Difference between revisions of "Swissmodel 2gjx alignment"

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TARGET 1 LWPWPQNF QTSDQRYVLY PNNFQFQYDV SSAAQPGCSV LDEAFQRYRD
+
TARGET 1 LWPWPQNF QTSDQRYVLY PNNFQFQYDV SSAAQPGCSV LDEAFQRYRD
2gjxE 23 lwpwpqnf qtsdqryvly pnnfqfqydv ssaaqpgcsv ldeafqryrd
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2gjxE 23 lwpwpqnf qtsdqryvly pnnfqfqydv ssaaqpgcsv ldeafqryrd
+
TARGET ss sss sssss hh hhhhhhhhhh
+
TARGET ss sss sssss hh hhhhhhhhhh
2gjxE ss sss sssss hh hhhhhhhhhh
+
2gjxE ss sss sssss hh hhhhhhhhhh
  +
 
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TARGET 49 LLFGSGSWPR PYLTGKRHTL EKNVLVVSVV TPGCNQLPTL ESVENYTLTI
+
TARGET 49 LLFGSGSWPR PYLTGKRHTL EKNVLVVSVV TPGCNQLPTL ESVENYTLTI
2gjxE 71 llfg------ --------tl eknvlvvsvv tpgcnqlptl esvenytlti
+
2gjxE 71 llfg------ --------tl eknvlvvsvv tpgcnqlptl esvenytlti
+
TARGET hh sssss ssssss
+
TARGET hh sssss ssssss
2gjxE hh sssss ssssss
+
2gjxE hh sssss ssssss
  +
 
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TARGET 99 NDDQCLLLSE TVWGALRGLE TFSQLVWKSA EGTFFINKTE IEDFPRFPHR
+
TARGET 99 NDDQCLLLSE TVWGALRGLE TFSQLVWKSA EGTFFINKTE IEDFPRFPHR
2gjxE 121 nddqclllse tvwgalrgle tfsqlvwksa egtffinkte iedfprfphr
+
2gjxE 121 nddqclllse tvwgalrgle tfsqlvwksa egtffinkte iedfprfphr
+
TARGET s sssssss hhhhhhhh hhhhh sss ssssssss sss ss
+
TARGET s sssssss hhhhhhhh hhhhh sss ssssssss sss ss
2gjxE s sssssss hhhhhhhh hhhhh sss ssssssss sss ss
+
2gjxE s sssssss hhhhhhhh hhhhh sss ssssssss sss ss
  +
 
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TARGET 149 GLLLDTSRHY LPLSSILDTL DVMAYNKLNV FHWHLVDDPS FPYESFTFPE
+
TARGET 149 GLLLDTSRHY LPLSSILDTL DVMAYNKLNV FHWHLVDDPS FPYESFTFPE
2gjxE 171 gllldtsrhy lplssildtl dvmaynklnv fhwhlvddps fpyesftfpe
+
2gjxE 171 gllldtsrhy lplssildtl dvmaynklnv fhwhlvddps fpyesftfpe
+
TARGET ssssss hhhhhhh hhhhhh ss ssss
+
TARGET ssssss hhhhhhh hhhhhh ss ssss
2gjxE ssssss hhhhhhh hhhhhh ss ssss
+
2gjxE ssssss hhhhhhh hhhhhh ss ssss
  +
 
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TARGET 199 LMRKGSYNPV THIYTAQDVK EVIEYARLRG IRVLAEFDTP GHTLSWGPGI
+
TARGET 199 LMRKGSYNPV THIYTAQDVK EVIEYARLRG IRVLAEFDTP GHTLSWGPGI
2gjxE 221 lmrkgsynpv thiytaqdvk evieyarlrg irvlaefdtp ghtlswgpgi
+
2gjxE 221 lmrkgsynpv thiytaqdvk evieyarlrg irvlaefdtp ghtlswgpgi
+
TARGET hhhhh hhhhhhh sssss
+
TARGET hhhhh hhhhhhh sssss
2gjxE hhhhh hhhhhhh sssss
+
2gjxE hhhhh hhhhhhh sssss
  +
 
