Difference between revisions of "DLD"
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− | + | '''Dyhydroliponamide dehydrogenase'''(DLD) is the E3 subunit of [[Maple_Syrup_Urine_Disease#Branched-chain_.CE.B1-keto_acids_dehydrogenase_complex|branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex]]. The gene which encodes DLD locates on chromosome 7. |
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− | It locates on chromosome 7. |
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+ | [[File:Protein-DLD-1zy8.png|thumb|right|300px|Several DLD complexed with cofactor FAD (pdb: 1zy8)]] |
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==Reference sequence== |
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==Disease causing mutations== |
==Disease causing mutations== |
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+ | Several disease causing mutations are reported in [http://www.omim.org/entry/238331 OMIM]. Following table summarize the reported allelic variations. All these reported mutations can cause '''dihydrolipoamide dehydrogenase deficiency'''. |
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+ | | 1 || deletion || LYS72GLU |
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+ | | 2 || substitution || PRO488LEU |
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+ | | 3 || insertion || 1-BP INS, 105A |
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+ | | 4 || substitution || ARG495GLY |
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+ | | 5 || substitution || GLY229CYS |
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+ | | 6 || substitution || ILE393THR |
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+ | | 7 || change of splice site || IVS9, G-A, +1 |
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+ | | 8 || substitution || GLU375LYS |
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+ | | 9 || substitution || MET361VAL |
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+ | | 10|| substitution || ASP479VAL |
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+ | | 11|| substitution || ARG482GLY |
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+ | | 12|| substitution || ILE47THR |
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==References== |
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Latest revision as of 18:18, 28 April 2013
Dyhydroliponamide dehydrogenase(DLD) is the E3 subunit of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex. The gene which encodes DLD locates on chromosome 7.
Contents
Reference sequence
Genomic sequence
