Homology-modelling HEXA/swissmodel ali

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Alignment of HEXA_HUMAN and 3BC9:

CLUSTAL 2.1 multiple sequence alignment


sp|P06865|HEXA_HUMAN             --------------------------MTSSRLWFSLLLAAAFAGRATALW 24
3BC9_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      GCSNISEDVNNPNRSLFLIESEPSTGASVSKNLTEIILIFSNDINKVSQL 50
                                                            : *:   .::*  :   . .:   

sp|P06865|HEXA_HUMAN             PWPQNFQTSDQRYVLYPNNFQFQYDVSSAAQPGCS---------VLDEAF 65
3BC9_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      ALTDLITDSDIQGIDYNIEGNKVIINNFSLEPTCNYRLSYEVIDIYDNHL 100
                                 . .: :  ** : : *  : :     . : :* *.         : *: :  

sp|P06865|HEXA_HUMAN             QRYRDLLFGSGSWPRPYLTGKRHTLEKNVLVVSVVTPGCNQLPTLESVEN 115
3BC9_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      QGYIEFLVNQSNYPQIPDQEVNHTILQAFYWEMNTGEYATEHPEEANLWN 150
                                 * * ::*.....:*:      .**: : .     .   ..: *   .: * 

sp|P06865|HEXA_HUMAN             YTLTINDDQCLLLSETVWG--ALRGLETFSQLVWKS----AEGTFFIN-- 157
3BC9_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      LLAERAPELAEAGFTAVWLPPANKGMAGIHDVGYGTYDLWDLGEFDQKGT 200
                                        : .     :**   * :*:  : :: : :      * *  :  

sp|P06865|HEXA_HUMAN             -KTEIEDFPRFPHRGLLLDTSRHYLPLSSILDTLDVMAYNKLNVFHWHLV 206
3BC9_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      VRTKYGTKGELENAIDALHNNDIKVYFDAVLNHRMGADYAETVLLDENSR 250
                                  :*:     .: :    *...   : :.::*:      * :  ::. :   

sp|P06865|HEXA_HUMAN             DDPSFPYESFT-FPELMRKGSYNPVTHIYTAQDVKEVIEYARLRGIRVLA 255
3BC9_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      DKPGQYIKAWTGFNFPGRNGEYSNFTWNGQCFDGTDWDDYSKESGKYLFD 300
                                 *.*.   :::* *    *:*.*. .*    . * .:  :*::  *  :: 

sp|P06865|HEXA_HUMAN             EFDTPGHTLSWGPGIPGLLTPCYSGSEPSGTFGPVNPSLNNTYEFMSTFF 305
3BC9_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      E-KSWDWTYNWDEDYLMGADVDYENEAVQNDVIDWGQWIINNIDFDG-FR 348
                                 * .: . * .*. .        *...  .. .   .  : *. :* . * 

sp|P06865|HEXA_HUMAN             LEVSSVFPDFYLHLGGDEVDFTCWK-----SNPEIQDFMRKKGFGEDFK- 349
3BC9_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      LDAVKHIDYRFIDKWMSAVQNSSNRDVFFVGEAWVEDVDDLKGFLDTVGN 398
                                 *:. . :   ::.   . *: :. :     .:. ::*.   *** : .  

sp|P06865|HEXA_HUMAN             ----------------QLESFYIQTLLDIVSSYGKGYVVWQEVFDNKVKI 383
3BC9_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      PDLRVFDFPLRSFFVDMLNGAYMADLRNAGLVNSPGYENRAVTFVDNHDT 448
                                                  *:. *:  * :     . **     .* :: . 

sp|P06865|HEXA_HUMAN             QPDTIIQVWREDIPVNYMKELELVTKAGFRALLSAPWYLNRISYGPDWKD 433
3BC9_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      DRDEGSYTVSIYSRKYQAYAYILTRAEGVPTVYWKDYYIWEMKEGLD-KL 497
                                 : *    .              *.   *. ::    :*: .:. * * * 

sp|P06865|HEXA_HUMAN             FYIVEPLAFEGTPEQKALVIGGEACMWGEYVDNTNLVPRLWPRAGAVAER 483
3BC9_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      LTARRYYAYGPGYEVDNNDADIYSYVRSGFPDVAGDGLVLMISDGTSGNV 547
                                 :   .  *:    * .    .  : : . : * :.    *    *: .: 

sp|P06865|HEXA_HUMAN             LWSNKLTSDLTFAYERLSHFRCELLRRGVQAQPLNVGFCEQEFEQT---- 529
3BC9_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      AGKINSRQPDTEFYDLTGHIKEHVTTDSEGYGNFKVIKSEDKGWSIWVPV 597
                                   . :  .  *  *:  .*:: .:   .     ::*  .*::  .     

