0.293	7	-
   43	R	0.09	-	0.61	D	0.50	-	0.273	8	-
   44	T	0.08	-	0.61	D	0.56	-	0.273	8	-
   45	G	0.08	-	0.53	D	0.34	-	0.263	8	-
   46	L	0.09	-	0.43	-	0.35	-	0.260	8	-
   47	E	0.10	-	0.33	-	0.32	-	0.253	8	-
   48	V	0.07	-	0.23	-	0.32	-	0.250	9	-
   49	K	0.06	-	0.17	-	0.34	-	0.253	8	-
   50	P	0.08	-	0.18	-	0.37	-	0.263	8	-
   51	F	0.08	-	0.17	-	0.49	-	0.273	8	-
   52	I	0.07	-	0.21	-	0.33	-	0.273	8	-
   53	T	0.06	-	0.28	-	0.53	-	0.303	7	-
   54	N	0.07	-	0.28	-	0.53	-	0.303	7	-
   55	P	0.09	-	0.36	-	0.37	-	0.313	6	-
   56	R	0.08	-	0.41	-	0.51	-	0.313	6	-
   57	A	0.10	-	0.40	-	0.66	D	0.280	7	-
   58	V	0.13	-	0.40	-	0.51	-	0.263	8	-
   59	K	0.16	-	0.48	D	0.37	-	0.263	8	-
   60	K	0.19	-	0.47	D	0.40	-	0.263	8	-
   61	C	0.18	-	0.47	D	0.29	-	0.253	8	-
   62	T	0.16	-	0.55	D	0.35	-	0.263	8	-
   63	R	0.18	-	0.51	D	0.31	-	0.253	8	-
   64	Y	0.22	-	0.47	D	0.25	-	0.273	8	-
   65	I	0.23	-	0.47	D	0.20	-	0.260	8	-
   66	D	0.23	-	0.56	D	0.21	-	0.263	8	-
   67	C	0.25	-	0.57	D	0.16	-	0.263	8	-
   68	D	0.30	-	0.43	-	0.18	-	0.263	8	-
   69	L	0.29	-	0.40	-	0.18	-	0.260	8	-
   70	N	0.28	-	0.40	-	0.25	-	0.263	8	-
   71	R	0.40	-	0.39	-	0.23	-	0.273	8	-
   72	I	0.46	-	0.43	-	0.22	-	0.280	7	-
   73	F	0.46	-	0.37	-	0.19	-	0.273	8	-
   74	D	0.37	-	0.46	-	0.32	-	0.310	6	-
   75	L	0.33	-	0.57	D	0.40	-	0.390	4	-
   76	E	0.36	-	0.61	D	0.30	-	0.444	2	-
   77	N	0.44	-	0.62	D	0.41	-	0.465	1	-
   78	L	0.38	-	0.66	D	0.65	D	0.531	0	D
   79	G	0.30	-	0.70	D	0.64	D	0.485	1	-
   80	K	0.35	-	0.69	D	0.64	D	0.515	0	-
   81	K	0.23	-	0.69	D	0.59	D	0.475	1	-
   82	M	0.23	-	0.66	D	0.42	-	0.444	2	-
   83	S	0.28	-	0.69	D	0.64	D	0.449	2	-
   84	E	0.34	-	0.72	D	0.56	-	0.485	1	-
   85	D	0.29	-	0.74	D	0.45	-	0.424	3	-
   86	L	0.20	-	0.64	D	0.35	-	0.424	3	-
   87	P	0.20	-	0.64	D	0.45	-	0.404	3	-
   88	Y	0.17	-	0.55	D	0.46	-	0.384	4	-
   89	E	0.14	-	0.50	D	0.46	-	0.364	5	-
   90	V	0.13	-	0.45	-	0.30	-	0.333	6	-
   91	R	0.12	-	0.43	-	0.43	-	0.320	6	-
   92	R	0.11	-	0.40	-	0.36	-	0.293	7	-
   93	A	0.11	-	0.34	-	0.36	-	0.283	7	-
   94	Q	0.10	-	0.45	-	0.22	-	0.290	7	-
   95	E	0.12	-	0.41	-	0.25	-	0.303	7	-
   96	I	0.09	-	0.34	-	0.26	-	0.283	7	-
   97	N	0.11	-	0.40	-	0.33	-	0.313	6	-
   98	H	0.10	-	0.49	D	0.39	-	0.313	6	-
   99	L	0.10	-	0.47	D	0.38	-	0.313	6	-
  100	F	0.13	-	0.47	D	0.38	-	0.293	7	-
  101	G	0.14	-	0.54	D	0.58	D	0.323	6	-
