Difference between revisions of "CD task6 protocol"
From Bioinformatikpedia
(→SIFT mutation table) |
|||
| Line 64: | Line 64: | ||
==SIFT mutation table== |
==SIFT mutation table== |
||
| − | |||
| − | |||
| − | Probabilities |
||
| − | Each row corresponds to a position in the reference protein. Below each position is the fraction of sequences that contain one of the basic amino acids. A low fraction indicates the position is either severely gapped or unalignable and has little information. Expect poor prediction at these positions. |
||
| − | Each column corresponds to one of the twenty amino acids. |
||
| − | Each entry contains the score at a particular position (row) for an amino acid substitution (column). Substitutions predicted to be intolerant are highlighted in red. |
||
| − | |||
| − | |||
| − | pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y |
||
| − | 1M 0.61 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 2T 0.61 0.18 0.19 0.07 0.04 0.02 0.06 0.02 0.05 0.06 0.05 0.02 0.12 0.08 0.05 0.04 0.73 1.00 0.08 0.01 0.02 |
||
| − | 3S 0.67 0.15 0.01 0.01 0.01 0.00 0.02 0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.02 0.02 0.01 0.01 1.00 0.24 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 4C 0.67 1.00 0.17 0.34 0.51 0.38 0.56 0.32 0.28 0.50 0.50 0.16 0.35 0.31 0.37 0.39 0.69 0.47 0.42 0.10 0.52 |
||
| − | 5H 0.56 0.52 0.06 0.40 0.66 0.13 0.31 0.27 0.17 1.00 0.30 0.10 0.40 0.64 0.73 0.82 0.67 0.44 0.25 0.04 0.18 |
||
| − | 6I 0.67 0.13 0.04 0.03 0.03 0.09 0.12 0.02 0.89 0.04 0.35 0.07 0.03 0.03 0.02 0.04 0.07 0.08 1.00 0.02 0.07 |
||
| − | 7A 0.61 1.00 0.17 0.22 0.35 0.20 0.35 0.16 0.36 0.34 0.44 0.13 0.22 0.34 0.25 0.24 0.59 0.46 0.74 0.05 0.24 |
||
| − | 8E 0.56 0.20 0.02 0.13 0.54 0.13 0.12 0.10 0.07 0.86 0.14 0.05 0.16 0.11 0.28 1.00 0.18 0.17 0.10 0.02 0.07 |
||
| − | 9E 0.56 0.40 0.03 0.44 1.00 0.03 0.20 0.07 0.10 0.58 0.16 0.05 0.36 0.22 0.32 0.27 0.38 0.37 0.15 0.01 0.02 |
||
| − | 10H 0.56 0.08 0.01 0.17 0.37 0.02 0.07 0.13 0.02 0.12 0.03 0.01 0.08 1.00 0.09 0.07 0.07 0.05 0.03 0.01 0.03 |
||
| − | 11I 0.78 0.15 0.01 0.01 0.01 0.04 0.01 0.00 0.54 0.01 0.60 0.22 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 1.00 0.00 0.01 |
||
| − | 12Q 0.89 0.12 0.01 0.05 0.16 0.02 0.07 0.07 0.04 0.73 0.24 0.03 0.10 0.07 0.33 1.00 0.17 0.11 0.06 0.01 0.04 |
||
| − | 13K 0.89 0.01 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 0.01 0.01 0.42 0.01 0.00 0.01 0.01 0.12 1.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 |
||
| − | 14V 0.89 0.01 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.23 0.00 0.03 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 1.00 0.00 0.00 |
||
| − | 15A 0.89 1.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.23 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 0.02 0.01 0.01 0.05 0.02 0.09 0.00 0.00 |
||
| − | 16I 0.89 0.01 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 1.00 0.00 0.13 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.71 0.00 0.00 |
||
| − | 17F 0.89 0.16 0.04 0.02 0.04 1.00 0.03 0.04 0.37 0.04 0.81 0.16 0.03 0.05 0.05 0.04 0.06 0.41 0.48 0.03 0.11 |
||
| − | 18G 0.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 19G 0.89 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 20T 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 21H 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 22G 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 23N 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 24E 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 25L 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.06 0.00 0.87 1.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.03 0.00 0.00 |
||
| − | pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y |
||
| − | 26T 1.00 0.07 0.15 0.02 0.02 0.01 0.03 0.01 0.02 0.02 0.02 0.01 0.04 0.03 0.02 0.01 1.00 0.37 0.03 0.00 0.01 |
||
| − | 27G 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 28V 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.16 0.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 1.00 0.00 0.00 |
||
| − | 29F 1.00 0.36 0.22 0.14 0.19 0.73 0.23 0.38 0.33 0.20 0.51 0.16 0.22 0.14 0.21 0.24 0.28 0.35 0.42 0.13 1.00 |
||
| − | 30L 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 31V 1.00 0.63 0.03 0.01 0.03 0.02 0.05 0.01 0.13 0.03 0.09 0.03 0.01 0.04 0.02 0.02 0.06 0.10 1.00 0.00 0.01 |
||
| − | 32K 1.00 0.06 0.01 0.02 0.08 0.01 0.04 0.04 0.02 1.00 0.05 0.02 0.43 0.04 0.11 0.64 0.05 0.19 0.03 0.01 0.02 |
||
| − | 33H 1.00 0.35 0.12 0.14 0.19 0.48 0.23 1.00 0.27 0.24 0.61 0.22 0.21 0.14 0.33 0.38 0.28 0.27 0.35 0.13 0.91 |
||
| − | 34W 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 |
||
| − | 35L 1.00 0.08 0.02 0.01 0.02 0.07 0.01 0.01 0.23 0.06 1.00 0.09 0.02 0.02 0.15 0.03 0.02 0.05 0.27 0.01 0.02 |
||
| − | 36E 1.00 0.10 0.01 0.18 0.48 0.01 0.05 0.17 0.02 0.74 0.04 0.01 0.07 0.04 1.00 0.19 0.09 0.07 0.04 0.00 0.01 |
||
| − | 37N 1.00 0.11 0.00 0.32 0.03 0.00 0.07 0.10 0.00 0.03 0.01 0.00 1.00 0.02 0.02 0.01 0.05 0.02 0.00 0.00 0.01 |
||
| − | 38G 1.00 1.00 0.09 0.39 0.59 0.06 0.84 0.12 0.11 0.79 0.21 0.08 0.34 0.50 0.43 0.51 0.63 0.36 0.23 0.03 0.08 |
||
| − | 39A 1.00 1.00 0.03 0.13 0.42 0.02 0.37 0.03 0.04 0.17 0.07 0.03 0.11 0.10 0.11 0.10 0.45 0.47 0.08 0.01 0.02 |
||
