Difference between revisions of "Hemochromatosis SS Alignments"
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===Q08209=== |
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MGPRARPALLLLMLLQTAVLQGRLLRSHSLHYLFMGASEQDLGLSLFEALGYVDDQLFVFYDHESRRVEPRTPWVSSRISSQMWLQLSQSLKGWDHMFTVDFWTIMENHNHSKESHTLQVILGCEMQEDNSTEGYWKYGYDGQDHLEFCPDTLDWRAAEPRAWPTKLEWERHKIRARQNRAYLERDCPAQLQQLLELGRGVLDQQVPPLVKVTHHVTSSVTTLRCRALNYYPQNITMKWLKDKQPMDAKEFEPKDVLPNGDGTYQGWITLAVPPGEEQRYTCQVEHPGLDQPLIVIWEPSPSGTLVIGVISGIAVFVVILFIGILFIILRKRQGSRGAMGHYVLAERE |
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Latest revision as of 22:14, 27 May 2013
Order: DSSPseq,Uniprot seq, dssp assignment,reprof,psipred
Q08209
MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESVALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMDAFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLNIC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- MSEPKAIDPKLSTTDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESVALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHGQFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSERVYDACMDAFDCLPLAALMNQQFLCVHGGLSPEINTLDDIRKLDRFKEPPAYGPMCDILWSDPLEDFGNEKTQEHFTHNTVRGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQFNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSDDELGSEEDGFDGATAAARKEVIRNKIRAIGKMARVFSVLREESESVLTLKGLTPTGMLPSGVLSGGKQTLQSATVEAIEADEAIKGFSPQHKITSFEEAKGLDRINERMPPRRDAMPSDANLNSINKALTSETNGTDSNGSNSSNIQ CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCEECCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCEEECHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCEEEEEEECCEEEEEEECCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- CCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCHHHHHHHHCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCHHHEEEEECCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCECCCCCCCCCCCCCCHHHHEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHECCCCCCCCCCHHHEHCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCC CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
Q030201
[25, 297]
-------------------------RSHSLHYLFMGASEQDLGLSLFEALGYVDDQLFVFYDHESRRVEPRTPWVSSRISSQMWLQLSQSLKGWDHMFTVDFWTIMENHNHSKESHTLQVILGaEMQEDNSTEGYWKYGYDGQDHLEFCPDTLDWRAAEPRAWPTKLEWERHKIRARQNRAYLERDaPAQLQQLLELGRGVLDQQVPPLVKVTHHVTSSVTTLRbRALNYYPQNITMKWLKDKQPMDAKEFEPKDVLPNGDGTYQGWITLAVPPGEEQRYTbQVEHPGLDQPLIVIW--------------------------------------------------- MGPRARPALLLLMLLQTAVLQGRLLRSHSLHYLFMGASEQDLGLSLFEALGYVDDQLFVFYDHESRRVEPRTPWVSSRISSQMWLQLSQSLKGWDHMFTVDFWTIMENHNHSKESHTLQVILGCEMQEDNSTEGYWKYGYDGQDHLEFCPDTLDWRAAEPRAWPTKLEWERHKIRARQNRAYLERDCPAQLQQLLELGRGVLDQQVPPLVKVTHHVTSSVTTLRCRALNYYPQNITMKWLKDKQPMDAKEFEPKDVLPNGDGTYQGWITLAVPPGEEQRYTCQVEHPGLDQPLIVIWEPSPSGTLVIGVISGIAVFVVILFIGILFIILRKRQGSRGAMGHYVLAERE -------------------------CCEEEEEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCEEEEEEECCCCCEEECCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEEECCEEEEEEEHHHCEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEEEEEECCCCCEEEEEECCEECCHHHCCCCEEEECCCCCEEEEEEEEECCCHHHHEEEEEECCCCCCCEEEEC--------------------------------------------------- CCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEECCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHCHCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHCHCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEEECCEECCCCCCCCCCEEECCCEEEEEEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCC
P10775
MNLDIHCEQLSDARWTELLPLLQQYEVVRLDDCGLTEEHCKDIGSALRANPSLTELCLRTNELGDAGVHLVLQGLQSPTCKIQKLSLQNCSLTEAGCGVLPSTLRSLPTLRELHLSDNPLGDAGLRLLCEGLLDPQCHLEKLQLEYCRLTAASCEPLASVLRATRALKELTVSNNDIGEAGARVLGQGLADSACQLETLRLENCGLTPANCKDLCGIVASQASLRELDLGSNGLGDAGIAELCPGLLSPASRLKTLWLWECDITASGCRDLCRVLQAKETLKELSLAGNKLGDEGARLLCESLLQPGCQLESLWVKSCSLTAACCQHVSLMLTQNKHLLELQLSSNKLGDSGIQELCQALSQPGTTLRVLCLGDCEVTNSGCSSLASLLLANRSLRELDLSNNCVGDPGVLQLLGSLEQPGCALEQLVLYDTYWTEEVEDRLQALEGSKPGLRVIS MNLDIHCEQLSDARWTELLPLLQQYEVVRLDDCGLTEEHCKDIGSALRANPSLTELCLRTNELGDAGVHLVLQGLQSPTCKIQKLSLQNCSLTEAGCGVLPSTLRSLPTLRELHLSDNPLGDAGLRLLCEGLLDPQCHLEKLQLEYCRLTAASCEPLASVLRATRALKELTVSNNDIGEAGARVLGQGLADSACQLETLRLENCGLTPANCKDLCGIVASQASLRELDLGSNGLGDAGIAELCPGLLSPASRLKTLWLWECDITASGCRDLCRVLQAKETLKELSLAGNKLGDEGARLLCESLLQPGCQLESLWVKSCSLTAACCQHVSLMLTQNKHLLELQLSSNKLGDSGIQELCQALSQPGTTLRVLCLGDCEVTNSGCSSLASLLLANRSLRELDLSNNCVGDPGVLQLLGSLEQPGCALEQLVLYDTYWTEEVEDRLQALEGSKPGLRVIS CCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHCHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEC CEEEEEHHHCCHCCHHHHHHHHHHHHEHECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEECC CEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHCHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCCCCHHCHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEECC
Q9X0E6
SLILVYSTFPNEEKALEIGRKLLEKRLIACFNAFEIRSGYWWKGEIVQDKEWAAIFKTTEEKEKELYEELRKLHPYETPAIFTLKVENVLTEYXNWLRESV MILVYSTFPNEEKALEIGRKLLEKRLIACFNAFEIRSGYWWKGEIVQDKEWAAIFKTTEEKEKELYEELRKLHPYETPAIFTLKVENVLTEYMNWLRESVL CEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEECCEEEEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHC CEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCC CEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEEECCHHCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCC
