Difference between revisions of "Homology-modelling HEXA/swissmodel 3CUI"

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TARGET 9 SLLLAAAFAG RATALWPWPQ NFQTSDQRYV LYPNNFQFQY
+
TARGET 9 SLLLAAAFAG RATALWPWPQ NFQTSDQRYV LYPNNFQFQY
3cuiA 1 attlkeaadg ---------- --agrdfgfa ldpn------
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3cuiA 1 attlkeaadg ---------- --agrdfgfa ldpn------
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TARGET hhhhhh s ss sssss s sssssss
+
TARGET hhhhhh s ss sssss s sssssss
3cuiA hhhhhhh h sssss s
+
3cuiA hhhhhhh h sssss s
  +
 
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TARGET 49 DVSSAAQPGC SVLDEAFQRY RDLLFGSGSW PRPYLTGKRH TLEKNVLVVS
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TARGET 49 DVSSAAQPGC SVLDEAFQRY RDLLFGSGSW PRPYLTGKRH TLEKNVLVVS
3cuiA 23 ---------- rlseaqykai adsefn---- ---------l vvaenamkwd
+
3cuiA 23 ---------- rlseaqykai adsefn---- ---------l vvaenamkwd
+
TARGET ssssss s hhhhhh hhh ssss s ssssss sssss
+
TARGET ssssss s hhhhhh hhh ssss s ssssss sssss
3cuiA hhhhh hhh s s ssss
+
3cuiA hhhhh hhh s s ssss
  +
 
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TARGET 99 VVTPGCNQLP TLESVENYTL TINDDQCLLL SETVWGALRG LETFSQLVWK
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TARGET 99 VVTPGCNQLP TLESVENYTL TINDDQCLLL SETVWGALRG LETFSQLVWK
3cuiA 50 atepsqnsfs ---------- ---------- ----fgagdr vasyaadtgk
+
3cuiA 50 atepsqnsfs ---------- ---------- ----fgagdr vasyaadtgk
+
TARGET ss s sssss s ssss ssshhhhh hhhhhhhh
+
TARGET ss s sssss s ssss ssshhhhh hhhhhhhh
3cuiA hhhhh hhhhhhhh
+
3cuiA hhhhh hhhhhhhh
  +
 
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TARGET 149 SAEGTFFINK TEIEDFPRFP HRGLLLDTSR HYLPLSSILD TLDVMAYNKL
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TARGET 149 SAEGTFFINK TEIEDFPRFP HRGLLLDTSR HYLPLSSILD TLDVMAYNKL
3cuiA 76 elyghtlvwh sqlpdwakn- ---------- ---------- -lngsafesa
+
3cuiA 76 elyghtlvwh sqlpdwakn- ---------- ---------- -lngsafesa
+
TARGET hhh sssssss sssss ss hhhhhh
+
TARGET hhh sssssss sssss ss hhhhhh
3cuiA sss hhhh hhhhhh
+
3cuiA sss hhhh hhhhhh
  +
 
  +
 
TARGET 199 NVFHWHLVDD PSFPYESFTF PELMRKGSYN PVTHIYTAQD VKEVIEYARL
+
TARGET 199 NVFHWHLVDD PSFPYESFTF PELMRKGSYN PVTHIYTAQD VKEVIEYARL
3cuiA 104 mvnhvtkvad ---------- ---------- ---------- ----------
+
3cuiA 104 mvnhvtkvad ---------- ---------- ---------- ----------
+
TARGET hhhhhhhhh sss sss sssss sss ssssss sss
+
TARGET hhhhhhhhh sss sss sssss sss ssssss sss
3cuiA hhhhhhhhhh
+
3cuiA hhhhhhhhhh
  +
 
  +
 
TARGET 249 RGIRVLAEFD TPGHTLSWGP GIPGLLTPCY SGSEPSGTFG PVNPSLNNTY
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TARGET 249 RGIRVLAEFD TPGHTLSWGP GIPGLLTPCY SGSEPSGTFG PVNPSLNNTY
3cuiA 114 ---------h fegkvaswd- ----vvneaf adgggrrqds afqqklgn--
+
3cuiA 114 ---------h fegkvaswd- ----vvneaf adgggrrqds afqqklgn--
+
TARGET sss sss sss ss s sss hhhhh
+
TARGET sss sss sss ss s sss hhhhh
3cuiA h h ssss s ss s sss hhhhh
+
3cuiA h h ssss s ss s sss hhhhh
  +
 