  +
 
TARGET 249 PGLLTPCYSG SEPSGTFGPV NPSLNNTYEF MSTFFLEVSS VFPDFYLHLG
+
TARGET 249 PGLLTPCYSG SEPSGTFGPV NPSLNNTYEF MSTFFLEVSS VFPDFYLHLG
2gjxE 271 pglltpcysg sepsgtfgpv npslnntyef mstfflevss vfpdfylhlg
+
2gjxE 271 pglltpcysg sepsgtfgpv npslnntyef mstfflevss vfpdfylhlg
+
TARGET sssss sssss s h h hhhhhhhhhh h sss
+
TARGET sssss sssss s h h hhhhhhhhhh h sss
2gjxE sssss sssss s h h hhhhhhhhhh h sss
+
2gjxE sssss sssss s h h hhhhhhhhhh h sss
  +
 
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TARGET 299 GDEVDFTCWK SNPEIQDFMR KKGFGEDFKQ LESFYIQTLL DIVSSYGKGY
+
TARGET 299 GDEVDFTCWK SNPEIQDFMR KKGFGEDFKQ LESFYIQTLL DIVSSYGKGY
2gjxE 321 gdevdftcwk snpeiqdfmr kkgfgedfkq lesfyiqtll divssygkgy
+
2gjxE 321 gdevdftcwk snpeiqdfmr kkgfgedfkq lesfyiqtll divssygkgy
+
TARGET hhhh hhhhhhh hh hh hhhhhhhhhh hhhhh ss
+
TARGET hhhh hhhhhhh hh hh hhhhhhhhhh hhhhh ss
2gjxE hhhh hhhhhhh hh hh hhhhhhhhhh hhhhh ss
+
2gjxE hhhh hhhhhhh hh hh hhhhhhhhhh hhhhh ss
  +
 
  +
 
TARGET 349 VVWQEVFDNK VKIQPDTIIQ VWREDIPVNY MKELELVTKA GFRALLSAPW
+
TARGET 349 VVWQEVFDNK VKIQPDTIIQ VWREDIPVNY MKELELVTKA GFRALLSAPW
2gjxE 371 vvwqevfdnk vkiqpdtiiq vwredipvny mkelelvtka gfrallsapw
+
2gjxE 371 vvwqevfdnk vkiqpdtiiq vwredipvny mkelelvtka gfrallsapw
+
TARGET ssss sss s h hhhhhhhhhh sssss
+
TARGET ssss sss s h hhhhhhhhhh sssss
2gjxE ss hhhh sss s h hhhhhhhhhh sssss
+
2gjxE ss hhhh sss s h hhhhhhhhhh sssss
  +
 
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TARGET 399 YLNRISYGPD WKDFYIVEPL AFEGTPEQKA LVIGGEACMW GEYVDNTNLV
+
TARGET 399 YLNRISYGPD WKDFYIVEPL AFEGTPEQKA LVIGGEACMW GEYVDNTNLV
2gjxE 421 ylnrisygpd wkdfyvvepl afegtpeqka lviggeacmw geyvdntnlv
+
2gjxE 421 ylnrisygpd wkdfyvvepl afegtpeqka lviggeacmw geyvdntnlv
+
TARGET hhhhh hhhhh sssssss h
+
TARGET hhhhh hhhhh sssssss h
2gjxE hhhhh hhhhh sssssss h
+
2gjxE hhhhh hhhhh sssssss h
  +
 
  +
 
TARGET 449 PRLWPRAGAV AERLWSNKLT SDLTFAYERL SHFRCELLRR GVQAQPLNVG
+
TARGET 449 PRLWPRAGAV AERLWSNKLT SDLTFAYERL SHFRCELLRR GVQAQPLNVG
2gjxE 471 prlwpragav aerlwsnklt sdltfayerl shfrcellrr gvqaqplnvg
+
2gjxE 471 prlwpragav aerlwsnklt sdltfayerl shfrcellrr gvqaqplnvg
+
TARGET hhh hhhh hhhhh hhhhhhhh hhhhhhhhhh
+
TARGET hhh hhhh hhhhh hhhhhhhh hhhhhhhhhh
2gjxE hhh hhhh hhhhh hhhhhhhh hhhhhhhhhh
+
2gjxE hhh hhhh hhhhh hhhhhhhh hhhhhhhhhh
  +
 
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TARGET 499 FCEQEFEQ
+
TARGET 499 FCEQEFEQ
2gjxE 521 fceqefeq-
+
2gjxE 521 fceqefeq-
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TARGET
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TARGET
2gjxE
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2gjxE