>gi|190358513:5001-35058 Homo sapiens dihydrolipoamide dehydrogenase (DLD), RefSeqGene on chromosome 7 GATGACGTAGGCTGCGCCTGTGCATGCGCAGGGAGGGGAGACCTTGGCGGAGCGGCGGAGGCGCCCAGCG GAGGTGAAAGTATTGGCGGAAAGGAAAATACAGCGGAAAAATGCAGAGCTGGAGTCGTGTGTACTGCTCC TTGGCCAAGGTGAGGGCCGAGTAGGTGAGGTCGTGTTGAGCCAGAGGCACGGAAGGTCCCGCTCAGTGGG TCCGGTACGCGGCTTAACCGTGTTGGGCTGGCGGAGGCGGGCGCCTGGGCCGCACCACCCCTGGCCCCGC CTCTGCACTGGCTCAGCCCGGCCCTGGGCTCCGAGGTGGCCGCTCATCCTGCAGCAGGCGAGGGACGGGG CTGGGCCCAGGCTGTGGCGAGTCCTTTCGGGTTGTGTGACGGCCGGCGGTCACACATGCCACACCCCCAA GCCTGGGCCGAGGGCCATCCCGGTCACACATAGGCCTCTACCTTGGAGGAAGTGTAAGCCACCCATGTCC CGTATAGTCTGGCTTTTTATACCATTTGCCTTTTTCTCATCCTAATTCTGATCCCTGAGTGGCCTAAGTT TATGCAGTGGGCAGGTAACCCTGGGGTCACTTCTTGAATGGTTTAGATCCAGTCAGCTCCAACAGATAGC CCTCGGAATTCCCCTAAGGTCTTGTCAGTGTTGGCAGCTTTCAACTGGTGTTCATTGCCATCTCTCACGA CTTCCTGGAGGCTTAAATCTTTAATTGCAGCAGGTTATCAGAACAACTCTCCTTTTTAATCTGCTTACCA GATACAGCCAAATTGTGTGTATGTGGCACCGTGGCTGGGTACTATGTTAGTGGAGACCTTAAAAATAATA 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>gi|91199539|ref|NM_000108.3| Homo sapiens dihydrolipoamide dehydrogenase (DLD), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA GATGACGTAGGCTGCGCCTGTGCATGCGCAGGGAGGGGAGACCTTGGCGGAGCGGCGGAGGCGCCCAGCG GAGGTGAAAGTATTGGCGGAAAGGAAAATACAGCGGAAAAATGCAGAGCTGGAGTCGTGTGTACTGCTCC TTGGCCAAGAGAGGCCATTTCAATCGAATATCTCATGGCCTACAGGGACTTTCTGCAGTGCCTCTGAGAA CTTACGCAGATCAGCCGATTGATGCTGATGTAACAGTTATAGGTTCTGGTCCTGGAGGATATGTTGCTGC TATTAAAGCTGCCCAGTTAGGCTTCAAGACAGTCTGCATTGAGAAAAATGAAACACTTGGTGGAACATGC TTGAATGTTGGTTGTATTCCTTCTAAGGCTTTATTGAACAACTCTCATTATTACCATATGGCCCATGGAA AAGATTTTGCATCTAGAGGAATTGAAATGTCCGAAGTTCGCTTGAATTTAGACAAGATGATGGAGCAGAA GAGTACTGCAGTAAAAGCTTTAACAGGTGGAATTGCCCACTTATTCAAACAGAATAAGGTTGTTCATGTC AATGGATATGGAAAGATAACTGGCAAAAATCAAGTCACTGCTACGAAAGCTGATGGCGGCACTCAGGTTA TTGATACAAAGAACATTCTTATAGCCACGGGTTCAGAAGTTACTCCTTTTCCTGGAATCACGATAGATGA AGATACAATAGTGTCATCTACAGGTGCTTTATCTTTAAAAAAAGTTCCAGAAAAGATGGTTGTTATTGGT GCAGGAGTAATAGGTGTAGAATTGGGTTCAGTTTGGCAAAGACTTGGTGCAGATGTGACAGCAGTTGAAT TTTTAGGTCATGTAGGTGGAGTTGGAATTGATATGGAGATATCTAAAAACTTTCAACGCATCCTTCAAAA ACAGGGGTTTAAATTTAAATTGAATACAAAGGTTACTGGTGCTACCAAGAAGTCAGATGGAAAAATTGAT GTTTCTATTGAAGCTGCTTCTGGTGGTAAAGCTGAAGTTATCACTTGTGATGTACTCTTGGTTTGCATTG GCCGACGACCCTTTACTAAGAATTTGGGACTAGAAGAGCTGGGAATTGAACTAGATCCCAGAGGTAGAAT TCCAGTCAATACCAGATTTCAAACTAAAATTCCAAATATCTATGCCATTGGTGATGTAGTTGCTGGTCCA ATGCTGGCTCACAAAGCAGAGGATGAAGGCATTATCTGTGTTGAAGGAATGGCTGGTGGTGCTGTGCACA TTGACTACAATTGTGTGCCATCAGTGATTTACACACACCCTGAAGTTGCTTGGGTTGGCAAATCAGAAGA GCAGTTGAAAGAAGAGGGTATTGAGTACAAAGTTGGGAAATTCCCATTTGCTGCTAACAGCAGAGCTAAG ACAAATGCTGACACAGATGGCATGGTGAAGATCCTTGGGCAGAAATCGACAGACAGAGTACTGGGAGCAC ATATTCTTGGACCAGGTGCTGGAGAAATGGTAAATGAAGCTGCTCTTGCTTTGGAATATGGAGCATCCTG TGAAGATATAGCTAGAGTCTGTCATGCACATCCGACCTTATCAGAAGCTTTTAGAGAAGCAAATCTTGCT GCGTCATTTGGCAAATCAATCAACTTTTGAATTAGAAGATTATATATATTTTTTTCTGAAATTTCCTGGG AGCTTTTGTAGAAGTCACATTCCTGAACAGGATATTCTCACAGCTCCAAGAATTTCTAGGACTGAATTAT GAAACTTTTGGAAGGTATTTAATAGGTTTGGACAAAATGGAATACTCTTATATCTATATTTTACATAAAT TTAGTATTTTGTTTCAGTGCACTAATGTGTAAGACAAAAAGCTACTTATTGTAGCATCCTGGAATATCTC CGTCAACTCATATTTTCATGCTGTTCATGAAAGATTCAATGCCCCTGAATTTAAATAGCTTTTTTCTCTG ATACAGAAAAGTTGAATTTTACATGGCTGGAGCTAGAATTTGATATGTGAACAGTTGTGTTTGAAGCACA GTGATCAAGTTATTTTTAATTTGGTTTTCACATTGGAAACAAGTCAGTCATTCAGATATGATTCAAATGT CTATAAACCGAACTGATGTAAGTAAACGGTCTCTCACTTGTTTTATTTAACCTCTAAATTCTTTCATTTT AGGGGTAGCATTTGTGTTGAAGAGGTTTTAAAGCTTCCATTGTTGTCTGCAACTCTGAAGGGTAATTATA