  +
 
TARGET 299 EFMSTFFLEV SSVFPDFYLH LGGDEVDFTC WKSNPEIQDF MRKKGFGEDF
+
TARGET 299 EFMSTFFLEV SSVFPDFYLH LGGDEVDFTC WKSNPEIQDF MRKKGFGEDF
3cuiA 148 gyietafraa raadptaklc indynvegin aksns-lydl vkd--fkarg
+
3cuiA 148 gyietafraa raadptaklc indynvegin aksns-lydl vkd--fkarg
+
TARGET hhhhhhhhh hhhsss ss sss
+
TARGET hhhhhhhhh hhhsss ss sss
3cuiA hhhhhhhhhh hhh sss sss hhhhh hhhh hhh hhhh
+
3cuiA hhhhhhhhhh hhh sss sss hhhhh hhhh hhh hhhh
  +
 
  +
 
TARGET 349 KQLESFYIQT LLDIVSSYGK GYVVWQEVFD NKVKIQPDTI IQVWREDIPV
+
TARGET 349 KQLESFYIQT LLDIVSSYGK GYVVWQEVFD NKVKIQPDTI IQVWREDIPV
3cuiA 195 vpldcvgfqs hlivgqvpgd frqnlqrfad lgvdvr---- ----------
+
3cuiA 195 vpldcvgfqs hlivgqvpgd frqnlqrfad lgvdvr---- ----------
+
TARGET sssssss ssss sss hhhhhhhhhh sss sss ssss ssss
+
TARGET sssssss ssss sss hhhhhhhhhh sss sss ssss ssss
3cuiA sssssss ssss hhhhhhhhhh sss
+
3cuiA sssssss ssss hhhhhhhhhh sss
  +
 
  +
 
TARGET 399 NYMKELELVT KAGFRALLSA PWYLNRISYG PDWKDFYIVE PLAFEGTPEQ
+
TARGET 399 NYMKELELVT KAGFRALLSA PWYLNRISYG PDWKDFYIVE PLAFEGTPEQ
3cuiA 231 --iteldirm rtps------ ----datkla tqaadykkvv qacmqvtrcq
+
3cuiA 231 --iteldirm rtps------ ----datkla tqaadykkvv qacmqvtrcq
+
TARGET ssss ssss sssssss s ssss hhhhh hhhhhhhhhh hhhsss s
+
TARGET ssss ssss sssssss s ssss hhhhh hhhhhhhhhh hhhsss s
3cuiA ss ssss ss hhhhh hhhhhhhhhh hhhh s
+
3cuiA ss ssss ss hhhhh hhhhhhhhhh hhhh s
  +
 
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TARGET 449 KALVIGGEAC MWGEYVDNTN LVPRLWPRAG AVAERLWSNK LTSDLTFAYE
+
TARGET 449 KALVIGGEAC MWGEYVDNTN LVPRLWPRAG AVAERLWSNK LTSDLTFAYE
3cuiA 269 gvtvwg---- ----itdkys wvpdvfp--g egaalvwd-- ------asya
+
3cuiA 269 gvtvwg---- ----itdkys wvpdvfp--g egaalvwd-- ------asya
+
TARGET sssssss s ssss hhhh s ssss
+
TARGET sssssss s ssss hhhh s ssss
3cuiA ssss hhhh s ssss sss s
+
3cuiA ssss hhhh s ssss sss s
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TARGET 499 RLSHFRCELL RRGV
+
TARGET 499 RLSHFRCELL RRGV
3cuiA 301 kkpayaavme afga-
+
3cuiA 301 kkpayaavme afga-
+
TARGET hhhhhhh h
+
TARGET hhhhhhh h
3cuiA ss hhhhhhh h
+
3cuiA ss hhhhhhh h

Revision as of 13:56, 12 June 2011

TARGET    9                SLLLAAAFAG RATALWPWPQ NFQTSDQRYV LYPNNFQFQY
3cuiA     1                attlkeaadg ---------- --agrdfgfa ldpn------
                                                                      