  102	P	0.13	-	0.61	D	0.58	D	0.333	6	-
  103	K	0.13	-	0.60	D	0.47	-	0.323	6	-
  104	D	0.11	-	0.61	D	0.71	D	0.323	6	-
  105	S	0.10	-	0.65	D	0.73	D	0.283	7	-
  106	E	0.10	-	0.70	D	0.62	D	0.283	7	-
  107	D	0.12	-	0.70	D	0.42	-	0.273	8	-
  108	S	0.11	-	0.64	D	0.37	-	0.270	8	-
  109	Y	0.12	-	0.50	D	0.23	-	0.253	8	-
  110	D	0.13	-	0.39	-	0.20	-	0.242	9	-
  111	I	0.16	-	0.29	-	0.18	-	0.240	9	-
  112	I	0.15	-	0.20	-	0.16	-	0.240	9	-
  113	F	0.14	-	0.20	-	0.16	-	0.240	9	-
  114	D	0.17	-	0.21	-	0.20	-	0.242	9	-
  115	L	0.21	-	0.20	-	0.19	-	0.253	8	-
  116	H	0.17	-	0.28	-	0.19	-	0.273	8	-
  117	N	0.11	-	0.48	D	0.23	-	0.283	7	-
  118	T	0.13	-	0.39	-	0.24	-	0.283	7	-
  119	T	0.13	-	0.41	-	0.21	-	0.273	8	-
  120	S	0.15	-	0.46	-	0.21	-	0.273	8	-
  121	N	0.22	-	0.54	D	0.18	-	0.263	8	-
  122	M	0.25	-	0.51	D	0.14	-	0.260	8	-
  123	G	0.30	-	0.51	D	0.16	-	0.253	8	-
  124	C	0.26	-	0.42	-	0.18	-	0.250	9	-
  125	T	0.29	-	0.40	-	0.18	-	0.242	9	-
  126	L	0.24	-	0.34	-	0.18	-	0.253	8	-
  127	I	0.17	-	0.28	-	0.23	-	0.260	8	-
  128	L	0.13	-	0.28	-	0.25	-	0.263	8	-
  129	E	0.14	-	0.41	-	0.24	-	0.253	8	-
  130	D	0.14	-	0.54	D	0.18	-	0.253	8	-
  131	S	0.10	-	0.59	D	0.19	-	0.273	8	-
  132	R	0.07	-	0.68	D	0.27	-	0.280	7	-
  133	N	0.05	-	0.64	D	0.28	-	0.273	8	-
  134	N	0.06	-	0.61	D	0.18	-	0.273	8	-
  135	F	0.07	-	0.53	D	0.15	-	0.260	8	-
  136	L	0.08	-	0.47	D	0.13	-	0.242	9	-
  137	I	0.10	-	0.47	D	0.13	-	0.242	9	-
  138	Q	0.16	-	0.42	-	0.13	-	0.242	9	-
  139	M	0.15	-	0.34	-	0.13	-	0.242	9	-
  140	F	0.11	-	0.32	-	0.14	-	0.250	9	-
  141	H	0.13	-	0.41	-	0.14	-	0.263	8	-
  142	Y	0.16	-	0.36	-	0.16	-	0.263	8	-
  143	I	0.12	-	0.34	-	0.16	-	0.263	8	-
  144	K	0.11	-	0.46	-	0.15	-	0.283	7	-
  145	T	0.07	-	0.54	D	0.20	-	0.273	8	-
  146	S	0.07	-	0.55	D	0.17	-	0.253	8	-
  147	L	0.09	-	0.56	D	0.17	-	0.242	9	-
  148	A	0.10	-	0.57	D	0.17	-	0.250	9	-
  149	P	0.09	-	0.60	D	0.13	-	0.253	8	-
  150	L	0.11	-	0.51	D	0.13	-	0.242	9	-
  151	P	0.13	-	0.44	-	0.14	-	0.242	9	-
  152	C	0.12	-	0.38	-	0.13	-	0.240	9	-
  153	Y	0.13	-	0.31	-	0.13	-	0.240	9	-
  154	V	0.18	-	0.28	-	0.13	-	0.242	9	-
  155	Y	0.17	-	0.33	-	0.14	-	0.250	9	-
  156	L	0.21	-	0.47	D	0.13	-	0.253	8	-
  157	I	0.22	-	0.54	D	0.15	-	0.263	8	-
  158	E	0.17	-	0.58	D	0.15	-	0.283	7	-
  159	H	0.16	-	0.62	D	0.17	-	0.303	7	-
  160	P	0.13	-	0.65	D	0.21	-	0.323	6	-
  161	S	0.14	-	0.59	D	0.29	-	0.303	7	-