TAGTTACCCAAATTAAGAGAGTCTATTTACGGAACTCAAATACGTGGGCATTCAAATGTATTACAGTGGG GAATGAAGATACTGAAATAAACGTCTTAAATATTCATTTACTGGTTATCATGAGTACGTGTTGAGATGGT CATAGTTTTTTTTATGACTACTTCTAGTGTATATTCTAATTTCTTTTCTAGGCCTGAATGTATCTTTATT TTCATGTTATAGGACAATATTAAGGCATTTTAAAGGTCATCATCCTTTCATCTATTTTAGATACACCTAC TAAATGTTTAATATATACTTTTGGAGAAGTACAACATAAGGGAGTCTTTAATCTGTGTTTTCCTTGGCTG GGTTAATGACTGTTTATTTAAAGAGTGTTGTAAAATTGGATGTGTGGTGTTTAAAATGGCCATGTCCTGA GGAAACTTAAGTAACAAAGTACTAAATGCTAAGTAGGCTTTTGCATATTGTAACTAAATTTAAGAATAAT TCAGATTAAGTAGTTCTGAAATTTGGTATAGATAGCATAGATTGTCTCATGCTCATGAGTGACATAATGA CCCTGGATTCTGTTACATACTTCTAAAGAAAATTGATTGTTGTCTTAGGAGGCAGTTAACTTGGCTGAAC ACCAACTCCACACTCTGTCTTGTTTGTAGGTGGCAGCAGCTGAAATCTCTTCTCAGTTGTTTTAGCTTTA GCTATGCTGCTGGAAGTCTTTCCCATGCAAGTGTGTAGTTCAGGGGTCAACCAGAGTTTGGGCAGAAGGA AGTCTGCCCCTTCTGTGCCTCCTGTTTTTTGGGGGTTTCCCCTTTATGTTCCAGCTGTTGTGGTTGCCCC ATATTCTGCCTTCTGATCCTTAACCAATAAAACTTGGCTTTTGTTTCCCCCTCAAGTGAGAACCCGTTAA AAATGAGACATTGAGCCAGTGCTGTTCACTTTTTAAGTGCCAACTTCCCTCTACTTTCCACTTGTTTATA GTTGTTTCCAGTGCCTTTAGTTTTTTCTAAAATATATTTGTTCAGAGTTTGCAGTTGCTATCAGCAGGAG GGTTGGTCTGATATCTGTGTGCTACTTTGCCATTATTGGAAGTGAACTCTGCATCTTTTTAAAAATTTGA AATCCCGGTATCATGTGAAGTGCTGTTTATGTAAATCTCAACATATCCCTTACTCAGGGAAAAAAAAGTT TTTAGTTAGGGAATAGTGAAATATAATTTAATATGGAATTCTAGCTGTAGAGTTAAATCCATCTTTAAGT GTTTACATTCAGTATGAGAATGCAAATTTATCTGTATGGGGAATAAAGTCCTAGGAATAAAACAAGTTTT AAGTGTTCA
Protein
>gi|91199540|ref|NP_000099.2| dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial precursor [Homo sapiens] MQSWSRVYCSLAKRGHFNRISHGLQGLSAVPLRTYADQPIDADVTVIGSGPGGYVAAIKAAQLGFKTVCI EKNETLGGTCLNVGCIPSKALLNNSHYYHMAHGKDFASRGIEMSEVRLNLDKMMEQKSTAVKALTGGIAH LFKQNKVVHVNGYGKITGKNQVTATKADGGTQVIDTKNILIATGSEVTPFPGITIDEDTIVSSTGALSLK KVPEKMVVIGAGVIGVELGSVWQRLGADVTAVEFLGHVGGVGIDMEISKNFQRILQKQGFKFKLNTKVTG ATKKSDGKIDVSIEAASGGKAEVITCDVLLVCIGRRPFTKNLGLEELGIELDPRGRIPVNTRFQTKIPNI YAIGDVVAGPMLAHKAEDEGIICVEGMAGGAVHIDYNCVPSVIYTHPEVAWVGKSEEQLKEEGIEYKVGK FPFAANSRAKTNADTDGMVKILGQKSTDRVLGAHILGPGAGEMVNEAALALEYGASCEDIARVCHAHPTL SEAFREANLAASFGKSINF
Neutral mutations
Disease causing mutations
Several disease causing mutations are reported in OMIM. Following table summarize the reported allelic variations. All these reported mutations can cause dihydrolipoamide dehydrogenase deficiency.
ID | Variant type | Mutation detail |
---|---|---|
1 | deletion | LYS72GLU |
2 | substitution | PRO488LEU |
3 | insertion | 1-BP INS, 105A |
4 | substitution | ARG495GLY |
5 | substitution | GLY229CYS |
6 | substitution | ILE393THR |
7 | change of splice site | IVS9, G-A, +1 |
8 | substitution | GLU375LYS |
9 | substitution | MET361VAL |
10 | substitution | ASP479VAL |
11 | substitution | ARG482GLY |
12 | substitution | ILE47THR |
References
Homo sapiens dihydrolipoamide dehydrogenase (DLD)
Homo sapiens dihydrolipoamide dehydrogenase (DLD), RefSeqGene on chromosome 7
Homo sapiens dihydrolipoamide dehydrogenase (DLD), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA
dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial precursor (Homo sapiens)