TARGET                        hhhhhh           s ss   sssss s sssssss 
3cuiA                         hhhhhhh              h  sssss s         


TARGET    49    DVSSAAQPGC SVLDEAFQRY RDLLFGSGSW PRPYLTGKRH TLEKNVLVVS
3cuiA     23    ---------- rlseaqykai adsefn---- ---------l vvaenamkwd
                                                                      
TARGET              ssssss s   hhhhhh hhh   ssss s   ssssss sssss     
3cuiA                           hhhhh hhh  s              s ssss       


TARGET    99    VVTPGCNQLP TLESVENYTL TINDDQCLLL SETVWGALRG LETFSQLVWK
3cuiA     50    atepsqnsfs ---------- ---------- ----fgagdr vasyaadtgk
                                                                      
TARGET                  ss s sssss  s ssss         ssshhhhh hhhhhhhh  
3cuiA                                                 hhhhh hhhhhhhh  


TARGET    149   SAEGTFFINK TEIEDFPRFP HRGLLLDTSR HYLPLSSILD TLDVMAYNKL
3cuiA     76    elyghtlvwh sqlpdwakn- ---------- ---------- -lngsafesa
                                                                      
TARGET                          hhh   sssssss         sssss ss  hhhhhh
3cuiA           sss            hhhh                             hhhhhh 


TARGET    199   NVFHWHLVDD PSFPYESFTF PELMRKGSYN PVTHIYTAQD VKEVIEYARL
3cuiA     104   mvnhvtkvad ---------- ---------- ---------- ----------
                                                                      
TARGET          hhhhhhhhh  sss  sss   sssss  sss ssssss          sss  
3cuiA           hhhhhhhhhh                                            


TARGET    249   RGIRVLAEFD TPGHTLSWGP GIPGLLTPCY SGSEPSGTFG PVNPSLNNTY
3cuiA     114   ---------h fegkvaswd- ----vvneaf adgggrrqds afqqklgn--
                                                                      
TARGET               sss       sss    sss     ss s   sss    hhhhh     
3cuiA                    h h    ssss      s   ss s   sss    hhhhh     


TARGET    299   EFMSTFFLEV SSVFPDFYLH LGGDEVDFTC WKSNPEIQDF MRKKGFGEDF
3cuiA     148   gyietafraa raadptaklc indynvegin aksns-lydl vkd--fkarg
                                                                       
TARGET           hhhhhhhhh hhhsss  ss sss                             
3cuiA           hhhhhhhhhh hhh    sss sss        hhhhh hhhh hhh  hhhh  


TARGET    349   KQLESFYIQT LLDIVSSYGK GYVVWQEVFD NKVKIQPDTI IQVWREDIPV
3cuiA     195   vpldcvgfqs hlivgqvpgd frqnlqrfad lgvdvr---- ----------
                                                                      
TARGET             sssssss ssss  sss  hhhhhhhhhh    sss sss ssss  ssss
3cuiA              sssssss ssss       hhhhhhhhhh    sss                


TARGET    399   NYMKELELVT KAGFRALLSA PWYLNRISYG PDWKDFYIVE PLAFEGTPEQ
3cuiA     231   --iteldirm rtps------ ----datkla tqaadykkvv qacmqvtrcq
                                                                      
TARGET          ssss  ssss sssssss  s ssss hhhhh hhhhhhhhhh hhhsss   s
3cuiA             ss  ssss ss              hhhhh hhhhhhhhhh hhhh     s


TARGET    449   KALVIGGEAC MWGEYVDNTN LVPRLWPRAG AVAERLWSNK LTSDLTFAYE
3cuiA     269   gvtvwg---- ----itdkys wvpdvfp--g egaalvwd-- ------asya
                                                                      
TARGET          sssssss  s ssss        hhhh    s ssss                 
3cuiA           ssss                   hhhh    s ssss sss            s


TARGET    499   RLSHFRCELL RRGV                                       
3cuiA     301   kkpayaavme afga-                                      
                                                                       
TARGET             hhhhhhh h                                          
3cuiA           ss hhhhhhh h