| − | 40E 1.00 0.24 0.00 0.10 1.00 0.00 0.03 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.02 0.03 0.05 0.01 0.04 0.02 0.02 0.00 0.01 |
||
| − | 41I 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 1.00 0.00 0.61 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.46 0.00 0.01 |
||
| − | 42Q 1.00 0.41 0.03 0.26 0.53 0.05 0.17 0.29 0.10 0.54 0.16 0.06 0.22 0.13 1.00 0.45 0.31 0.49 0.14 0.02 0.07 |
||
| − | 43R 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 44T 1.00 1.00 0.10 0.27 0.45 0.06 0.48 0.10 0.17 0.76 0.24 0.09 0.28 0.35 0.34 0.50 0.75 0.66 0.34 0.03 0.07 |
||
| − | 45G 1.00 0.06 0.01 0.12 0.04 0.01 1.00 0.03 0.00 0.04 0.01 0.00 0.30 0.03 0.03 0.02 0.80 0.04 0.01 0.00 0.01 |
||
| − | 46L 1.00 0.04 0.01 0.01 0.01 0.77 0.01 0.01 0.32 0.01 1.00 0.19 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.26 0.01 0.02 |
||
| − | 47E 1.00 0.56 0.04 0.50 1.00 0.04 0.28 0.09 0.14 0.69 0.27 0.08 0.37 0.21 0.46 0.39 0.65 0.50 0.24 0.01 0.04 |
||
| − | 48V 1.00 0.85 0.12 0.02 0.04 0.03 0.02 0.01 0.25 0.04 0.17 0.05 0.02 0.06 0.03 0.02 0.07 0.48 1.00 0.01 0.01 |
||
| − | 49K 1.00 0.71 0.05 0.61 0.97 0.05 0.36 0.12 0.18 1.00 0.29 0.14 0.48 0.26 0.56 0.53 0.69 0.57 0.32 0.02 0.04 |
||
| − | 50P 1.00 0.32 0.06 0.02 0.05 0.05 0.02 0.01 0.48 0.05 0.32 0.09 0.03 1.00 0.04 0.03 0.06 0.22 0.91 0.01 0.02 |
||
| − | pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y |
||
| − | 51F 1.00 0.18 0.17 0.02 0.04 0.61 0.03 0.04 0.51 0.05 1.00 0.21 0.04 0.05 0.05 0.04 0.05 0.12 0.65 0.04 0.14 |
||
| − | 52I 1.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.04 0.00 0.00 1.00 0.01 0.97 0.05 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.09 0.00 0.01 |
||
| − | 53T 1.00 0.75 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.00 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.03 0.01 0.01 0.28 1.00 0.03 0.00 0.01 |
||
| − | 54N 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 55P 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 56R 1.00 0.45 0.04 0.16 0.37 0.07 0.25 0.15 0.14 1.00 0.21 0.07 0.23 0.18 0.40 0.94 0.31 0.27 0.16 0.03 0.11 |
||
| − | 57A 1.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 58V 1.00 0.05 0.01 0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 0.05 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.02 0.26 1.00 0.00 0.00 |
||
| − | 59K 1.00 0.25 0.01 0.14 1.00 0.01 0.05 0.02 0.02 0.25 0.03 0.01 0.05 0.04 0.09 0.06 0.16 0.06 0.03 0.00 0.01 |
||
| − | 60K 1.00 0.24 0.01 0.03 0.10 0.01 0.14 0.05 0.03 1.00 0.06 0.02 0.07 0.05 0.13 0.60 0.08 0.07 0.04 0.01 0.03 |
||
| − | 61C 1.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 62T 1.00 0.50 0.12 0.06 0.10 0.07 0.05 0.04 0.44 0.14 0.32 0.10 0.09 0.13 0.09 0.16 0.28 0.68 1.00 0.02 0.05 |
||
| − | 63R 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 64Y 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 |
||
| − | 65I 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 1.00 0.00 0.13 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.43 0.00 0.00 |
||
| − | 66D 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 67C 1.00 0.77 0.22 0.29 0.42 0.71 0.40 0.58 0.55 0.69 0.80 0.27 0.44 0.31 0.46 0.66 0.74 0.89 0.82 0.19 1.00 |
||
| − | 68D 1.00 0.01 0.00 1.00 0.05 0.00 0.02 0.01 0.00 0.01 0.00 0.00 0.02 0.01 0.10 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 69L 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.11 0.00 1.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 |
||
| − | 70N 1.00 0.01 0.00 0.03 0.01 0.00 0.03 0.01 0.00 0.02 0.00 0.00 1.00 0.01 0.10 0.01 0.02 0.01 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 71R 1.00 0.02 0.00 0.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.06 0.02 0.09 0.01 0.01 0.02 1.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 |
||
| − | 72I 1.00 0.46 0.07 0.03 0.06 0.04 0.02 0.02 0.35 0.06 0.21 0.07 0.05 0.08 0.05 0.04 0.29 0.43 1.00 0.01 0.02 |
||
| − | 73F 1.00 0.11 0.09 0.17 0.05 1.00 0.10 0.04 0.05 0.04 0.10 0.03 0.10 0.04 0.03 0.03 0.10 0.06 0.06 0.03 0.15 |
||
| − | 74D 1.00 0.23 0.05 0.19 0.10 0.03 0.11 0.04 0.07 0.11 0.07 0.03 0.24 0.12 0.09 0.07 0.76 1.00 0.11 0.02 0.04 |
||
| − | 75L 1.00 0.92 0.16 0.65 1.00 0.47 0.51 0.43 0.39 0.92 0.64 0.22 0.60 0.36 0.65 0.64 0.91 0.83 0.54 0.13 0.64 |
||
| − | pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y |
||
| − | 76E 1.00 0.21 0.02 0.38 1.00 0.02 0.10 0.04 0.05 0.23 0.08 0.03 0.13 0.09 0.18 0.12 0.29 0.32 0.16 0.01 0.02 |
||
| − | 77N 1.00 0.79 0.21 0.33 0.38 0.76 0.49 0.56 0.49 0.41 0.89 0.28 0.51 0.29 0.37 0.42 0.66 0.60 0.62 0.19 1.00 |
||
| − | 78L 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.03 0.00 1.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.10 0.00 0.00 |
||
| − | 79G 1.00 0.36 0.10 0.55 0.24 0.05 0.73 0.13 0.05 0.25 0.08 0.03 0.70 0.16 0.16 0.20 1.00 0.28 0.09 0.02 0.09 |
||
| − | 80K 1.00 0.88 0.05 0.58 0.93 0.05 0.36 0.12 0.18 1.00 0.29 0.15 0.50 0.26 0.64 0.54 0.80 0.54 0.27 0.02 0.04 |
||
| − | 81K 1.00 0.68 0.05 0.60 1.00 0.05 0.34 0.11 0.17 0.87 0.27 0.10 0.44 0.31 0.53 0.50 0.72 0.58 0.26 0.02 0.03 |
||
| − | 82M 1.00 0.80 0.08 0.63 1.00 0.15 0.42 0.20 0.24 0.92 0.38 0.14 0.52 0.29 0.60 0.55 0.75 0.60 0.36 0.05 0.19 |
||
| − | 83S 1.00 0.62 0.07 0.43 0.65 0.11 0.36 0.14 0.18 0.62 0.30 0.10 0.43 0.28 0.41 0.37 1.00 0.97 0.32 0.03 0.13 |