sp|P06865|HEXA_HUMAN             -
3BC9_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      E 598

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Alignment of HEXA_HUMAN and 3CUI:

CLUSTAL 2.1 multiple sequence alignment 


sp|P06865|HEXA_HUMAN             MTSSRLWFSLLLAAAFAGRATALWPWPQNFQTSDQRYVLYPNNFQFQYDV 50
3CUI_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      --------ATTLKEAADG------------AGRDFGFALDPN-------- 22
                                         :  *  *  *               *  :.* **        

sp|P06865|HEXA_HUMAN             SSAAQPGCSVLDEAFQRYRDLLFGSGSWPRPYLTGKRHTLEKNVLVVSVV 100
3CUI_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      --------RLSEAQYKAIADSEFN-------------LVVAENAMKWDAT 51
                                          : :  ::   *  *.              .: :*.:  ...

sp|P06865|HEXA_HUMAN             TPGCNQLPTLESVENYTLTINDDQCLLLSETVWGALRGLETFSQLVWKSA 150
3CUI_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      EPSQNSFS------------------------FGAGDRVASYAADTGKEL 77
                                  *. *.:.                        :**   : :::  . *. 

sp|P06865|HEXA_HUMAN             EGTFFINKTEIEDFPRFPHRGLLLDTSRHYLPLSSILDTLDVMAYNKLNV 200
3CUI_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      YGHTLVWHSQLPDWAKN----------------------LNGSAFESAMV 105
                                 *  :: :::: *:.:                       *:  *::.  *

sp|P06865|HEXA_HUMAN             FHWHLVDDPSFPYESFTFPELMRKGSYNPVTHIYTAQDVKEVIEYARLRG 250
3CUI_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      NHVTKVAD------------------------------------------ 113
                                  *   * *                                          

sp|P06865|HEXA_HUMAN             IRVLAEFDTPGHTLSWGPGIPGLLTPCYSGSEPSGTFGPVNPSLNNTYEF 300
3CUI_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      -------HFEGKVASWD-----VVNEAFADGGGRRQDSAFQQKLGN--GY 149
                                        .  *:. **.     ::. .::..      ...: .*.*   : 

sp|P06865|HEXA_HUMAN             MSTFFLEVSSVFPDFYLHLGGDEVDFTCWKSNPEIQDFMRKKGFGEDFKQ 350
3CUI_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      IETAFRAARAADPTAKLCINDYNVEGINAKSNS-LYDLVKD--FKARGVP 196
                                 :.* *  . :. *   * :.. :*:    ***. : *:::.  *       

sp|P06865|HEXA_HUMAN             LESFYIQTLLDIVSSYGKGYVVWQEVFDNKVKIQPDTIIQVWREDIPVNY 400
3CUI_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      LDCVGFQSHLIVGQVPGDFRQNLQRFADLGVDVR---------------- 230
                                 *:.. :*: * : .  *.     *.. *  *.::                

sp|P06865|HEXA_HUMAN             MKELELVTKAGFRALLSAPWYLNRISYGPDWKDFYIVEPLAFEGTPEQKA 450
3CUI_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      ITELDIRMRTPS----------DATKLATQAADYKKVVQACMQVTRCQGV 270
                                 :.**::  ::            :  . ..:  *:  *   .:: *  * .

sp|P06865|HEXA_HUMAN             LVIGGEACMWGEYVDNTNLVPRLWPRAGAVAERLWSNKLTSDLTFAYERL 500
3CUI_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      TVWG--------ITDKYSWVPDVFP--GEGAALVWD--------ASYAKK 302
                                  * *         .*: . ** ::*  *  *  :*.         :* : 

sp|P06865|HEXA_HUMAN             SHFRCELLRRGVQAQPLNVGFCEQEFEQT 529
3CUI_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      PAYAAVMEAFGAS---------------- 315
                                 . : . :   *..                

