Difference between revisions of "Sequence-based analyses Gaucher Disease"
From Bioinformatikpedia
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== Secondary structure == |
== Secondary structure == |
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| + | === Predictions === |
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P04062: |
P04062: |
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<pre> |
<pre> |
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DSSP ECCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC |
DSSP ECCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC |
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</pre> |
</pre> |
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| + | |||
| + | === Prediction accuracy/precision === |
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| + | {| |
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| + | !rowspan="2" Method !!rowspan="2" Q3 !! Precision |
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| + | |- |
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| + | !H !! E !! C |
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| + | |} |
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Revision as of 09:06, 16 May 2012
Secondary structure
Predictions
P04062:
40
ARPCIPKSFGYSSVVCVCNATYCDSFDPPTFPALGTFSRYESTRSGRRMELSMGPIQANHTGTGLLLTLQPEQKFQKVKG
Reprof CCCCCCCCCCCEEEEEEECCEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEECCCEECCCCCCEEEEEECCCCEEEEEEC
PSIPRED CCCCCCCCCCCCCEEEEECCHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCCHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCEEEEE
DSSP CECCCEEECCCCCEEEEEECCCCCECCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEEEEEECECCCCCCCEEEEEEEEEEEEECCE
120
FGGAMTDAAALNILALSPPAQNLLLKSYFSEEGIGYNIIRVPMASCDFSIRTYTYADTPDDFQLHNFSLPEEDTKLKIPL
Reprof CCCCCCHHHHHEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCEEEE
PSIPRED EEEEHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
DSSP EEEECCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHCCHHHH
200
IHRALQLAQRPVSLLASPWTSPTWLKTNGAVNGKGSLKGQPGDIYHQTWARYFVKFLDAYAEHKLQFWAVTAENEPSAGL
Reprof EEHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCEEEECCCECCCEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEECCCCCCCE
PSIPRED HHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCHHEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCC
DSSP HHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCHHHECCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCHHH
280
LSGYPFQCLGFTPEHQRDFIARDLGPTLANSTHHNVRLLMLDDQRLLLPHWAKVVLTDPEAAKYVHGIAVHWYLDFLAPA
Reprof ECCCCEEEECCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCEECCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEEEEECCCC
PSIPRED CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHCCEEEEECCCCCCCCH
DSSP CCCCCCCCCECCHHHHHHHHHHCHHHHHHCCCCCCCEEEEEEEEHHHCCHHHHHHHCCHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCH
360
KATLGETHRLFPNTMLFASEACVGSKFWEQSVRLGSWDRGMQYSHSIITNLLYHVVGWTDWNLALNPEGGPNWVRNFVDS
Reprof CCECCCCCECCCCCEEEECCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCEEECEHHHHEEEEEEECCCCEEEECCCCCCEEEEECCCC
PSIPRED HHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCC
DSSP HHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCECCCCCCCCCCCCCCC
440
PIIVDITKDTFYKQPMFYHLGHFSKFIPEGSQRVGLVASQKNDLDAVALMHPDGSAVVVVLNRSSKDVPLTIKDPAVGFL
Reprof CEEEEECCCCCCCCCEEEECCCEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCCEEEECCCCEEEE
PSIPRED CEEEECCCCEEEECHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCEEE
DSSP CEEEEHHHCEEEECHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCCCEEEEEEECCCEEE
520
ETISPGYSIHTYLWRRQ
Reprof EEECCCCEEEEEEEECC
PSIPRED EEECCCCEEEEEEEECC
DSSP EEEECCCEEEEEEECCC
P10775:
1
MNLDIHCEQLSDARWTELLPLLQQYEVVRLDDCGLTEEHCKDIGSALRANPSLTELCLRTNELGDAGVHLVLQGLQSPTC
Reprof CCCCECHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCCHEEEHCCCCCCCC
PSIPRED CEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCC
DSSP CECCCECCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEECECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC
81
KIQKLSLQNCSLTEAGCGVLPSTLRSLPTLRELHLSDNPLGDAGLRLLCEGLLDPQCHLEKLQLEYCRLTAASCEPLASV
Reprof EEEEECCCCCCCCHCCCCCCHHHHCHCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCHCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
PSIPRED CCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHH
DSSP CCCEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHH
161
LRATRALKELTVSNNDIGEAGARVLGQGLADSACQLETLRLENCGLTPANCKDLCGIVASQASLRELDLGSNGLGDAGIA
Reprof HHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCHCCHHHCCCCCCCCCHHHHH
PSIPRED HHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCHHHHH
DSSP HHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHH
241
ELCPGLLSPASRLKTLWLWECDITASGCRDLCRVLQAKETLKELSLAGNKLGDEGARLLCESLLQPGCQLESLWVKSCSL
Reprof HHCCCCCCCHHHHCHHEEEHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCHH
PSIPRED HHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCC
DSSP HHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCC
321
TAACCQHVSLMLTQNKHLLELQLSSNKLGDSGIQELCQALSQPGTTLRVLCLGDCEVTNSGCSSLASLLLANRSLRELDL
Reprof HHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHCC
PSIPRED CHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEC
DSSP EHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCECHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCEHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEC
401
SNNCVGDPGVLQLLGSLEQPGCALEQLVLYDTYWTEEVEDRLQALEGSKPGLRVIS
Reprof CCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCECC
PSIPRED CCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEECC
DSSP CCCECCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEC
Q9X0E6:
2
ILVYSTFPNEEKALEIGRKLLEKRLIACFNAFEIRSGYWWKGEIVQDKEWAAIFKTTEEKEKELYEELRKLHPYETPAIF
Reprof EEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHCHHHCCCEEECEEECCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHE
PSIPRED EEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
DSSP EEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEEEECCEEEEEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE
82
TLKVENVLTEYMNWLRESVL
Reprof HHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PSIPRED EEECCCCCHHHHHHHHHHCC
DSSP EECCCCEEHHHHHHHHHHCC
Q08209:
14
TDRVVKAVPFPPSHRLTAKEVFDNDGKPRVDILKAHLMKEGRLEESVALRIITEGASILRQEKNLLDIDAPVTVCGDIHG
Reprof CCCEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCCCCEEEEEHHHECCCCCCCEEEEEEEEECCCCEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCC
PSIPRED CCCCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCEEEECCCCC
DSSP CCCCCCCCCCCCCCCECHHHHECCCCCECHHHHHHHHHCCCCECHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEEECCCCC
94
QFFDLMKLFEVGGSPANTRYLFLGDYVDRGYFSIECVLYLWALKILYPKTLFLLRGNHECRHLTEYFTFKQECKIKYSER
Reprof HHHHHHEEEEECCCCCCCEEEEEEEECCCCEEEEEEEHHHHHHHCCCCCEEEEEECCCCCCEEEEEEEEEEEEEEEEECH
PSIPRED HHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCHH
DSSP CHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHHCCHH
174
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Reprof HHHHHHHHCCCCCHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCECCCCCE
PSIPRED HHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
DSSP HHHHHHHHHCCCCCEEEECCCEEEECCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHCEECCCCCCCCCCCCEEECCC
254
RGCSYFYSYPAVCEFLQHNNLLSILRAHEAQDAGYRMYRKSQTTGFPSLITIFSAPNYLDVYNNKAAVLKYENNVMNIRQ
Reprof CCEEEEECCCCEEEEHCCCCHHHHEHHHCCCCCCEEEEEECCCCCCCEEEEEEECCCEEEEECCCEEEEEECCCEEEEEE
PSIPRED CCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEE
DSSP CCCCEEECHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCEEECCECCCCCCECEEEECCCCCHHHCCCCCEEEEEEECCEEEEEE
334
FNCSPHPYWLPNFMDVFTWSLPFVGEKVTEMLVNVLNICSSFEEAKGLDRINERMPPR
Reprof ECCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHEECCEHHHHCCCCHHCCCCCCC
PSIPRED ECCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC
DSSP ECCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCC
Prediction accuracy/precision
| rowspan="2" Method | rowspan="2" Q3 | Precision |
|---|---|---|
| H | E | C |