||
| − | 84E 1.00 0.44 0.03 0.52 1.00 0.03 0.24 0.08 0.10 0.53 0.20 0.06 0.36 0.27 0.37 0.29 0.47 0.33 0.16 0.01 0.03 |
||
| − | 85D 1.00 0.17 0.02 1.00 0.09 0.01 0.11 0.03 0.02 0.09 0.03 0.01 0.49 0.05 0.06 0.05 0.40 0.33 0.03 0.01 0.02 |
||
| − | 86L 1.00 0.14 0.03 0.03 0.05 0.19 0.03 0.03 0.40 0.05 1.00 0.22 0.03 0.05 0.05 0.04 0.05 0.09 0.32 0.03 0.05 |
||
| − | 87P 0.94 0.05 0.01 0.01 0.01 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 1.00 0.01 0.01 0.29 0.03 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 88Y 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 |
||
| − | 89E 1.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 90V 1.00 0.09 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.22 0.00 0.03 0.01 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.02 1.00 0.00 0.00 |
||
| − | 91R 1.00 0.11 0.01 0.06 0.15 0.02 0.07 0.20 0.04 1.00 0.08 0.03 0.25 0.06 0.48 0.84 0.10 0.22 0.05 0.01 0.03 |
||
| − | 92R 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 93A 1.00 1.00 0.01 0.00 0.01 0.00 0.12 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.03 0.01 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 94Q 1.00 0.10 0.01 0.02 0.13 0.02 0.07 0.08 0.04 0.70 0.09 0.03 0.09 0.07 0.91 1.00 0.08 0.10 0.17 0.01 0.04 |
||
| − | 95E 1.00 0.02 0.00 0.05 1.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.02 0.01 0.00 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 0.07 |
||
| − | 96I 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 1.00 0.00 0.69 0.03 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.07 0.00 0.01 |
||
| − | 97N 1.00 0.04 0.01 0.14 0.05 0.02 0.11 0.13 0.01 0.05 0.02 0.01 1.00 0.03 0.03 0.03 0.08 0.04 0.01 0.01 0.16 |
||
| − | 98H 1.00 0.45 0.03 0.19 0.39 0.05 0.17 0.59 0.10 0.98 0.18 0.06 0.22 0.14 1.00 0.85 0.38 0.25 0.14 0.02 0.07 |
||
| − | 99L 1.00 0.06 0.01 0.01 0.02 0.14 0.01 0.01 0.44 0.12 1.00 0.19 0.01 0.02 0.03 0.02 0.02 0.04 0.20 0.02 0.02 |
||
| − | 100F 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.29 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.03 0.28 |
||
| − | pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y |
||
| − | 101G 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 102P 1.00 0.14 0.01 0.01 0.01 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.03 0.01 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 103K 1.00 0.12 0.00 0.01 0.02 0.00 0.02 0.01 0.01 1.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.02 0.04 0.02 0.02 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 104D 0.89 0.14 0.01 0.23 0.05 0.01 1.00 0.17 0.00 0.05 0.01 0.00 0.31 0.03 0.03 0.03 0.09 0.04 0.01 0.00 0.02 |
||
| − | 105S 0.83 0.06 0.01 0.02 0.01 0.00 0.11 0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.03 0.02 0.01 0.01 1.00 0.29 0.02 0.00 0.00 |
||
| − | 106E 0.94 0.67 0.09 0.76 1.00 0.05 0.45 0.12 0.16 0.81 0.26 0.09 0.47 0.32 0.60 0.46 0.69 0.50 0.25 0.02 0.04 |
||
| − | 107D 1.00 0.34 0.01 1.00 0.88 0.02 0.09 0.04 0.04 0.22 0.06 0.02 0.11 0.09 0.51 0.10 0.35 0.12 0.06 0.01 0.02 |
||
| − | 108S 1.00 1.00 0.01 0.00 0.01 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.22 0.01 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 109Y 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.67 0.00 0.00 0.02 0.00 0.24 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 0.02 0.04 1.00 |
||
| − | 110D 1.00 0.01 0.00 1.00 0.01 0.00 0.03 0.01 0.00 0.01 0.00 0.00 0.18 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 111I 1.00 0.08 0.02 0.01 0.02 0.56 0.02 0.01 0.77 0.03 0.95 0.16 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.06 1.00 0.02 0.04 |
||
| − | 112I 1.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 1.00 0.00 0.20 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.11 0.58 0.00 0.01 |
||
| − | 113F 1.00 0.05 0.02 0.01 0.01 0.75 0.02 0.01 0.84 0.02 1.00 0.13 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.04 0.59 0.01 0.03 |
||
| − | 114D 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 115L 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 116H 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 117N 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 118T 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 119T 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 120S 1.00 0.39 0.01 0.01 0.01 0.00 0.04 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 0.02 0.01 0.01 1.00 0.03 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 121N 1.00 0.01 0.00 0.03 0.01 0.00 0.02 0.07 0.00 0.01 0.00 0.00 1.00 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 122M 1.00 0.05 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.00 0.04 0.02 0.07 1.00 0.02 0.02 0.01 0.01 0.06 0.29 0.05 0.00 0.01 |
||
| − | 123G 1.00 0.04 0.01 0.03 0.02 0.00 1.00 0.01 0.00 0.02 0.01 0.00 0.03 0.02 0.10 0.01 0.03 0.01 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 124C 1.00 0.84 0.31 0.34 0.46 0.14 0.44 0.14 0.17 0.45 0.26 0.10 0.47 0.26 0.31 0.29 0.91 1.00 0.32 0.04 0.17 |
||
| − | 125T 1.00 0.16 0.22 0.06 0.04 0.01 0.06 0.02 0.04 0.05 0.04 0.02 0.10 0.07 0.04 0.03 0.49 1.00 0.07 0.01 0.02 |
||
| − | pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y |
||