  162	L	0.17	-	0.58	D	0.41	-	0.303	7	-
  163	K	0.21	-	0.56	D	0.36	-	0.293	7	-
  164	Y	0.32	-	0.51	D	0.29	-	0.273	8	-
  165	A	0.31	-	0.47	D	0.26	-	0.273	8	-
  166	T	0.28	-	0.45	-	0.32	-	0.273	8	-
  167	T	0.22	-	0.41	-	0.33	-	0.273	8	-
  168	R	0.15	-	0.47	D	0.26	-	0.273	8	-
  169	S	0.14	-	0.47	D	0.28	-	0.280	7	-
  170	I	0.12	-	0.46	-	0.29	-	0.273	8	-
  171	A	0.12	-	0.47	D	0.22	-	0.283	7	-
  172	K	0.11	-	0.58	D	0.27	-	0.290	7	-
  173	Y	0.13	-	0.47	D	0.20	-	0.263	8	-
  174	P	0.11	-	0.38	-	0.19	-	0.253	8	-
  175	V	0.10	-	0.26	-	0.26	-	0.250	9	-
  176	G	0.09	-	0.24	-	0.31	-	0.250	9	-
  177	I	0.13	-	0.33	-	0.25	-	0.250	9	-
  178	E	0.20	-	0.28	-	0.37	-	0.253	8	-
  179	V	0.26	-	0.41	-	0.33	-	0.253	8	-
  180	G	0.20	-	0.45	-	0.33	-	0.270	8	-
  181	P	0.17	-	0.59	D	0.25	-	0.283	7	-
  182	Q	0.12	-	0.49	D	0.35	-	0.283	7	-
  183	P	0.12	-	0.51	D	0.28	-	0.273	8	-
  184	Q	0.13	-	0.54	D	0.42	-	0.273	8	-
  185	G	0.10	-	0.51	D	0.33	-	0.263	8	-
  186	V	0.12	-	0.55	D	0.22	-	0.253	8	-
  187	L	0.17	-	0.54	D	0.24	-	0.253	8	-
  188	R	0.14	-	0.48	D	0.24	-	0.263	8	-
  189	A	0.11	-	0.53	D	0.18	-	0.273	8	-
  190	D	0.11	-	0.51	D	0.19	-	0.273	8	-
  191	I	0.08	-	0.41	-	0.31	-	0.283	7	-
  192	L	0.07	-	0.42	-	0.33	-	0.263	8	-
  193	D	0.06	-	0.47	D	0.24	-	0.273	8	-
  194	Q	0.08	-	0.45	-	0.33	-	0.270	8	-
  195	M	0.04	-	0.34	-	0.26	-	0.263	8	-
  196	R	0.04	-	0.43	-	0.34	-	0.273	8	-
  197	K	0.05	-	0.44	-	0.34	-	0.263	8	-
  198	M	0.06	-	0.29	-	0.34	-	0.263	8	-
  199	I	0.06	-	0.28	-	0.22	-	0.253	8	-
  200	K	0.07	-	0.34	-	0.22	-	0.263	8	-
  201	H	0.07	-	0.32	-	0.20	-	0.253	8	-
  202	A	0.08	-	0.28	-	0.15	-	0.250	9	-
  203	L	0.08	-	0.35	-	0.15	-	0.253	8	-
  204	D	0.09	-	0.43	-	0.19	-	0.263	8	-
  205	F	0.11	-	0.41	-	0.18	-	0.263	8	-
  206	I	0.12	-	0.45	-	0.18	-	0.253	8	-
  207	H	0.15	-	0.59	D	0.23	-	0.270	8	-
  208	H	0.18	-	0.59	D	0.40	-	0.290	7	-
  209	F	0.22	-	0.58	D	0.24	-	0.283	7	-
  210	N	0.27	-	0.63	D	0.37	-	0.293	7	-
  211	E	0.27	-	0.66	D	0.53	-	0.313	6	-
  212	G	0.28	-	0.68	D	0.44	-	0.313	6	-
  213	K	0.26	-	0.70	D	0.46	-	0.323	6	-
  214	E	0.26	-	0.71	D	0.50	-	0.323	6	-
  215	F	0.20	-	0.70	D	0.56	-	0.303	7	-
  216	P	0.21	-	0.69	D	0.37	-	0.293	7	-
  217	P	0.24	-	0.69	D	0.28	-	0.280	7	-
  218	C	0.14	-	0.66	D	0.28	-	0.263	8	-
  219	A	0.14	-	0.58	D	0.19	-	0.263	8	-
  220	I	0.15	-	0.52	D	0.19	-	0.263	8	-
