Difference between revisions of "Mapping SNPs HEXA/DETAIL"

From Bioinformatikpedia
(Created page with "<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN"> <HTML> <HEAD> <META HTTP-EQUIV="CONTENT-TYPE" CONTENT="text/html; charset=windows-1252"> <TITLE></TITLE> <META N…")
 
Line 1: Line 1:
 
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
  
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
 
<HTML>
  
<HTML>
  +
−
<HEAD>
  
−
<META HTTP-EQUIV="CONTENT-TYPE" CONTENT="text/html; charset=windows-1252">
  
−
<TITLE></TITLE>
  
−
<META NAME="GENERATOR" CONTENT="OpenOffice.org 3.1 (Win32)">
  
−
<META NAME="AUTHOR" CONTENT="Sabrina Link">
  
−
<META NAME="CREATED" CONTENT="20110616;13170400">
  
−
<META NAME="CHANGEDBY" CONTENT="Sabrina Link">
  
−
<META NAME="CHANGED" CONTENT="20110616;17162300">
  
−
<STYLE TYPE="text/css">
  
−
<!--
  
−
@page { margin: 2cm }
  
−
P { margin-bottom: 0.21cm }
  
−
TD P { margin-bottom: 0cm }
  
−
-->
  
−
</STYLE>
  
−
</HEAD>
  
 
<BODY LANG="en-GB" DIR="LTR">
  
<BODY LANG="en-GB" DIR="LTR">
 
<TABLE WIDTH=100% BORDER=1 BORDERCOLOR="#000000" CELLPADDING=4 CELLSPACING=0>
  
<TABLE WIDTH=100% BORDER=1 BORDERCOLOR="#000000" CELLPADDING=4 CELLSPACING=0>
Line 31: Line 16:
 
<TR VALIGN=TOP>
  
<TR VALIGN=TOP>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>Pos</P>
 +
<P>Codonposition</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>As</P>
 +
<P>Aminoacid</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>Forw.</P>
 +
<P>Forward.</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>Rev</P>
 +
<P>Reverse</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>K. for</P>
 +
<P>Comp. forward</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>k. rev</P>
 +
<P>Comp. reverse</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>F Asch</P>
 +
<P>Forward mutation change</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>R Asch</P>
 +
<P>Reverse mutation change</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>K.F Asc</P>
 +
<P>Comp. Forward mutation change</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>K.R.Asc</P>
 +
<P>Komp. Reverse mutation change</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 118: Line 103:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">TCG Ser</SPAN></P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #008000">TCG Ser</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 124: Line 109:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">AGC Ser</SPAN></P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #008000">AGC Ser</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 137: Line 122:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P><FONT COLOR="#800000"><SPAN STYLE="background: #ff0000">AGT Ser</SPAN></FONT></P>
 +
<P><FONT COLOR="#000000"><SPAN STYLE="background: #ff0000">AGT Ser</SPAN></FONT></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 143: Line 128:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">TCA Ser </SPAN>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #000080">TCA Ser </SPAN>
 
</P>
  
</P>
 
</TD>
  
</TD>
Line 150: Line 135:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AGC Ser</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">AGC Ser</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 156: Line 141:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">TCG Ser</SPAN></P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #000080">TCG Ser</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 209: Line 194:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>N Asn</P>
 +
<P>Asn</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 246: Line 231:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GTT Val</P>
 +
<P>GTT Val</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 258: Line 243:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GCT</P>
 +
<P>GCT Ala</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCG</P>
 +
<P>TCG Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CGA</P>
 +
<P>CGA Arg</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AGC</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">AGC Ser</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 292: Line 277:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TGC</P>
 +
<P>TGC Cys</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CGT</P>
 +
<P>CGT Arg</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>ACG</P>
 +
<P>ACG Thr</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GCA</P>
 +
<P>GCA Ala</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 366: Line 351:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CTT</P>
 +
<P>CTT Leu</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TTC</P>
 +
<P>TTC Phe</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GAA</P>
 +
<P>GAA Glu</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AAG</P>
 +
<P>AAG Lys</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 400: Line 385:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CCT</P>
 +
<P>CCT Pro</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCC</P>
 +
<P>TCC Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GGA</P>
 +
<P>GGA Gly</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AGG</P>
 +
<P>AGG Arg</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 422: Line 407:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>ACT Thr</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">ACT Thr</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCA Ser</P>
 +
<P>TCA Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 434: Line 419:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>ACC</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">ACC Thr</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CCA</P>
 +
<P>CCA Pro</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TGG</P>
 +
<P>TGG Trp</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GGT</P>
 +
<P>GGT Gly</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 496: Line 481:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GTA Val</P>
 +
<P>GTA Val</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 502: Line 487:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CAT His</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">CAT His</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TAC Tyr</P>
 +
<P>TAC Tyr</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CTA</P>
 +
<P>CTA Leu</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>ATC</P>
 +
<P>ATC Ile</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GAT</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">GAT Asp</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TAG</P>
 +
<P>TAG TER</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 536: Line 521:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCA Tyr</P>
 +
<P>TCA Tyr</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 542: Line 527:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>ACT</P>
 +
<P>ACT Thr</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCA</P>
 +
<P>TCA Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCA</P>
 +
<P>TCA Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>ACT</P>
 +
<P>ACT Thr</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 576: Line 561:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GAC</P>
 +
<P>GAC Asp</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CAG</P>
 +
<P>CAG Gln</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CTG</P>
 +
<P>CTG Leu</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GTC</P>
 +
<P>GTC Val</P>
−
</TD>
  