Latest revision as of 12:26, 2 June 2012

TARGET    1       LWPWPQNF QTSDQRYVLY PNNFQFQYDV SSAAQPGCSV LDEAFQRYRD
2gjxE     23      lwpwpqnf qtsdqryvly pnnfqfqydv ssaaqpgcsv ldeafqryrd
                                                                      
TARGET                  ss sss sssss                     hh hhhhhhhhhh
2gjxE                   ss sss sssss                     hh hhhhhhhhhh
 

TARGET    49    LLFGSGSWPR PYLTGKRHTL EKNVLVVSVV TPGCNQLPTL ESVENYTLTI
2gjxE     71    llfg------ --------tl eknvlvvsvv tpgcnqlptl esvenytlti
                                                                      
TARGET          hh                        sssss                 ssssss
2gjxE           hh                        sssss                 ssssss


TARGET    99    NDDQCLLLSE TVWGALRGLE TFSQLVWKSA EGTFFINKTE IEDFPRFPHR
2gjxE     121   nddqclllse tvwgalrgle tfsqlvwksa egtffinkte iedfprfphr
                                                                      
TARGET          s  sssssss   hhhhhhhh hhhhh sss    ssssssss sss     ss
2gjxE           s  sssssss   hhhhhhhh hhhhh sss    ssssssss sss     ss


TARGET    149   GLLLDTSRHY LPLSSILDTL DVMAYNKLNV FHWHLVDDPS FPYESFTFPE
2gjxE     171   gllldtsrhy lplssildtl dvmaynklnv fhwhlvddps fpyesftfpe
                                                                      
TARGET          ssssss        hhhhhhh hhhhhh  ss ssss                 
2gjxE           ssssss        hhhhhhh hhhhhh  ss ssss                 


TARGET    199   LMRKGSYNPV THIYTAQDVK EVIEYARLRG IRVLAEFDTP GHTLSWGPGI
2gjxE     221   lmrkgsynpv thiytaqdvk evieyarlrg irvlaefdtp ghtlswgpgi
                                                                      
TARGET                          hhhhh hhhhhhh     sssss               
2gjxE                           hhhhh hhhhhhh     sssss               


TARGET    249   PGLLTPCYSG SEPSGTFGPV NPSLNNTYEF MSTFFLEVSS VFPDFYLHLG
2gjxE     271   pglltpcysg sepsgtfgpv npslnntyef mstfflevss vfpdfylhlg
                                                                      
TARGET            sssss         sssss s    h   h hhhhhhhhhh h   sss   
2gjxE             sssss         sssss s    h   h hhhhhhhhhh h   sss   


TARGET    299   GDEVDFTCWK SNPEIQDFMR KKGFGEDFKQ LESFYIQTLL DIVSSYGKGY
2gjxE     321   gdevdftcwk snpeiqdfmr kkgfgedfkq lesfyiqtll divssygkgy
                                                                      
TARGET                hhhh    hhhhhhh hh      hh hhhhhhhhhh hhhhh   ss
2gjxE                 hhhh    hhhhhhh hh      hh hhhhhhhhhh hhhhh   ss


TARGET    349   VVWQEVFDNK VKIQPDTIIQ VWREDIPVNY MKELELVTKA GFRALLSAPW
2gjxE     371   vvwqevfdnk vkiqpdtiiq vwredipvny mkelelvtka gfrallsapw
                                                                      
TARGET          ssss              sss s        h hhhhhhhhhh   sssss   
2gjxE           ss  hhhh          sss s        h hhhhhhhhhh   sssss   


TARGET    399   YLNRISYGPD WKDFYIVEPL AFEGTPEQKA LVIGGEACMW GEYVDNTNLV
2gjxE     421   ylnrisygpd wkdfyvvepl afegtpeqka lviggeacmw geyvdntnlv
                                                                      
TARGET                     hhhhh           hhhhh   sssssss           h
2gjxE                      hhhhh           hhhhh   sssssss           h


TARGET    449   PRLWPRAGAV AERLWSNKLT SDLTFAYERL SHFRCELLRR GVQAQPLNVG
2gjxE     471   prlwpragav aerlwsnklt sdltfayerl shfrcellrr gvqaqplnvg
                                                                      
TARGET          hhh   hhhh hhhhh        hhhhhhhh hhhhhhhhhh           
2gjxE           hhh   hhhh hhhhh        hhhhhhhh hhhhhhhhhh           


TARGET    499   FCEQEFEQ                                              
2gjxE     521   fceqefeq-                                             
                                                                      
TARGET                                                                
2gjxE