  221	E	0.11	-	0.47	D	0.22	-	0.270	8	-
  222	V	0.11	-	0.34	-	0.26	-	0.273	8	-
  223	Y	0.12	-	0.30	-	0.28	-	0.280	7	-
  224	K	0.08	-	0.37	-	0.34	-	0.280	7	-
  225	I	0.09	-	0.32	-	0.33	-	0.273	8	-
  226	I	0.07	-	0.35	-	0.29	-	0.283	7	-
  227	E	0.09	-	0.43	-	0.38	-	0.313	6	-
  228	K	0.09	-	0.49	D	0.61	D	0.333	6	-
  229	V	0.12	-	0.49	D	0.58	D	0.337	6	-
  230	D	0.16	-	0.53	D	0.75	D	0.354	5	-
  231	Y	0.14	-	0.52	D	0.84	D	0.343	5	-
  232	P	0.12	-	0.57	D	0.84	D	0.313	6	-
  233	R	0.13	-	0.66	D	0.59	D	0.303	7	-
  234	D	0.15	-	0.69	D	0.70	D	0.310	6	-
  235	E	0.10	-	0.71	D	0.59	D	0.293	7	-
  236	N	0.12	-	0.71	D	0.62	D	0.303	7	-
  237	G	0.17	-	0.67	D	0.44	-	0.293	7	-
  238	E	0.22	-	0.60	D	0.40	-	0.283	7	-
  239	I	0.17	-	0.53	D	0.36	-	0.270	8	-
  240	A	0.16	-	0.38	-	0.30	-	0.260	8	-
  241	A	0.19	-	0.29	-	0.22	-	0.253	8	-
  242	I	0.16	-	0.28	-	0.24	-	0.263	8	-
  243	I	0.22	-	0.33	-	0.24	-	0.263	8	-
  244	H	0.25	-	0.34	-	0.34	-	0.293	7	-
  245	P	0.14	-	0.48	D	0.41	-	0.323	6	-
  246	N	0.16	-	0.53	D	0.30	-	0.343	5	-
  247	L	0.16	-	0.58	D	0.53	-	0.343	5	-
  248	Q	0.16	-	0.61	D	0.71	D	0.374	4	-
  249	D	0.22	-	0.64	D	0.59	D	0.354	5	-
  250	Q	0.30	-	0.64	D	0.51	-	0.364	5	-
  251	D	0.34	-	0.62	D	0.52	-	0.333	6	-
  252	W	0.33	-	0.52	D	0.65	D	0.313	6	-
  253	K	0.22	-	0.58	D	0.68	D	0.283	7	-
  254	P	0.21	-	0.58	D	0.63	D	0.283	7	-
  255	L	0.18	-	0.54	D	0.45	-	0.263	8	-
  256	H	0.16	-	0.68	D	0.27	-	0.263	8	-
  257	P	0.18	-	0.69	D	0.28	-	0.273	8	-
  258	G	0.19	-	0.57	D	0.21	-	0.270	8	-
  259	D	0.28	-	0.54	D	0.16	-	0.290	7	-
  260	P	0.25	-	0.54	D	0.23	-	0.270	8	-
  261	M	0.19	-	0.40	-	0.24	-	0.273	8	-
  262	F	0.16	-	0.34	-	0.29	-	0.253	8	-
  263	L	0.13	-	0.37	-	0.30	-	0.253	8	-
  264	T	0.10	-	0.46	-	0.20	-	0.242	9	-
  265	L	0.14	-	0.56	D	0.20	-	0.253	8	-
  266	D	0.13	-	0.61	D	0.20	-	0.263	8	-
  267	G	0.11	-	0.62	D	0.26	-	0.280	7	-
  268	K	0.10	-	0.60	D	0.34	-	0.283	7	-
  269	T	0.10	-	0.60	D	0.40	-	0.273	8	-
  270	I	0.08	-	0.46	-	0.41	-	0.250	9	-
  271	P	0.07	-	0.43	-	0.35	-	0.250	9	-
  272	L	0.12	-	0.46	-	0.29	-	0.242	9	-
  273	G	0.10	-	0.53	D	0.18	-	0.242	9	-
  274	G	0.08	-	0.52	D	0.19	-	0.250	9	-
  275	D	0.05	-	0.62	D	0.19	-	0.253	8	-
  276	C	0.06	-	0.68	D	0.15	-	0.263	8	-
  277	T	0.10	-	0.59	D	0.16	-	0.263	8	-
  278	V	0.08	-	0.52	D	0.17	-	0.263	8	-
  279	Y	0.09	-	0.33	-	0.20	-	0.242	9	-
  280	P	0.10	-	0.27	-	0.17	-	0.242	9	-