| − | 126L 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.09 0.00 0.00 0.22 0.00 1.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.03 0.00 0.00 |
||
| − | 127I 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 1.00 0.00 0.26 0.13 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.04 0.00 0.00 |
||
| − | 128L 1.00 0.19 0.02 0.01 0.02 0.08 0.03 0.01 0.37 0.03 1.00 0.10 0.02 0.03 0.03 0.02 0.16 0.08 0.23 0.01 0.02 |
||
| − | 129E 1.00 0.30 0.05 0.38 1.00 0.26 0.26 0.25 0.13 0.43 0.22 0.07 0.26 0.14 0.28 0.28 0.26 0.21 0.17 0.05 0.26 |
||
| − | 130D 0.94 0.30 0.03 0.76 0.40 0.03 0.24 0.08 0.07 0.62 0.12 0.04 1.00 0.12 0.24 0.21 0.85 0.27 0.23 0.01 0.03 |
||
| − | 131S 1.00 0.08 0.01 0.02 0.01 0.00 0.19 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 1.00 0.20 0.02 0.00 0.01 |
||
| − | 132R 0.89 0.44 0.03 0.44 0.59 0.04 0.23 0.23 0.11 1.00 0.18 0.06 0.44 0.16 0.67 0.82 0.43 0.62 0.17 0.01 0.03 |
||
| − | 133N 1.00 0.05 0.00 1.00 0.27 0.01 0.06 0.02 0.10 0.06 0.01 0.01 0.42 0.03 0.06 0.03 0.06 0.04 0.01 0.00 0.01 |
||
| − | 134N 1.00 0.85 0.11 0.81 1.00 0.29 0.48 0.36 0.30 0.93 0.51 0.17 0.68 0.39 0.63 0.59 0.89 0.67 0.46 0.08 0.38 |
||
| − | 135F 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 136L 1.00 0.49 0.10 0.06 0.13 0.09 0.04 0.05 0.49 0.13 0.38 0.11 0.08 0.12 0.09 0.08 0.14 0.38 1.00 0.02 0.07 |
||
| − | 137I 1.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.69 0.01 1.00 0.15 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.28 0.00 0.01 |
||
| − | 138Q 1.00 0.04 0.01 0.06 0.07 0.01 0.05 0.47 0.01 0.12 0.03 0.01 0.06 0.03 1.00 0.09 0.04 0.03 0.02 0.00 0.02 |
||
| − | 139M 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.05 0.00 0.84 1.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.03 0.00 0.00 |
||
| − | 140F 1.00 0.48 0.22 0.04 0.08 0.24 0.05 0.07 0.44 0.08 0.42 0.19 0.06 0.10 0.07 0.07 0.10 0.28 1.00 0.03 0.12 |
||
| − | 141H 1.00 0.09 0.02 0.27 0.12 0.03 0.21 1.00 0.02 0.25 0.05 0.02 0.88 0.07 0.11 0.68 0.25 0.10 0.03 0.01 0.06 |
||
| − | 142Y 1.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.02 0.08 0.01 0.01 0.01 0.00 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.00 1.00 |
||
| − | 143I 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 1.00 0.00 0.79 0.04 0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 0.01 0.08 0.00 0.01 |
||
| − | 144K 1.00 0.13 0.01 0.04 0.16 0.02 0.07 0.08 0.06 1.00 0.11 0.03 0.09 0.08 0.46 0.48 0.09 0.11 0.23 0.01 0.04 |
||
| − | 145T 0.94 0.75 0.05 0.64 1.00 0.05 0.38 0.13 0.19 0.96 0.33 0.11 0.52 0.27 0.60 0.55 0.73 0.63 0.29 0.02 0.05 |
||
| − | 146S 0.94 0.79 0.10 0.52 0.84 0.05 0.33 0.12 0.17 1.00 0.27 0.10 0.42 0.24 0.64 0.58 0.72 0.50 0.25 0.02 0.05 |
||
| − | 147L 0.89 0.40 0.21 0.15 0.20 0.57 0.24 0.40 0.48 0.22 1.00 0.36 0.31 0.16 0.23 0.26 0.30 0.30 0.46 0.14 0.78 |
||
| − | 148A 0.94 1.00 0.07 0.10 0.13 0.03 0.36 0.02 0.04 0.20 0.08 0.04 0.09 0.39 0.09 0.10 0.44 0.19 0.13 0.01 0.03 |
||
| − | 149P 0.94 0.60 0.08 0.99 0.79 0.11 1.00 0.35 0.10 0.53 0.18 0.07 0.99 0.86 0.37 0.30 0.87 0.39 0.17 0.04 0.18 |
||
| − | 150L 0.94 0.45 0.14 0.21 0.33 0.65 0.26 0.47 0.31 0.25 1.00 0.24 0.25 0.17 0.24 0.28 0.33 0.32 0.40 0.14 0.77 |
||
| − | pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y |
||
| − | 151P 0.94 0.49 0.03 0.31 0.66 0.03 0.19 0.06 0.10 0.46 0.15 0.05 0.31 1.00 0.29 0.35 0.59 0.39 0.29 0.01 0.03 |
||
| − | 152C 0.94 0.06 1.00 0.01 0.01 0.00 0.03 0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 0.02 0.01 0.01 0.15 0.03 0.09 0.00 0.00 |
||
| − | 153Y 0.94 0.59 0.18 0.28 0.39 0.70 0.37 0.56 0.41 0.43 0.68 0.23 0.37 0.26 0.37 0.44 0.50 0.46 0.53 0.18 1.00 |
||
| − | 154V 0.94 0.09 0.01 0.00 0.01 0.02 0.01 0.00 0.41 0.01 0.27 0.02 0.01 0.01 0.00 0.01 0.01 0.02 1.00 0.00 0.13 |
||
| − | 155Y 0.94 0.07 0.03 0.02 0.03 0.93 0.03 0.04 0.18 0.03 1.00 0.09 0.03 0.03 0.03 0.03 0.05 0.05 0.27 0.11 0.70 |
||
| − | 156L 0.94 0.01 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 0.00 0.06 0.00 1.00 0.04 0.00 0.01 0.07 0.00 0.00 0.01 0.03 0.00 0.00 |
||
| − | 157I 0.94 0.44 0.15 0.18 0.23 0.67 0.28 0.46 1.00 0.25 0.60 0.20 0.37 0.18 0.25 0.30 0.36 0.49 0.51 0.16 0.99 |
||
| − | 158E 0.89 0.02 0.00 0.22 1.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 0.01 0.12 0.01 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 159H 0.89 0.54 0.14 0.29 0.45 0.50 0.38 0.62 0.37 1.00 0.58 0.20 0.46 0.29 0.50 0.90 0.48 0.47 0.44 0.14 0.73 |
||
| − | 160P 0.94 0.15 0.01 0.01 0.01 0.00 0.03 0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 1.00 0.01 0.01 0.16 0.19 0.02 0.00 0.00 |
||
| − | 161S 0.94 0.75 0.05 0.59 1.00 0.05 0.49 0.12 0.18 0.87 0.32 0.10 0.49 0.26 0.58 0.52 0.77 0.56 0.27 0.02 0.04 |
||
| − | 162L 0.94 0.78 0.07 0.62 1.00 0.14 0.42 0.19 0.23 0.92 0.47 0.13 0.53 0.29 0.61 0.54 0.75 0.62 0.35 0.04 0.17 |
||
| − | 163K 0.94 0.44 0.02 0.32 0.77 0.02 0.33 0.06 0.06 1.00 0.10 0.04 0.18 0.13 0.24 0.23 0.26 0.18 0.10 0.01 0.03 |
||
| − | 164Y 0.94 0.18 0.06 0.07 0.09 0.24 0.11 0.33 0.13 0.10 0.22 0.17 0.11 0.07 0.10 0.12 0.31 0.23 0.17 0.06 1.00 |
||
| − | 165A 0.94 0.65 0.17 0.20 0.27 0.69 0.32 0.51 0.38 0.29 0.62 0.21 0.30 0.20 0.32 0.34 0.45 0.38 0.53 0.18 1.00 |
||
| − | 166T 0.94 0.20 0.04 0.51 0.18 0.03 0.31 0.20 0.05 0.19 0.06 0.03 0.60 0.12 0.13 0.10 0.67 1.00 0.08 0.02 0.06 |
||