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Alignment of HEXA_HUMAN and 3HN3:

CLUSTAL 2.1 multiple sequence alignment


sp|P06865|HEXA_HUMAN             -MTSSRLWFSLLLAAAFAGRATALWPWPQNFQTSDQRYVLYPNNFQFQYD 49
3HN3_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      LGLQGGMLYPQESPSRECKELDGLWSFRADFSDNRRRGFEEQWYRRPLWE 50
                                    .. : :.   .:  . .  .**.:  :*. . :* .      :  :: 

sp|P06865|HEXA_HUMAN             VS-SAAQPGCSVLDEAFQRYRDLLFGSGSWPR-PYLTGKRHTLEKNVLVV 97
3HN3_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      SGPTVDMPVPSSFNDISQDWRLRHFVGWVWYEREVILPERWTQDLRTRVV 100
                                  . :.  *  * :::  * :*   * .  * .   :  :* * : .. **

sp|P06865|HEXA_HUMAN             SVVTPG-------CNQLPTLESVENYTLTINDDQCLLLSETVWGALRGLE 140
3HN3_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      LRIGSAHSYAIVWVNGVDTLEHEGGYLPFEADISNLVQVGPLPSRLRITI 150
                                   : ..        * : ***   .*     * . *:   .: . **   

sp|P06865|HEXA_HUMAN             TFSQLVWKSAEGTFFINKTEIEDFPRFPHRGLLLDTSRHYLPLSSILDTL 190
3HN3_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      AINNTLTPTTLPPGTIQY--LTDTSKYPKGYFVQNTYFDFFNYAGLQR-- 196
                                 ::.: :  ::  .  *:   : * .::*:  :: :*  .::  :.:    

sp|P06865|HEXA_HUMAN             DVMAYNKLNVFHWHLVDDPSFPYESFTFPELMRKGSYNPVTHIYTAQDVK 240
3HN3_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      SVLLYTTPTTYIDDITVTTSVEQDSGLVNYQISVKGSNLFKLEVRLLDAE 246
                                 .*: *.. ..:  .:.  .*.  :*  .   :   . * ..      *.:

sp|P06865|HEXA_HUMAN             EVIEYARLRGIRVLAEFDTPGHTLSWG---PGIPGLLTPCYSGSEPSGTF 287
3HN3_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      NKVVAN---GTGTQGQLKVPGVSLWWPYLMHERPAYLYSLEVQLTAQTSL 293
                                 : :      *  . .::..** :* *       *. * .      .. ::

sp|P06865|HEXA_HUMAN             GPVNPSLNNTYEFMSTFFLEVSSVFP--DFYLH----------------- 318
3HN3_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      GPVSDFYTLPVGIRTVAVTKSQFLINGKPFYFHGVNKHEDADIRGKGFDW 343
                                 ***.   . .  : :. . : . ::    **:*                 

sp|P06865|HEXA_HUMAN             ------------LGGDEVDFTCWKSNPEIQDFMRKK---------GFGED 347
3HN3_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      PLLVKDFNLLRWLGANAFRTSHYPYAEEVMQMCDRYGIVVIDECPGVGLA 393
                                             **.: .  : :    *: ::  :          *.*  

sp|P06865|HEXA_HUMAN             FKQLES-----FYIQTLLDIVSSYG--KGYVVWQEVFDNKVKIQPD--TI 388
3HN3_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      LPQFFNNVSLHHHMQVMEEVVRRDKNHPAVVMWSVANEPASHLESAGYYL 443
                                 : *: .     .::*.: ::*       . *:*. . :   :::.    :

sp|P06865|HEXA_HUMAN             IQVWREDIPVNYMKELELVTKAGFRALLSAPWY--LNRISYGPDWKDFYI 436
3HN3_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      KMVIAHTKSLDPSRPVTFVSNSNYAADKGAPYVDVICLNSYYSWYHDYGH 493
                                   *  .  .::  : : :*:::.: *  .**:   :   ** . ::*:  

sp|P06865|HEXA_HUMAN             VEPLAFEGTPEQK-------ALVIG---GEACMWGEYVDNTNLVPRLWPR 476
3HN3_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      LELIQLQLATQFENWYKKYQKPIIQSEYGAETIAGFHQDPPLMFTEEYQK 543
                                 :* : :: :.: :         :*    *   : * : * . :... : :

sp|P06865|HEXA_HUMAN             AGAVAERLWSN-----KLTSDLTFAYERLSHFRCELLRRG-------VQA 514
3HN3_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      SLLEQYHLGLDQKRRKYVVGELIWNFADFMTEQSPTRVLGNKKGIFTRQR 593
                                 :     :*  :      :..:* : :  :   :.     *        * 

sp|P06865|HEXA_HUMAN             QPLNVGFCEQEFEQT----- 529
3HN3_A|PDBID|CHAIN|SEQUENCE      QPKSAAFLLRERYWKIANET 613
                                 ** ...*  :*   .     


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