  281	V	0.12	-	0.23	-	0.21	-	0.242	9	-
  282	F	0.12	-	0.18	-	0.17	-	0.253	8	-
  283	V	0.09	-	0.24	-	0.16	-	0.263	8	-
  284	N	0.05	-	0.28	-	0.23	-	0.303	7	-
  285	E	0.06	-	0.39	-	0.28	-	0.384	4	-
  286	A	0.09	-	0.35	-	0.46	-	0.404	3	-
  287	A	0.08	-	0.43	-	0.72	D	0.418	3	-
  288	Y	0.08	-	0.37	-	0.79	D	0.374	4	-
  289	Y	0.09	-	0.55	D	0.61	D	0.354	5	-
  290	E	0.10	-	0.41	-	0.49	-	0.333	6	-
  291	K	0.10	-	0.50	D	0.65	D	0.323	6	-
  292	K	0.07	-	0.47	D	0.66	D	0.323	6	-
  293	E	0.07	-	0.36	-	0.79	D	0.333	6	-
  294	A	0.06	-	0.29	-	0.95	D	0.354	5	-
  295	F	0.08	-	0.27	-	0.82	D	0.333	6	-
  296	A	0.09	-	0.32	-	0.70	D	0.323	6	-
  297	K	0.09	-	0.42	-	0.41	-	0.343	5	-
  298	T	0.08	-	0.42	-	0.36	-	0.343	5	-
  299	T	0.10	-	0.51	D	0.36	-	0.414	3	-
  300	K	0.09	-	0.54	D	0.64	D	0.455	2	-
  301	L	0.09	-	0.48	D	0.70	D	0.394	4	-
  302	T	0.15	-	0.55	D	0.43	-	0.404	3	-
  303	L	0.15	-	0.48	D	0.46	-	0.374	4	-
  304	N	0.12	-	0.48	D	0.34	-	0.374	4	-
  305	A	0.13	-	0.47	D	0.19	-	0.374	4	-
  306	K	0.22	-	0.55	D	0.19	-	0.384	4	-
  307	S	0.07	-	0.53	D	0.18	-	0.434	2	-
  308	I	0.07	-	0.41	-	0.23	-	0.424	3	-
  309	R	0.07	-	0.37	-	0.21	-	0.414	3	-
  310	C	0.11	-	0.60	D	0.19	-	0.414	3	-
  311	C	0.14	-	0.67	D	0.14	-	0.394	4	-
  312	L	0.15	-	0.72	D	0.13	-	0.424	3	-
  313	H	0.44	-	0.80	D	0.13	-	0.485	1	-


Key for output
----------------
Number - residue number
Residue - amino-acid type
NORSnet - raw score by NORSnet (prediction of unstructured loops)
NORS2st - two-state prediction by NORSnet; D=disordered
PROFbval - raw score by PROFbval (prediction of residue flexibility from sequence)
Bval2st - two-state prediction by PROFbval
Ucon - raw score by Ucon (prediction of protein disorder using predicted internal contacts)
Ucon2st - two-state prediction by Ucon
MD - raw score by MD (prediction of protein disorder using orthogonal sources)
MD_rel - reliability of the prediction by MD; values range from 0-9. 9=strong prediction
MD2st - two-state prediction by MD

Prediction of transmembrane alpha-helices and signal peptides

TMHMM

...

Phobius & PolyPhobius

...

OCTOPUS & SPOCTOPUS

...

SignalP

...

TargetP

...

Prediction of GO terms

GOPET

...

Pfam

...

ProtFun 2.2

...

Retrieved from "https://i12r-studfilesrv.informatik.tu-muenchen.de/wiki/index.php?title=ASPA_Sequence_Based_Predictions&oldid=3500"