| − | 167T 0.94 0.36 0.08 0.07 0.09 0.11 0.05 0.05 0.38 0.10 0.62 0.17 0.11 0.11 0.08 0.07 0.41 1.00 0.68 0.02 0.07 |
||
| − | 168R 0.94 0.09 0.00 0.39 0.47 0.01 0.05 0.03 0.02 0.13 0.03 0.01 0.06 0.05 0.29 1.00 0.06 0.05 0.03 0.00 0.01 |
||
| − | 169S 0.94 0.02 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 1.00 0.15 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 170I 1.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.70 0.01 0.09 0.35 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.02 1.00 0.00 0.01 |
||
| − | 171A 1.00 1.00 0.02 0.02 0.02 0.01 0.37 0.00 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.05 0.01 0.01 0.26 0.04 0.03 0.05 0.01 |
||
| − | 172K 1.00 0.04 0.00 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 1.00 0.03 0.01 0.02 0.02 0.03 0.07 0.02 0.03 0.11 0.00 0.01 |
||
| − | 173Y 1.00 0.05 0.02 0.03 0.03 0.06 0.04 1.00 0.03 0.03 0.06 0.02 0.37 0.02 0.03 0.03 0.04 0.04 0.04 0.08 0.38 |
||
| − | 174P 1.00 1.00 0.10 0.09 0.10 0.04 0.66 0.02 0.05 0.11 0.10 0.04 0.09 0.39 0.07 0.08 0.56 0.21 0.17 0.01 0.03 |
||
| − | 175V 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.89 0.00 0.46 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 1.00 0.00 0.01 |
||
| − | pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y |
||
| − | 176G 1.00 0.18 0.10 0.03 0.02 0.01 1.00 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.03 0.05 0.01 0.01 0.38 0.04 0.03 0.00 0.01 |
||
| − | 177I 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.00 0.59 0.01 1.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.41 0.00 0.01 |
||
| − | 178E 0.94 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 179V 0.94 0.02 0.01 0.00 0.00 0.03 0.01 0.00 0.36 0.01 0.76 0.15 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 1.00 0.00 0.01 |
||
| − | 180G 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 181P 0.94 0.15 0.01 0.01 0.01 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.03 0.01 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 182Q 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 183P 0.94 0.05 0.00 0.01 0.01 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 1.00 0.00 0.01 0.19 0.02 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 184Q 1.00 0.02 0.00 0.01 0.03 0.00 0.01 0.23 0.01 0.10 0.02 0.01 0.02 0.01 1.00 0.13 0.02 0.02 0.01 0.00 0.01 |
||
| − | 185G 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 186V 1.00 0.08 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.00 0.05 0.01 0.04 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.18 0.05 1.00 0.00 0.01 |
||
| − | 187L 1.00 0.22 0.07 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.11 0.01 1.00 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.02 0.06 0.33 0.00 0.01 |
||
| − | 188R 1.00 0.15 0.02 0.04 0.12 0.11 0.12 0.09 0.29 0.44 0.49 0.10 0.09 0.08 0.17 1.00 0.10 0.11 0.19 0.03 0.09 |
||
| − | 189A 1.00 1.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.02 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.20 0.11 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 190D 1.00 0.02 0.00 1.00 0.12 0.00 0.03 0.01 0.00 0.02 0.00 0.00 0.22 0.01 0.02 0.01 0.03 0.06 0.00 0.00 0.01 |
||
| − | 191I 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 1.00 0.00 0.28 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.78 0.00 0.01 |
||
| − | 192L 1.00 0.03 0.01 0.01 0.01 1.00 0.01 0.00 0.08 0.00 0.69 0.04 0.00 0.01 0.00 0.00 0.02 0.02 0.06 0.11 0.53 |
||
| − | 193D 1.00 0.66 0.04 0.86 1.00 0.04 0.30 0.10 0.15 0.72 0.32 0.08 0.38 0.22 0.56 0.41 0.78 0.51 0.22 0.01 0.03 |
||
| − | 194Q 1.00 0.19 0.01 0.07 0.16 0.01 0.07 0.05 0.04 0.89 0.07 0.03 0.09 0.06 0.64 1.00 0.39 0.10 0.05 0.01 0.02 |
||
| − | 195M 1.00 0.03 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.10 0.04 0.03 0.12 1.00 0.02 0.01 0.02 0.03 0.02 0.02 0.03 0.00 0.01 |
||
| − | 196R 1.00 0.01 0.00 0.01 0.23 0.00 0.01 0.01 0.01 0.16 0.01 0.00 0.01 0.01 0.03 1.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 |
||
| − | 197K 1.00 0.95 0.10 0.58 0.96 0.13 0.38 0.18 0.43 1.00 0.48 0.16 0.49 0.31 0.60 0.61 0.73 0.73 0.75 0.04 0.14 |
||
| − | 198M 1.00 0.03 0.01 0.00 0.01 0.06 0.01 0.00 1.00 0.01 0.95 0.41 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.24 0.01 0.01 |
||
| − | 199I 1.00 0.03 0.01 0.00 0.01 0.02 0.00 0.00 0.51 0.01 0.43 0.02 0.00 0.01 0.00 0.00 0.01 0.16 1.00 0.00 0.01 |
||
| − | 200K 1.00 0.44 0.04 0.24 0.42 0.11 0.21 0.20 0.13 1.00 0.27 0.08 0.33 0.16 0.36 0.58 0.32 0.29 0.18 0.04 0.16 |
||
| − | pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y |
||
| − | 201H 1.00 0.27 0.08 0.14 0.09 0.06 0.12 0.27 0.09 0.12 0.10 0.04 0.22 0.13 0.09 0.08 0.80 1.00 0.13 0.02 0.08 |
||
| − | 202A 1.00 1.00 0.17 0.14 0.20 0.11 0.35 0.09 0.28 0.19 0.15 0.06 0.14 0.13 0.14 0.14 0.52 0.41 0.25 0.03 0.14 |
||
| − | 203L 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 204D 1.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 205F 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 206I 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 1.00 0.00 0.19 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.27 0.00 0.00 |
||
| − | 207H 1.00 0.08 0.00 0.38 1.00 0.01 0.06 0.28 0.01 0.09 0.02 0.01 0.16 0.04 0.35 0.03 0.06 0.04 0.02 0.00 0.01 |
||
| − | 208H 1.00 0.32 0.08 0.11 0.28 0.31 0.22 0.36 0.21 1.00 0.57 0.13 0.24 0.17 0.40 0.85 0.26 0.28 0.27 0.09 0.47 |
||
| − | 209F 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 210N 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 211E 1.00 0.06 0.00 0.23 1.00 0.01 0.04 0.02 0.01 0.06 0.02 0.01 0.14 0.03 0.78 0.03 0.11 0.03 0.02 0.00 0.01 |
||
| − | 212G 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 213K 1.00 0.77 0.08 0.51 0.92 0.09 0.32 0.14 0.33 1.00 0.39 0.17 0.42 0.27 0.54 0.58 0.63 0.67 0.63 0.03 0.09 |
||
| − | 214E 1.00 0.25 0.01 0.35 1.00 0.02 0.09 0.04 0.06 0.21 0.13 0.03 0.10 0.09 0.19 0.09 0.15 0.13 0.16 0.01 0.03 |
||
| − | 215F 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.11 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.01 0.04 |
||
| − | 216P 1.00 0.11 0.02 0.07 0.04 0.01 0.09 0.02 0.02 0.05 0.10 0.01 0.19 1.00 0.03 0.04 0.17 0.11 0.03 0.01 0.02 |
||
| − | 217P 1.00 1.00 0.02 0.03 0.04 0.01 0.12 0.01 0.01 0.22 0.03 0.01 0.03 0.92 0.03 0.03 0.39 0.07 0.04 0.00 0.01 |
||
| − | 218C 1.00 0.70 0.46 0.21 0.27 1.00 0.38 0.18 0.37 0.21 0.69 0.19 0.23 0.21 0.17 0.18 0.42 0.33 0.51 0.19 0.78 |
||
| − | 219A 1.00 0.43 0.05 0.22 0.56 0.04 0.14 0.05 0.16 0.28 0.14 0.05 0.21 0.14 0.19 0.16 0.58 1.00 0.21 0.01 0.04 |
||
| − | 220I 1.00 0.25 0.03 0.01 0.02 0.04 0.01 0.01 1.00 0.02 0.47 0.40 0.01 0.03 0.02 0.02 0.02 0.21 0.80 0.01 0.01 |
||
| − | 221E 1.00 0.03 0.00 0.39 1.00 0.00 0.02 0.01 0.00 0.03 0.01 0.00 0.10 0.02 0.03 0.01 0.02 0.01 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 222V 1.00 0.30 0.01 0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 0.17 0.01 0.06 0.02 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 1.00 0.00 0.00 |
||
| − | 223Y 1.00 0.03 0.01 0.01 0.02 0.49 0.02 0.23 0.02 0.02 0.04 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.01 1.00 |
||
| − | 224K 1.00 0.06 0.01 0.21 0.11 0.01 0.04 0.04 0.02 1.00 0.05 0.02 0.06 0.04 0.34 0.95 0.06 0.06 0.03 0.01 0.02 |
||
| − | 225I 1.00 0.17 0.04 0.02 0.03 0.07 0.02 0.01 0.88 0.04 0.37 0.08 0.09 0.08 0.02 0.03 0.04 0.13 1.00 0.01 0.03 |
||
| − | pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y |
||
| − | 226I 1.00 0.12 0.03 0.02 0.04 0.08 0.02 0.04 0.47 0.04 1.00 0.27 0.03 0.03 0.11 0.03 0.10 0.16 0.37 0.02 0.06 |
||
| − | 227E 1.00 0.27 0.04 0.91 1.00 0.10 0.53 0.26 0.06 0.30 0.11 0.04 0.68 0.17 0.28 0.15 0.38 0.20 0.09 0.03 0.19 |
||
| − | 228K 1.00 0.23 0.02 0.15 0.30 0.03 0.13 0.09 0.07 1.00 0.13 0.04 0.22 0.11 0.27 0.68 0.33 0.20 0.23 0.01 0.04 |
||
| − | 229V 1.00 0.20 0.01 0.00 0.01 0.01 0.00 0.00 0.21 0.01 0.06 0.12 0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 0.04 1.00 0.00 0.00 |
||
| − | 230D 1.00 0.09 0.00 1.00 0.05 0.00 0.03 0.01 0.00 0.02 0.01 0.00 0.03 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 231Y 1.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.89 0.00 0.00 0.01 0.00 0.03 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.03 1.00 |
||
| − | 232P 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 233R 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 234D 1.00 0.06 0.01 0.76 0.08 0.01 0.29 0.06 0.01 0.08 0.01 0.00 1.00 0.04 0.05 0.04 0.15 0.39 0.01 0.01 0.03 |
||
| − | 235E 1.00 0.60 0.03 0.47 1.00 0.04 0.22 0.09 0.11 0.79 0.17 0.06 0.27 0.19 0.39 0.35 0.41 0.47 0.17 0.01 0.04 |
||
| − | 236N 1.00 0.23 0.02 1.00 0.16 0.01 0.19 0.06 0.02 0.22 0.03 0.01 0.94 0.06 0.09 0.07 0.33 0.10 0.03 0.01 0.03 |
||
| − | 237G 1.00 0.01 0.00 0.10 0.01 0.00 1.00 0.01 0.00 0.01 0.00 0.00 0.15 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.00 0.00 0.01 |
||
| − | 238E 1.00 0.12 0.01 0.86 1.00 0.02 0.22 0.26 0.02 0.15 0.03 0.01 0.59 0.08 0.14 0.06 0.18 0.09 0.03 0.01 0.04 |
||
| − | 239I 1.00 0.02 0.10 0.00 0.01 0.03 0.00 0.00 1.00 0.01 0.57 0.10 0.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.02 0.33 0.00 0.01 |
||
| − | 240A 1.00 0.97 0.13 0.61 1.00 0.11 0.39 0.16 0.38 0.90 0.36 0.13 0.51 0.30 0.62 0.52 0.88 0.87 0.39 0.03 0.12 |
||
| − | 241A 0.94 1.00 0.01 0.01 0.01 0.00 0.28 0.00 0.00 0.01 0.01 0.00 0.01 0.02 0.01 0.01 0.04 0.01 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 242I 0.94 0.09 0.02 0.01 0.02 0.20 0.02 0.01 1.00 0.03 0.60 0.59 0.02 0.02 0.02 0.02 0.03 0.38 0.91 0.01 0.04 |
||
| − | 243I 0.94 0.01 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 1.00 0.00 0.04 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.59 0.00 0.00 |
||
| − | 244H 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 245P 0.94 0.04 0.01 0.07 0.04 0.01 0.05 0.02 0.01 0.04 0.01 0.00 0.16 1.00 0.09 0.02 0.35 0.07 0.01 0.00 0.01 |
||
| − | 246N 0.94 0.70 0.05 0.53 1.00 0.04 0.32 0.14 0.16 0.82 0.26 0.09 0.66 0.23 0.60 0.49 0.65 0.48 0.24 0.02 0.04 |
||
| − | 247L 0.94 0.01 0.00 0.00 0.00 0.12 0.00 0.00 0.03 0.00 1.00 0.02 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 0.00 0.01 |
||
| − | 248Q 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 249D 0.94 0.04 0.01 1.00 0.08 0.13 0.07 0.02 0.01 0.03 0.03 0.01 0.09 0.03 0.03 0.02 0.05 0.03 0.02 0.01 0.04 |
||
| − | 250Q 0.94 0.15 0.08 0.05 0.20 0.04 0.10 0.18 0.06 1.00 0.14 0.05 0.14 0.11 0.45 0.76 0.13 0.15 0.09 0.02 0.08 |
||
| − | pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y |
||