−
</TR>
  
−
<TR VALIGN=TOP>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 677: Line 620:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>W Trp</P>
 +
<P>Trp</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 689: Line 632:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCA Ser</P>
 +
<P>TCA Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 751: Line 694:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCA Ser</P>
 +
<P>TCA Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 867: Line 810:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GTT Val</P>
 +
<P>GTT Val</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AAC Asn</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">AAC Asn</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 882: Line 825:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GAC Asp</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">GAC Asp</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 898: Line 841:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>ATT Ile</P>
 +
<P>ATT Ile</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 913: Line 856:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCA Ser</P>
 +
<P>TCA Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 932: Line 875:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TAT Tyr</P>
 +
<P>TAT Tyr</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TAT Tyr</P>
 +
<P>TAT Tyr</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>ATA Ile</P>
 +
<P>ATA Ile</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>ATA Ile</P>
 +
<P>ATA Ile</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TAC Tyr</P>
 +
<P>TAC Tyr</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CAT His</P>
 +
<P>CAT His</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 953: Line 896:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GTA Val</P>
 +
<P>GTA Val</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 1,003: Line 946:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>L Leu</P>
 +
<P>Leu</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 1,012: Line 955:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CTT Leu</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">CTT Leu</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
Line 1,018: Line 961:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AAA</P>
 +
<P>AAA Lys</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AAA</P>
 +
<P>AAA Lys</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TTT</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">TTT Phe</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TTT</P>
 +
<P>TTT Phe</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 1,052: Line 995:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CAA</P>
 +
<P>CAA Gln</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AAC</P>
 +
<P>AAC Asn</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GTT</P>
 +
<P>GTT Val</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TTG</P>
 +
<P>TTG Leu</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 1,086: Line 1,029:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CCA</P>
 +
<P>CCA Pro</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>ACC</P>
 +
<P>ACC Thr</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GGT</P>
 +
<P>GGT Gly</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TGG</P>
 +
<P>TGG Trp</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 1,145: Line 1,088:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>VAL ok</P>
 +
<P>Val</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TGA</P>
 +
<P>TGA TER</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AGT</P>
 +
<P>AGT Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>ACT</P>
 +
<P>ACT Thr</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCA</P>
 +
<P>TCA Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AGA</P>
 +
<P>AGA Arg</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AGA</P>
 +
<P>AGA Arg</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCT</P>
 +
<P>TCT Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCT</P>
 +
<P>TCT Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 1,182: Line 1,125:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TTG</P>
 +
<P>TTG Leu</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GTT</P>
 +
<P>GTT Val</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AAC</P>
 +
<P>AAC Asn</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CAA</P>
 +
<P>CAA Gln</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TAG</P>
 +
<P>TAG TER</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GAT</P>
 +
<P>GAT Asp</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>ATC</P>
 +
<P>ATC Ile</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CTA</P>
 +
<P>CTA Leu</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 1,216: Line 1,159:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GTT</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">GTT Val</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TTG</P>
 +
<P>TTG Leu</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CAA</P>
 +
<P>CAA Gln</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AAC</P>
 +
<P>AAC Asn</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GTA</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">GTA Val</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>ATG</P>
 +
<P>ATG Met</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CAT</P>
 +
<P>CAT His</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TAC</P>
 +
<P>TAC Tyr</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 1,266: Line 1,209:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CGA</P>
 +
<P>CGA Arg</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AGC</P>
 +
<P>AGC Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GCT</P>
 +
<P>GCT Ala</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCG</P>
 +
<P>TCG Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 1,304: Line 1,247:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCG</P>
 +
<P>TCG Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GCT</P>
 +
<P>GCT Ala</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AGC</P>
 +
<P>AGC Arg</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CGA</P>
 +
<P>CGA Arg</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 1,342: Line 1,285:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GTC</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">GTC Val</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CTG</P>
 +
<P>CTG Leu</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CAG</P>
 +
<P>CAG Gln</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GAC</P>
 +
<P>GAC Asp</P>
  +
</TD>
  +
</TR>
  +
<TR VALIGN=TOP>
  +
<TD WIDTH=10%>
  +
<P><BR>
  +
</P>
  +
</TD>
  +
<TD WIDTH=10%>
  +
<P><BR>
  +
</P>
  +
</TD>
  +
<TD WIDTH=10%>
  +
<P><BR>
  +
</P>
  +
</TD>
  +
<TD WIDTH=10%>
  +
<P><BR>
  +
</P>
  +
</TD>
  +
<TD WIDTH=10%>
  +
<P><BR>
  +
</P>
  +
</TD>
  +
<TD WIDTH=10%>
  +
<P><BR>
  +
</P>
  +
</TD>
  +
<TD WIDTH=10%>
  +
<P><BR>
  +
</P>
  +
</TD>
  +
<TD WIDTH=10%>
  +
<P><BR>
  +
</P>
  +
</TD>
  +
<TD WIDTH=10%>
  +
<P><BR>
  +
</P>
  +
</TD>
  +
<TD WIDTH=10%>
  +
<P><BR>
  +
</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 1,368: Line 1,353:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CCC Pro</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">CCC Pro</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CCC Pro
+
<P><SPAN STYLE="background: #000080">CCC Pro </SPAN>
 
</P>
  
</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AGG</P>
 +
<P>AGG Arg</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GGA</P>
 +
<P>GGA Gly</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCC</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #ff0000">TCC Ser</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CCT</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #000080">CCT Pro</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 1,406: Line 1,391:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CCG Pro</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #008000">CCG Pro</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CAG</P>
 +
<P>CAG Gln</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GAC</P>
 +
<P>GAC Asp</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>GTC</P>
 +
<P>GTC Val</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>CTG</P>
 +
<P><SPAN STYLE="background: #008000">CTG Leu</SPAN></P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 1,443: Line 1,428:
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TCA</P>
 +
<P>TCA Ser</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>ACT</P>
 +
<P>ACT Thr</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>AGT</P>
 +
<P>AGT Arg</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
<TD WIDTH=10%>
  
<TD WIDTH=10%>
−
<P>TGA</P>
 +
<P>TGA TER</P>
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>
Line 1,649: Line 1,634:
 
<P>TTT</P>
  
<P>TTT</P>
 
<P>Phe</P>
  
<P>Phe</P>
−
</TD>
  
−
</TR>
  
−
<TR VALIGN=TOP>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
</TR>
  
−
<TR VALIGN=TOP>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
</TR>
  
−
<TR VALIGN=TOP>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
</TR>
  
−
<TR VALIGN=TOP>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
</TR>
  
−
<TR VALIGN=TOP>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
</TR>
  
−
<TR VALIGN=TOP>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
</TR>
  
−
<TR VALIGN=TOP>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
−
</TD>
  
−
<TD WIDTH=10%>
  
−
<P><BR>
  
−
</P>
  
 
</TD>
  
</TD>
 
</TR>
  
</TR>

Revision as of 16:39, 16 June 2011

<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN"> <HTML>

<BODY LANG="en-GB" DIR="LTR">

<COL WIDTH=26*> <COL WIDTH=26*> <COL WIDTH=26*> <COL WIDTH=26*> <COL WIDTH=26*> <COL WIDTH=26*> <COL WIDTH=26*> <COL WIDTH=26*> <COL WIDTH=26*> <COL WIDTH=26*>

Codonposition

Aminoacid

Forward.