| − | 251D 0.94 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 252W 0.94 0.01 0.00 0.00 0.00 0.44 0.00 0.00 0.01 0.00 0.03 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 1.00 0.31 |
||
| − | 253K 0.94 0.56 0.04 0.46 0.97 0.06 0.29 0.18 0.15 1.00 0.33 0.09 0.37 0.22 0.60 0.53 0.53 0.49 0.22 0.02 0.07 |
||
| − | 254P 0.94 0.02 0.00 0.03 0.11 0.00 0.02 0.00 0.00 0.02 0.01 0.00 0.01 1.00 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 255L 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 256H 0.94 0.15 0.01 0.08 0.20 0.02 0.09 0.25 0.05 1.00 0.10 0.03 0.38 0.08 0.43 0.63 0.13 0.19 0.07 0.01 0.04 |
||
| − | 257P 0.94 0.04 0.01 0.06 0.04 0.01 0.05 0.02 0.01 0.09 0.02 0.01 0.19 1.00 0.04 0.13 0.05 0.03 0.01 0.00 0.01 |
||
| − | 258G 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 259D 0.94 0.12 0.00 1.00 0.31 0.00 0.01 0.01 0.00 0.03 0.01 0.00 0.02 0.02 0.04 0.01 0.02 0.01 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 260P 0.94 0.03 0.00 0.04 0.02 0.00 0.04 0.01 0.00 0.02 0.01 0.00 0.15 1.00 0.01 0.01 0.04 0.02 0.01 0.00 0.01 |
||
| − | 261M 0.94 0.06 0.02 0.01 0.01 0.08 0.01 0.01 1.00 0.02 0.51 0.61 0.01 0.02 0.09 0.01 0.02 0.05 0.54 0.01 0.02 |
||
| − | 262F 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 263L 0.94 0.39 0.07 0.10 0.28 0.19 0.13 0.14 0.48 0.82 1.00 0.23 0.17 0.16 0.39 0.65 0.20 0.31 0.63 0.04 0.12 |
||
| − | 264T 0.94 0.30 0.06 0.14 0.19 0.10 0.12 0.09 0.14 0.28 0.28 0.11 0.20 0.13 0.17 0.27 0.61 1.00 0.20 0.03 0.12 |
||
| − | 265L 0.94 0.03 0.01 0.00 0.01 0.63 0.01 0.01 0.13 0.01 1.00 0.08 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.07 0.02 0.07 |
||
| − | 266D 0.94 0.06 0.01 1.00 0.20 0.01 0.09 0.03 0.01 0.23 0.02 0.01 0.34 0.03 0.06 0.04 0.43 0.05 0.02 0.00 0.01 |
||
| − | 267G 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 268K 0.94 0.07 0.00 0.21 1.00 0.01 0.03 0.02 0.01 0.49 0.02 0.01 0.04 0.03 0.07 0.22 0.05 0.04 0.02 0.00 0.01 |
||
| − | 269T 0.94 0.55 0.10 0.14 0.21 0.10 0.08 0.07 0.50 0.20 0.39 0.12 0.13 0.15 0.15 0.13 0.26 0.51 1.00 0.02 0.09 |
||
| − | 270I 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 1.00 0.00 0.12 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.23 0.00 0.00 |
||
| − | 271P 0.94 0.78 0.20 0.34 0.49 0.70 0.46 0.57 0.44 0.56 0.74 0.25 0.42 0.30 0.43 0.52 0.62 0.55 0.58 0.19 1.00 |
||
| − | 272L 0.94 0.01 0.00 0.00 0.00 0.18 0.00 0.00 0.01 0.00 0.18 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.03 1.00 |
||
| − | 273G 0.94 0.28 0.02 0.41 1.00 0.02 0.31 0.06 0.06 0.39 0.10 0.04 0.37 0.12 0.43 0.18 0.28 0.21 0.10 0.01 0.02 |
||
| − | 274G 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 275D 0.94 0.15 0.00 1.00 0.60 0.01 0.05 0.02 0.01 0.08 0.02 0.01 0.13 0.17 0.09 0.03 0.06 0.04 0.02 0.00 0.01 |
||
| − | pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y |
||
| − | 276C 0.94 0.55 0.10 0.88 0.45 0.07 0.73 0.21 0.08 0.48 0.14 0.05 1.00 0.24 0.29 0.27 0.77 0.44 0.14 0.03 0.13 |
||
| − | 277T 0.94 0.36 0.07 0.02 0.06 0.07 0.01 0.02 0.64 0.07 0.46 0.10 0.04 0.08 0.12 0.04 0.07 0.99 1.00 0.01 0.03 |
||
| − | 278V 0.94 0.08 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.34 0.00 0.04 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.02 1.00 0.00 0.00 |
||
| − | 279Y 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 |
||
| − | 280P 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 281V 0.94 0.42 0.04 0.01 0.03 0.03 0.00 0.01 0.23 0.03 0.23 0.05 0.02 0.05 0.03 0.02 0.04 0.50 1.00 0.00 0.01 |
||
| − | 282F 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 283V 0.94 0.01 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 1.00 0.00 0.03 0.01 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.38 0.00 0.00 |
||
| − | 284N 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 285E 0.94 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 286A 0.94 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.09 0.01 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 287A 0.94 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.03 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.00 0.01 0.00 0.00 0.12 0.01 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 288Y 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 |
||
| − | 289Y 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 |
||
| − | 290E 0.94 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 291K 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 292K 0.94 0.23 0.02 0.16 0.31 0.04 0.26 0.15 0.08 1.00 0.15 0.05 0.25 0.13 0.39 0.68 0.22 0.21 0.11 0.02 0.06 |
||
| − | 293E 0.94 0.44 0.08 0.15 0.32 0.08 0.05 0.05 0.58 0.18 0.39 0.11 0.08 0.12 0.16 0.11 0.13 0.32 1.00 0.02 0.05 |
||
| − | 294A 0.94 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 295F 0.94 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | 296A 0.94 0.37 0.07 0.03 0.06 0.09 0.02 0.04 0.63 0.06 0.42 0.10 0.04 0.07 0.05 0.04 0.07 0.25 1.00 0.07 0.06 |
||
| − | 297K 0.94 0.76 0.07 0.42 0.71 0.06 0.28 0.12 0.25 1.00 0.31 0.11 0.36 0.24 0.50 0.52 0.58 0.65 0.48 0.02 0.06 |
||
| − | 298T 0.94 0.03 0.01 0.01 0.01 0.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.01 0.12 0.02 0.01 0.01 0.01 0.31 1.00 0.01 0.00 0.00 |
||
| − | 299T 0.94 0.63 0.07 0.52 1.00 0.05 0.32 0.11 0.18 0.82 0.28 0.09 0.41 0.23 0.56 0.49 0.61 0.54 0.24 0.02 0.05 |
||
| − | 300K 0.94 0.01 0.00 0.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.00 1.00 0.01 0.00 0.01 0.01 0.02 0.20 0.01 0.01 0.00 0.00 0.00 |
||
| − | pos A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y |
||
| − | 301L 0.89 0.30 0.09 0.10 0.14 0.37 0.14 0.19 0.91 0.15 1.00 0.24 0.13 0.10 0.14 0.15 0.18 0.23 0.90 0.08 0.35 |
||
| − | 302T 0.89 0.76 0.06 0.59 1.00 0.08 0.38 0.17 0.21 0.97 0.32 0.11 0.48 0.27 0.59 0.60 0.71 0.67 0.30 0.03 0.09 |
||
| − | 303L 0.89 0.02 0.08 0.00 0.01 0.13 0.00 0.00 0.19 0.01 1.00 0.04 0.00 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.17 0.00 0.01 |
||
| − | 304N 0.89 0.48 0.18 0.19 0.24 0.38 0.20 0.24 0.23 0.26 0.33 0.12 0.53 0.17 0.21 0.22 0.84 1.00 0.44 0.08 0.41 |
||
| − | 305A 0.89 1.00 0.03 0.01 0.02 0.01 0.05 0.01 0.10 0.02 0.08 0.02 0.01 0.04 0.02 0.01 0.06 0.08 0.72 0.00 0.01 |
||
| − | 306K 0.89 0.52 0.04 0.53 0.69 0.04 0.43 0.12 0.13 1.00 0.21 0.07 0.72 0.83 0.61 0.40 0.71 0.41 0.19 0.02 0.05 |
||
| − | 307S 0.89 1.00 0.04 0.39 0.70 0.06 0.33 0.23 0.12 0.54 0.20 0.07 0.32 0.18 0.35 0.31 0.67 0.64 0.19 0.02 0.07 |
||
| − | 308I 0.89 0.02 0.01 0.00 0.01 0.06 0.00 0.00 0.84 0.01 1.00 0.19 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.09 0.01 0.01 |
||
| − | 309R 0.72 0.02 0.00 0.01 0.03 0.00 0.02 0.02 0.01 0.39 0.02 0.01 0.02 0.02 0.41 1.00 0.02 0.02 0.01 0.00 0.01 |
||
| − | 310C 0.56 1.00 0.17 0.50 0.79 0.39 0.44 0.34 0.54 0.79 0.67 0.22 0.49 0.34 0.54 0.54 0.79 0.80 0.89 0.10 0.50 |
||
| − | 311C 0.39 0.29 0.12 0.12 0.13 0.07 0.10 0.06 0.21 0.15 0.14 0.05 0.17 0.12 0.11 0.10 0.73 1.00 0.23 0.02 0.08 |
||
| − | 312L 0.28 0.05 0.01 0.01 0.01 0.06 0.01 0.01 0.21 0.02 1.00 0.07 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.04 0.38 0.01 0.02 |
||
| − | 313H 0.22 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 |
||
Revision as of 16:49, 13 June 2012
Blossum62
# Matrix made by matblas from blosum62.iij # * column uses minimum score # BLOSUM Clustered Scoring Matrix in 1/2 Bit Units # Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat # Cluster Percentage: >= 62 # Entropy = 0.6979, Expected = -0.5209 A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X * A 4 -1 -2 -2 0 -1 -1 0 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 0 -3 -2 0 -2 -1 0 -4 R -1 5 0 -2 -3 1 0 -2 0 -3 -2 2 -1 -3 -2 -1 -1 -3 -2 -3 -1 0 -1 -4 N -2 0 6 1 -3 0 0 0 1 -3 -3 0 -2 -3 -2 1 0 -4 -2 -3 3 0 -1 -4 D -2 -2 1 6 -3 0 2 -1 -1 -3 -4 -1 -3 -3 -1 0 -1 -4 -3 -3 4 1 -1 -4 C 0 -3 -3 -3 9 -3 -4 -3 -3 -1 -1 -3 -1 -2 -3 -1 -1 -2 -2 -1 -3 -3 -2 -4 Q -1 1 0 0 -3 5 2 -2 0 -3 -2 1 0 -3 -1 0 -1 -2 -1 -2 0 3 -1 -4 E -1 0 0 2 -4 2 5 -2 0 -3 -3 1 -2 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 1 4 -1 -4 G 0 -2 0 -1 -3 -2 -2 6 -2 -4 -4 -2 -3 -3 -2 0 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -1 -4 H -2 0 1 -1 -3 0 0 -2 8 -3 -3 -1 -2 -1 -2 -1 -2 -2 2 -3 0 0 -1 -4 I -1 -3 -3 -3 -1 -3 -3 -4 -3 4 2 -3 1 0 -3 -2 -1 -3 -1 3 -3 -3 -1 -4 L -1 -2 -3 -4 -1 -2 -3 -4 -3 2 4 -2 2 0 -3 -2 -1 -2 -1 1 -4 -3 -1 -4 K -1 2 0 -1 -3 1 1 -2 -1 -3 -2 5 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 0 1 -1 -4 M -1 -1 -2 -3 -1 0 -2 -3 -2 1 2 -1 5 0 -2 -1 -1 -1 -1 1 -3 -1 -1 -4 F -2 -3 -3 -3 -2 -3 -3 -3 -1 0 0 -3 0 6 -4 -2 -2 1 3 -1 -3 -3 -1 -4 P -1 -2 -2 -1 -3 -1 -1 -2 -2 -3 -3 -1 -2 -4 7 -1 -1 -4 -3 -2 -2 -1 -2 -4 S 1 -1 1 0 -1 0 0 0 -1 -2 -2 0 -1 -2 -1 4 1 -3 -2 -2 0 0 0 -4 T 0 -1 0 -1 -1 -1 -1 -2 -2 -1 -1 -1 -1 -2 -1 1 5 -2 -2 0 -1 -1 0 -4 W -3 -3 -4 -4 -2 -2 -3 -2 -2 -3 -2 -3 -1 1 -4 -3 -2 11 2 -3 -4 -3 -2 -4 Y -2 -2 -2 -3 -2 -1 -2 -3 2 -1 -1 -2 -1 3 -3 -2 -2 2 7 -1 -3 -2 -1 -4 V 0 -3 -3 -3 -1 -2 -2 -3 -3 3 1 -2 1 -1 -2 -2 0 -3 -1 4 -3 -2 -1 -4 B -2 -1 3 4 -3 0 1 -1 0 -3 -4 0 -3 -3 -2 0 -1 -4 -3 -3 4 1 -1 -4 Z -1 0 0 1 -3 3 4 -2 0 -3 -3 1 -1 -3 -1 0 -1 -3 -2 -2 1 4 -1 -4 X 0 -1 -1 -1 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -2 0 0 -2 -1 -1 -1 -1 -1 -4 * -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 -4 1
PAM1
1 PAM evolutionary distance
Ala Arg Asn Asp Cys Gln Glu Gly His Ile Leu Lys Met Phe Pro Ser Thr Trp Tyr Val
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V
Ala A 9867 2 9 10 3 8 17 21 2 6 4 2 6 2 22 35 32 0 2 18
Arg R 1 9913 1 0 1 10 0 0 10 3 1 19 4 1 4 6 1 8 0 1
Asn N 4 1 9822 36 0 4 6 6 21 3 1 13 0 1 2 20 9 1 4 1
Asp D 6 0 42 9859 0 6 53 6 4 1 0 3 0 0 1 5 3 0 0 1
Cys C 1 1 0 0 9973 0 0 0 1 1 0 0 0 0 1 5 1 0 3 2
Gln Q 3 9 4 5 0 9876 27 1 23 1 3 6 4 0 6 2 2 0 0 1
Glu E 10 0 7 56 0 35 9865 4 2 3 1 4 1 0 3 4 2 0 1 2
Gly G 21 1 12 11 1 3 7 9935 1 0 1 2 1 1 3 21 3 0 0 5
His H 1 8 18 3 1 20 1 0 9912 0 1 1 0 2 3 1 1 1 4 1
Ile I 2 2 3 1 2 1 2 0 0 9872 9 2 12 7 0 1 7 0 1 33
Leu L 3 1 3 0 0 6 1 1 4 22 9947 2 45 13 3 1 3 4 2 15
Lys K 2 37 25 6 0 12 7 2 2 4 1 9926 20 0 3 8 11 0 1 1
Met M 1 1 0 0 0 2 0 0 0 5 8 4 9874 1 0 1 2 0 0 4
Phe F 1 1 1 0 0 0 0 1 2 8 6 0 4 9946 0 2 1 3 28 0
Pro P 13 5 2 1 1 8 3 2 5 1 2 2 1 1 9926 12 4 0 0 2
Ser S 28 11 34 7 11 4 6 16 2 2 1 7 4 3 17 9840 38 5 2 2
Thr T 22 2 13 4 1 3 2 2 1 11 2 8 6 1 5 32 9871 0 2 9
Trp W 0 2 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 9976 1 0
Tyr Y 1 0 3 0 3 0 1 0 4 1 1 0 0 21 0 1 1 2 9945 1
Val V 13 2 1 1 3 2 2 3 3 57 11 1 17 1 3 2 10 0 2 9901
Create position specific substitution matrix
blastpgp -d /mnt/project/pracstrucfunc12/data/big/big_80 -i p45381_wt.fa -o psiblast_it2_p45381_wt_big80.out -j 5 -Q pssm.out