Reverse

Comp. forward

Comp. reverse

Forward mutation change

Reverse mutation change

Comp. Forward mutation change

Komp. Reverse mutation change

3

Ser

TTC Phe

CTT Leu

AAG Lys

GAA Glu

CTC Leu

CTC Leu

GAG Glu

GAG Glu



GTT Val

TTG Leu

CAA Gln

AAC Asn

GCT Ala

TCG Ser

CGA Arg

AGC Ser



AGT Ser

TGA TER

TCA Ser

ACT Thr

AGC Ser

CGA Arg

TCG Ser

GCT Ala











29

Asn

TTC Phe

CTT Leu

AAG Lys

GAA Glu

CTC Leu

CTC Leu

GAG Glu

GAG Glu



GTT Val

TTG Leu

CAA Gln

AAC Asn

GCT Ala

TCG Ser

CGA Arg

AGC Ser



TGT Cys

TGT Gys

ACA Thr

ACA Thr

TGC Cys

CGT Arg

ACG Thr

GCA Ala











109

Thr

TTT Phe

TTT Phe

AAA Lys

AAA Lys

CTT Leu

TTC Phe

GAA Glu

AAG Lys



CTT Leu

TTC Phe

GAA Glu

AAG Lys

CCT Pro

TCC Ser

GGA Gly

AGG Arg



ACT Thr

TCA Ser

TGA TER

AGT Ser

ACC Thr

CCA Pro

TGG Trp

GGT Gly











179

His

GTA Val

ATG Met

CAT His

TAC Tyr

CTA Leu

ATC Ile

GAT Asp

TAG TER



AGT Ser

TGA TER

TCA Tyr

ACT Thr

ACT Thr

TCA Ser

TCA Ser

ACT Thr



GAG Glu

GAG Glu

CTC Leu

CTC Leu

GAC Asp

CAG Gln

CTG Leu

GTC Val











203

Trp

TGA TER

AGT Ser

ACT Thr

TCA Ser

CGA Arg

AGC Ser

GCT Ala

TCG Ser



CTG Leu

GTC Val

GAC Ala

CAG Gln

CCG Pro

GCC Ala

GGC Gly

CGG Arg



ACT Thr

TCA Ser

TGA TER

AGT Ser

ACC Thr

CCA Pro

TGG Trp

GGT Gly





















208

D Asp

TTG Leu

GTT Val

AAC Asn

CAA Gln

CTG Leu

GTC Val

GAC Asp

CAG Gln



ATT Ile

TTA Leu

TAA TER

AAT Asn

ACT Thr

TCA Ser

TGA TER

AGT Met



TAT Tyr

TAT Tyr

ATA Ile

ATA Ile

TAC Tyr

CAT His

ATG Met

GTA Val











248

Leu

GAA Glu

AAG Lys

CTT Leu

TTC Phe

AAA Lys

AAA Lys

TTT Phe

TTT Phe



CGA Arg

AGC Ser

GCT Ala

TCG Ser

CAA Gln

AAC Asn

GTT Val

TTG Leu



CCG Pro

GCC Ala

GGC Gly

CGG Arg

CCA Pro

ACC Thr

GGT Gly

TGG Trp











324

Val

TGA TER

AGT Ser

ACT Thr

TCA Ser

AGA Arg

AGA Arg

TCT Ser

TCT Ser



TTG Leu

GTT Val

AAC Asn

CAA Gln

TAG TER

GAT Asp

ATC Ile

CTA Leu



GTT Val

TTG Leu

CAA Gln

AAC Asn

GTA Val

ATG Met

CAT His

TAC Tyr







CGA Arg

AGC Ser

GCT Ala

TCG Ser







TCG Ser

GCT Ala

AGC Arg

CGA Arg







GTC Val

CTG Leu

CAG Gln

GAC Asp











446

Pro

GGG Gly

GGG Gly

CCC Pro

CCC Pro

AGG Arg

GGA Gly

TCC Ser

CCT Pro



CGG Arg

GGC Gly

GCC Ala

CCG Pro

CAG Gln

GAC Asp

GTC Val

CTG Leu



TCG Ser

GCT Ala

AGC Ser

CGA Arg

TCA Ser

ACT Thr

AGT Arg

TGA TER





















476

Arg

GTT Gly

TTG Leu

CAA Gln

AAC Asn

ATT

Ile

TTA

Leu

TAA

TER

AAT

Asn



AGT Ser

TGA TER

TCA Ser

ACT Thr

AAT

Asn

TAA

TER

TTA

Leu

ATT

Ile



AAG Lys

GAA Glu

TTC Phe

CTT Leu

AAA

Lys

AAA

Lys

TTT

Leu

TTT

Phe


</BODY> </HTML>

Retrieved from "https://i12r-studfilesrv.informatik.tu-muenchen.de/wiki/index.php?title=Mapping_SNPs_HEXA/DETAIL&oldid=5840"